Protein–RNA interactions for Protein: Q92696

RABGGTA, Geranylgeranyl transferase type-2 subunit alpha, humanhuman

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Length 567 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGGTAQ92696 STAM-202ENST00000377524 2972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
RABGGTAQ92696 HAUS4P1-201ENST00000406739 1145 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
RABGGTAQ92696 AC007274.1-201ENST00000439805 662 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
RABGGTAQ92696 ZNF707-203ENST00000442058 562 ntTSL 4 BASIC17.1■□□□□ 0.33
RABGGTAQ92696 AC140481.1-201ENST00000448777 706 ntTSL 3 BASIC17.1■□□□□ 0.33
RABGGTAQ92696 AC245100.5-201ENST00000452108 331 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
RABGGTAQ92696 C9orf41-AS1-201ENST00000455609 719 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
RABGGTAQ92696 AL161908.2-201ENST00000457964 394 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
RABGGTAQ92696 TMEM14B-212ENST00000475942 992 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
RABGGTAQ92696 PDCD6-202ENST00000505221 672 ntTSL 3 BASIC17.1■□□□□ 0.33
RABGGTAQ92696 ATG10-207ENST00000513443 978 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
RABGGTAQ92696 TMEM218-210ENST00000529609 734 ntTSL 3 BASIC17.1■□□□□ 0.33
RABGGTAQ92696 AC005342.2-201ENST00000544163 315 ntTSL 3 BASIC17.1■□□□□ 0.33
RABGGTAQ92696 AP3S2-204ENST00000558011 738 ntTSL 3 BASIC17.1■□□□□ 0.33
RABGGTAQ92696 AC093726.1-201ENST00000608064 963 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
RABGGTAQ92696 CCL4L2-214ENST00000617416 1258 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
RABGGTAQ92696 SLC24A3-201ENST00000328041 3929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
RABGGTAQ92696 EID1-201ENST00000530028 2298 ntAPPRIS P1 BASIC17.1■□□□□ 0.33
RABGGTAQ92696 MECR-201ENST00000263702 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
RABGGTAQ92696 AC245052.4-201ENST00000452097 4158 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
RABGGTAQ92696 PHF14-215ENST00000634607 3407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
RABGGTAQ92696 HIST1H2AC-203ENST00000602637 1462 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
RABGGTAQ92696 FGD5P1-202ENST00000614866 2498 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
RABGGTAQ92696 ABCA1-203ENST00000423487 1540 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
RABGGTAQ92696 C1orf43-202ENST00000362076 1551 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
RABGGTAQ92696 CAMK2B-208ENST00000395747 1557 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
RABGGTAQ92696 COLQ-206ENST00000603808 1668 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
RABGGTAQ92696 FAM156B-202ENST00000509613 1701 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
RABGGTAQ92696 CLCN1-201ENST00000343257 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
RABGGTAQ92696 E2F6-202ENST00000381525 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
RABGGTAQ92696 C14orf93-207ENST00000397382 1986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
RABGGTAQ92696 REXO1L1P-202ENST00000608646 1974 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
RABGGTAQ92696 PLCB1-203ENST00000378641 7323 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
RABGGTAQ92696 PLD3-204ENST00000409281 2115 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
RABGGTAQ92696 CIAPIN1-201ENST00000394391 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
RABGGTAQ92696 SLC30A5-209ENST00000621204 3999 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
RABGGTAQ92696 ZMYND15-202ENST00000433935 2411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
RABGGTAQ92696 KCP-208ENST00000620378 4515 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
RABGGTAQ92696 PRDM1-203ENST00000369096 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
RABGGTAQ92696 AHDC1-201ENST00000247087 6334 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
RABGGTAQ92696 ISCA1-201ENST00000311534 813 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
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RABGGTAQ92696 NUDT1-205ENST00000397048 783 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
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RABGGTAQ92696 DNAJC19-209ENST00000491873 769 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
RABGGTAQ92696 GCHFR-204ENST00000559445 626 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
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RABGGTAQ92696 UBE2E3-205ENST00000602475 602 ntTSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
RABGGTAQ92696 GNRHR2-204ENST00000604273 1078 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
RABGGTAQ92696 GPD1L-201ENST00000282541 4060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
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RABGGTAQ92696 IQSEC3-203ENST00000538872 7094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
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RABGGTAQ92696 SPAAR-202ENST00000443779 1612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
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RABGGTAQ92696 Z98749.3-201ENST00000400206 1770 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
RABGGTAQ92696 AC093525.2-201ENST00000564543 1944 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
RABGGTAQ92696 NDUFS2-201ENST00000367993 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
RABGGTAQ92696 METTL25-201ENST00000248306 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
RABGGTAQ92696 DBH-AS1-201ENST00000425189 2139 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
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RABGGTAQ92696 NFKB2-203ENST00000369966 3101 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
RABGGTAQ92696 TUBGCP2-203ENST00000368563 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
RABGGTAQ92696 ITGA9-201ENST00000264741 7889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
RABGGTAQ92696 SETD1B-201ENST00000267197 5772 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
RABGGTAQ92696 FSIP1-201ENST00000350221 2805 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
RABGGTAQ92696 CNOT8-201ENST00000285896 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
RABGGTAQ92696 AC123912.2-201ENST00000594927 2409 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
RABGGTAQ92696 DUS2-207ENST00000565263 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
RABGGTAQ92696 PIP5K1A-202ENST00000368888 2134 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
RABGGTAQ92696 DUSP6-202ENST00000308385 1959 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
RABGGTAQ92696 EIF2B3-201ENST00000360403 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
RABGGTAQ92696 AMT-204ENST00000427987 1646 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
RABGGTAQ92696 CRH-201ENST00000276571 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
RABGGTAQ92696 IDH3B-201ENST00000380843 1545 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
RABGGTAQ92696 LSMEM2-201ENST00000316436 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
RABGGTAQ92696 KLRG1-201ENST00000266551 1335 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
RABGGTAQ92696 C1orf68-201ENST00000368775 949 ntAPPRIS P1 BASIC17.08■□□□□ 0.32
RABGGTAQ92696 AKIP1-204ENST00000396648 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
RABGGTAQ92696 AL513303.2-201ENST00000413339 536 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
RABGGTAQ92696 ARSEP1-201ENST00000420443 635 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
RABGGTAQ92696 RPL13P2-201ENST00000440687 659 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
RABGGTAQ92696 TMEM191A-209ENST00000452055 788 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
RABGGTAQ92696 HOXB3-204ENST00000465120 943 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
RABGGTAQ92696 RARRES2P5-201ENST00000564013 466 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
RABGGTAQ92696 AC124287.1-201ENST00000582249 838 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
RABGGTAQ92696 AC005746.1-201ENST00000589244 672 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
RABGGTAQ92696 AC099568.2-201ENST00000609194 695 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
RABGGTAQ92696 SOGA3-201ENST00000465909 3756 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
RABGGTAQ92696 AC007686.3-201ENST00000619017 3487 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
RABGGTAQ92696 SEMA5B-206ENST00000451055 4579 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
RABGGTAQ92696 LPO-210ENST00000582328 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
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