Protein–RNA interactions for Protein: Q8WXC6

COPS9, COP9 signalosome complex subunit 9, humanhuman

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Length 57 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COPS9Q8WXC6 TMEM169-204ENST00000437356 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
COPS9Q8WXC6 STK38L-201ENST00000389032 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
COPS9Q8WXC6 OPRL1-201ENST00000336866 3321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.74
COPS9Q8WXC6 RNF183-201ENST00000297894 1830 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.4□□□□□ -0.74
COPS9Q8WXC6 PRAMEF25-202ENST00000619661 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
COPS9Q8WXC6 ZNF84-215ENST00000543758 3501 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.74
COPS9Q8WXC6 TSPAN12-201ENST00000222747 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
COPS9Q8WXC6 GPR132-203ENST00000539291 2779 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.4□□□□□ -0.74
COPS9Q8WXC6 ZNF718-202ENST00000609714 2772 ntTSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
COPS9Q8WXC6 JCAD-201ENST00000375377 9265 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.74
COPS9Q8WXC6 AMACR-205ENST00000426255 1316 ntTSL 2 BASIC10.4□□□□□ -0.74
COPS9Q8WXC6 PMS2P7-201ENST00000506558 1336 ntBASIC10.4□□□□□ -0.74
COPS9Q8WXC6 LAT2-205ENST00000460943 2527 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
COPS9Q8WXC6 FAM107A-206ENST00000474531 2271 ntTSL 2 BASIC10.4□□□□□ -0.74
COPS9Q8WXC6 TMEM164-204ENST00000372073 5567 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.74
COPS9Q8WXC6 DAG1-218ENST00000515359 5576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.74
COPS9Q8WXC6 DNM3-208ENST00000627582 7625 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
COPS9Q8WXC6 ST6GAL2-201ENST00000361686 6857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
COPS9Q8WXC6 NUCB1-201ENST00000405315 2668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
COPS9Q8WXC6 PSMD14-201ENST00000409682 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
COPS9Q8WXC6 ZFAND2A-201ENST00000316495 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
COPS9Q8WXC6 IGLL1-202ENST00000330377 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
COPS9Q8WXC6 RNU1-129P-201ENST00000384064 167 ntBASIC10.4□□□□□ -0.74
COPS9Q8WXC6 ZFAND2A-203ENST00000401903 968 ntTSL 3 BASIC10.4□□□□□ -0.74
COPS9Q8WXC6 PTCHD3P3-201ENST00000403073 906 ntBASIC10.4□□□□□ -0.74
COPS9Q8WXC6 LINC01273-201ENST00000411453 685 ntTSL 2 BASIC10.4□□□□□ -0.74
COPS9Q8WXC6 TMEM213-202ENST00000413208 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.4□□□□□ -0.74
COPS9Q8WXC6 DMKN-206ENST00000418261 1257 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
COPS9Q8WXC6 AL603832.1-201ENST00000421943 449 ntTSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.74
COPS9Q8WXC6 BX276092.5-203ENST00000456199 560 ntBASIC10.4□□□□□ -0.74
COPS9Q8WXC6 TPT1P11-201ENST00000458482 498 ntBASIC10.4□□□□□ -0.74
COPS9Q8WXC6 GCFC2-207ENST00000470503 1066 ntTSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
COPS9Q8WXC6 AC010531.1-201ENST00000568879 953 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC10.4□□□□□ -0.74
COPS9Q8WXC6 NUTF2-206ENST00000569436 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.4□□□□□ -0.74
COPS9Q8WXC6 MIR4313-201ENST00000580760 101 ntBASIC10.4□□□□□ -0.74
COPS9Q8WXC6 U1.21-201ENST00000580816 167 ntBASIC10.4□□□□□ -0.74
COPS9Q8WXC6 NTF4-201ENST00000593537 932 ntAPPRIS P1 BASIC10.4□□□□□ -0.74
COPS9Q8WXC6 BCL2L12-206ENST00000598306 510 ntTSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.74
COPS9Q8WXC6 AC145285.6-201ENST00000604632 637 ntBASIC10.4□□□□□ -0.74
COPS9Q8WXC6 HYMAI.1-201ENST00000620949 238 ntBASIC10.4□□□□□ -0.74
COPS9Q8WXC6 LILRA2-208ENST00000629481 661 ntTSL 2 BASIC10.4□□□□□ -0.74
COPS9Q8WXC6 TARDBP-228ENST00000629725 1031 ntTSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.74
COPS9Q8WXC6 EPHX2-207ENST00000521400 3140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
COPS9Q8WXC6 SGK3-211ENST00000522398 3106 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.74
COPS9Q8WXC6 TACC2-229ENST00000515603 9101 ntTSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
COPS9Q8WXC6 MINPP1-202ENST00000371996 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
COPS9Q8WXC6 ARVCF-203ENST00000406259 2871 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.74
COPS9Q8WXC6 SLC39A8-203ENST00000424970 4032 ntTSL 2 BASIC10.4□□□□□ -0.74
COPS9Q8WXC6 CDH20-202ENST00000536675 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
COPS9Q8WXC6 STAU2-219ENST00000522509 2173 ntTSL 2 BASIC10.4□□□□□ -0.74
COPS9Q8WXC6 RNF222-202ENST00000399398 3062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.74
COPS9Q8WXC6 SIRPA-202ENST00000358771 3996 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
COPS9Q8WXC6 RAB3IP-204ENST00000378815 2386 ntTSL 2 BASIC10.4□□□□□ -0.74
COPS9Q8WXC6 AC012313.8-201ENST00000595059 5402 ntBASIC10.4□□□□□ -0.74
COPS9Q8WXC6 PLEC-210ENST00000527096 13713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.75
COPS9Q8WXC6 AC005899.8-201ENST00000625127 3153 ntTSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.75
COPS9Q8WXC6 AMACR-203ENST00000382072 2919 ntTSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.75
COPS9Q8WXC6 PCCB-218ENST00000490504 1613 ntTSL 3 BASIC10.4□□□□□ -0.75
COPS9Q8WXC6 DAPK1-201ENST00000358077 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.75
COPS9Q8WXC6 SEMA4B-201ENST00000332496 3781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.75
COPS9Q8WXC6 SGK2-201ENST00000341458 2498 ntTSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.75
COPS9Q8WXC6 PRF1-201ENST00000373209 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.75
COPS9Q8WXC6 JPH3-201ENST00000284262 3985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.75
COPS9Q8WXC6 NEAT1-201ENST00000499732 1811 ntTSL 2 BASIC10.4□□□□□ -0.75
COPS9Q8WXC6 AC027288.3-202ENST00000550268 1820 ntTSL 2 BASIC10.4□□□□□ -0.75
COPS9Q8WXC6 AL592490.1-201ENST00000409186 6347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.75
COPS9Q8WXC6 MVB12B-206ENST00000489637 2666 ntTSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.75
COPS9Q8WXC6 FLNA-219ENST00000610817 7595 ntTSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.75
COPS9Q8WXC6 CDK16-211ENST00000518022 2022 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.4□□□□□ -0.75
COPS9Q8WXC6 ZKSCAN3-203ENST00000377255 4799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
COPS9Q8WXC6 AC233702.3-201ENST00000578656 1387 ntBASIC10.39□□□□□ -0.75
COPS9Q8WXC6 CCDC88A-207ENST00000436346 9811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.39□□□□□ -0.75
COPS9Q8WXC6 LINC01544-201ENST00000567801 5168 ntTSL 2 BASIC10.39□□□□□ -0.75
COPS9Q8WXC6 TBC1D1-203ENST00000402522 1567 ntTSL 2 BASIC10.39□□□□□ -0.75
COPS9Q8WXC6 DUSP13-203ENST00000372702 1778 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
COPS9Q8WXC6 LONP1-202ENST00000540670 3002 ntTSL 2 BASIC10.39□□□□□ -0.75
COPS9Q8WXC6 IL6R-201ENST00000344086 3217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
COPS9Q8WXC6 TMEM140-201ENST00000275767 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
COPS9Q8WXC6 LRRC41-208ENST00000617760 2158 ntTSL 5 BASIC10.39□□□□□ -0.75
COPS9Q8WXC6 NRIP3-201ENST00000309166 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
COPS9Q8WXC6 LOXL3-202ENST00000393937 2398 ntTSL 5 BASIC10.39□□□□□ -0.75
COPS9Q8WXC6 SCAMP4-202ENST00000409472 2394 ntTSL 2 BASIC10.39□□□□□ -0.75
COPS9Q8WXC6 NPAP1-201ENST00000329468 7526 ntAPPRIS P1 BASIC10.39□□□□□ -0.75
COPS9Q8WXC6 RSPH9-202ENST00000372165 2586 ntTSL 2 BASIC10.39□□□□□ -0.75
COPS9Q8WXC6 CGB7-203ENST00000597853 3386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.39□□□□□ -0.75
COPS9Q8WXC6 CCDC117-202ENST00000421503 3766 ntTSL 2 BASIC10.39□□□□□ -0.75
COPS9Q8WXC6 MAGEA2-204ENST00000611674 1728 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.39□□□□□ -0.75
COPS9Q8WXC6 RSPH9-201ENST00000372163 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
COPS9Q8WXC6 PDK1-201ENST00000282077 14193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
COPS9Q8WXC6 LINC00924-202ENST00000556053 2682 ntTSL 2 BASIC10.39□□□□□ -0.75
COPS9Q8WXC6 HIST1H2AG-201ENST00000359193 2250 ntAPPRIS P1 BASIC10.39□□□□□ -0.75
COPS9Q8WXC6 ARSH-201ENST00000381130 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
COPS9Q8WXC6 MFSD11-217ENST00000590514 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
COPS9Q8WXC6 PCGF2-206ENST00000618941 1499 ntTSL 5 BASIC10.39□□□□□ -0.75
COPS9Q8WXC6 STIM1-201ENST00000300737 4038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
COPS9Q8WXC6 SYNGR1-201ENST00000216155 497 ntTSL 3 BASIC10.39□□□□□ -0.75
COPS9Q8WXC6 PRORSD1P-201ENST00000295112 541 ntBASIC10.39□□□□□ -0.75
COPS9Q8WXC6 AP4S1-202ENST00000313566 839 ntTSL 3 BASIC10.39□□□□□ -0.75
COPS9Q8WXC6 SNAPIN-201ENST00000368685 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
COPS9Q8WXC6 AC114763.1-202ENST00000414911 867 ntTSL 3 BASIC10.39□□□□□ -0.75
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