Protein–RNA interactions for Protein: Q969G9

NKD1, Protein naked cuticle homolog 1, humanhuman

Predictions only

Length 470 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NKD1Q969G9 CSH1-201ENST00000316193 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
NKD1Q969G9 KLK11-201ENST00000319720 1198 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
NKD1Q969G9 RPL13A-201ENST00000391857 1181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
NKD1Q969G9 AC004945.1-201ENST00000416738 983 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
NKD1Q969G9 AL445430.1-201ENST00000419796 699 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
NKD1Q969G9 AC007731.4-201ENST00000420225 652 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
NKD1Q969G9 LRRC74B-201ENST00000442047 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
NKD1Q969G9 CHIA-209ENST00000483391 1188 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
NKD1Q969G9 RNA5SP486-201ENST00000515961 83 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
NKD1Q969G9 IL32-222ENST00000533097 814 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
NKD1Q969G9 MIR4741-201ENST00000579822 90 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
NKD1Q969G9 FP565260.5-201ENST00000623188 479 ntTSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
NKD1Q969G9 LINC00592-202ENST00000640420 768 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
NKD1Q969G9 IL32-201ENST00000008180 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
NKD1Q969G9 CHAT-203ENST00000351556 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
NKD1Q969G9 ZDHHC13-201ENST00000399351 2283 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
NKD1Q969G9 PPAN-P2RY11-202ENST00000428358 2661 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
NKD1Q969G9 PTPRU-201ENST00000345512 4470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
NKD1Q969G9 VPS16-203ENST00000380469 2318 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
NKD1Q969G9 NCK1-201ENST00000288986 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
NKD1Q969G9 AP000787.1-201ENST00000501356 1926 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
NKD1Q969G9 KRT8P35-201ENST00000483942 1338 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
NKD1Q969G9 POM121-203ENST00000434423 3750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
NKD1Q969G9 MGAT1-201ENST00000307826 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
NKD1Q969G9 CLCNKA-203ENST00000439316 1997 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
NKD1Q969G9 PAX6-276ENST00000640684 1557 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
NKD1Q969G9 SEMA4F-210ENST00000611975 6007 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
NKD1Q969G9 AL355493.2-201ENST00000568270 1395 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
NKD1Q969G9 SHQ1-201ENST00000325599 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
NKD1Q969G9 RIPK1-201ENST00000259808 4160 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
NKD1Q969G9 TBC1D16-209ENST00000576768 6342 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
NKD1Q969G9 ACAD9-201ENST00000308982 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
NKD1Q969G9 GABARAP-201ENST00000302386 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
NKD1Q969G9 DLGAP1-220ENST00000581699 2258 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
NKD1Q969G9 SOX30-202ENST00000311371 2716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
NKD1Q969G9 NFATC4-211ENST00000554344 2955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
NKD1Q969G9 RNASEH1-201ENST00000315212 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
NKD1Q969G9 DDB1-201ENST00000301764 4506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
NKD1Q969G9 PDPK1-202ENST00000342085 7241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
NKD1Q969G9 AC239800.3-201ENST00000424684 5243 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
NKD1Q969G9 TCP11-206ENST00000412155 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
NKD1Q969G9 SGO1-203ENST00000412997 2587 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
NKD1Q969G9 ELF2-201ENST00000358635 3036 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
NKD1Q969G9 LLGL2-201ENST00000167462 3480 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
NKD1Q969G9 PLPPR5-201ENST00000263177 3288 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
NKD1Q969G9 PSEN2-203ENST00000422240 1947 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
NKD1Q969G9 SPAG9-201ENST00000262013 8273 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
NKD1Q969G9 NTMT1-204ENST00000372486 1487 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
NKD1Q969G9 C7orf49-201ENST00000393114 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
NKD1Q969G9 ITGB4-206ENST00000579662 5554 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
NKD1Q969G9 PI16-201ENST00000373674 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
NKD1Q969G9 RALYL-208ENST00000522455 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
NKD1Q969G9 C9orf139-202ENST00000623196 4990 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
NKD1Q969G9 CD79A-201ENST00000221972 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
NKD1Q969G9 ANK1-201ENST00000265709 6379 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
NKD1Q969G9 RPS3-201ENST00000278572 907 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
NKD1Q969G9 AL022323.1-201ENST00000366110 957 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
NKD1Q969G9 TCEAL1-203ENST00000372626 721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
NKD1Q969G9 TREM2-203ENST00000373122 1012 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
NKD1Q969G9 IGLV4-69-201ENST00000390282 419 ntAPPRIS P1 BASIC14.59□□□□□ -0.07
NKD1Q969G9 RBAK-RBAKDN-201ENST00000396904 766 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC14.59□□□□□ -0.07
NKD1Q969G9 RBAK-RBAKDN-202ENST00000407184 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
NKD1Q969G9 MIR1202-201ENST00000408529 83 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
NKD1Q969G9 CALR4P-201ENST00000431943 946 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
NKD1Q969G9 AC007969.1-201ENST00000433675 447 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
NKD1Q969G9 AL591846.1-201ENST00000451736 433 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
NKD1Q969G9 MLF1-206ENST00000471745 1266 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
NKD1Q969G9 FHIT-208ENST00000492590 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
NKD1Q969G9 COX14-203ENST00000550487 739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
NKD1Q969G9 AC120498.1-201ENST00000563593 476 ntTSL 4 BASIC14.59□□□□□ -0.07
NKD1Q969G9 IRF3-223ENST00000599223 1055 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
NKD1Q969G9 BX539320.1-201ENST00000623759 877 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
NKD1Q969G9 SLC5A6-203ENST00000408041 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
NKD1Q969G9 LRRK1-201ENST00000388948 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
NKD1Q969G9 ZNF772-202ENST00000356584 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
NKD1Q969G9 UBE2J1-201ENST00000435041 4290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
NKD1Q969G9 PIKFYVE-204ENST00000407449 1898 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
NKD1Q969G9 MAPKAPK5-207ENST00000551404 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
NKD1Q969G9 NPRL3-211ENST00000611875 2881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
NKD1Q969G9 ANXA8L1-208ENST00000622769 1861 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
NKD1Q969G9 SYBU-209ENST00000446070 2919 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
NKD1Q969G9 MPP1-205ENST00000413259 2195 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.07
NKD1Q969G9 AC011477.6-201ENST00000604980 1927 ntBASIC14.58□□□□□ -0.07
NKD1Q969G9 LARP4-219ENST00000614335 1949 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.07
NKD1Q969G9 SYAP1-201ENST00000380155 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
NKD1Q969G9 SLC25A37-206ENST00000519973 4823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
NKD1Q969G9 EXT1-201ENST00000378204 8270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
NKD1Q969G9 EIF2B4-212ENST00000622434 1771 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
NKD1Q969G9 HNF1A-215ENST00000615446 2344 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
NKD1Q969G9 CCDC85A-201ENST00000407595 3982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
NKD1Q969G9 NDRG2-211ENST00000397858 2054 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
NKD1Q969G9 CBY1-201ENST00000216029 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
NKD1Q969G9 BST2-201ENST00000252593 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
NKD1Q969G9 MIR648-201ENST00000385046 94 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
NKD1Q969G9 NDUFA3-203ENST00000391763 338 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
NKD1Q969G9 RAC2-202ENST00000401529 569 ntTSL 4 BASIC14.58□□□□□ -0.08
NKD1Q969G9 C1orf210-201ENST00000423420 629 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.58□□□□□ -0.08
NKD1Q969G9 AC053503.1-201ENST00000429882 519 ntTSL 3 BASIC14.58□□□□□ -0.08
NKD1Q969G9 ARTN-209ENST00000479128 471 ntTSL 3 BASIC14.58□□□□□ -0.08
NKD1Q969G9 OARD1-212ENST00000482515 832 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.1 ms