Protein–RNA interactions for Protein: Q8NFW9

MYRIP, Rab effector MyRIP, humanhuman

Predictions only

Length 859 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MYRIPQ8NFW9 CRACR2A-203ENST00000440314 2697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
MYRIPQ8NFW9 IL21R-204ENST00000564089 3009 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
MYRIPQ8NFW9 NFE2L1-218ENST00000583378 2051 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
MYRIPQ8NFW9 POLR3D-202ENST00000397802 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
MYRIPQ8NFW9 IL9R-201ENST00000244174 1944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
MYRIPQ8NFW9 NPM2-209ENST00000521157 1484 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
MYRIPQ8NFW9 CASQ1-201ENST00000368078 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
MYRIPQ8NFW9 MYOM3-201ENST00000338909 2693 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
MYRIPQ8NFW9 ASH2L-201ENST00000343823 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
MYRIPQ8NFW9 KXD1-201ENST00000222307 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
MYRIPQ8NFW9 ATP6V1E1-201ENST00000253413 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
MYRIPQ8NFW9 SNTG2-202ENST00000407292 1436 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
MYRIPQ8NFW9 AP005117.1-201ENST00000584346 1413 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
MYRIPQ8NFW9 REV1-202ENST00000393445 4686 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
MYRIPQ8NFW9 PCDHB13-201ENST00000341948 5061 ntAPPRIS P1 BASIC16.54■□□□□ 0.24
MYRIPQ8NFW9 UNC5C-203ENST00000506749 2220 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
MYRIPQ8NFW9 ATE1-201ENST00000224652 4930 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
MYRIPQ8NFW9 TM2D3-201ENST00000333202 1381 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
MYRIPQ8NFW9 AC051649.2-201ENST00000640310 3319 ntAPPRIS P1 BASIC16.54■□□□□ 0.24
MYRIPQ8NFW9 TUBGCP6-201ENST00000248846 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
MYRIPQ8NFW9 CARHSP1-217ENST00000611932 2833 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
MYRIPQ8NFW9 CAMSAP3-201ENST00000160298 3889 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
MYRIPQ8NFW9 EIF4G1-201ENST00000342981 5667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
MYRIPQ8NFW9 INS-201ENST00000250971 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
MYRIPQ8NFW9 RAMP1-201ENST00000254661 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
MYRIPQ8NFW9 IGLL1-202ENST00000330377 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
MYRIPQ8NFW9 AP2S1-202ENST00000352203 793 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
MYRIPQ8NFW9 ROMO1-203ENST00000374077 422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
MYRIPQ8NFW9 CXCL12-204ENST00000395793 665 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
MYRIPQ8NFW9 EMC9-202ENST00000419198 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
MYRIPQ8NFW9 DECR2-202ENST00000424398 1012 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
MYRIPQ8NFW9 IDH3B-206ENST00000474315 1279 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
MYRIPQ8NFW9 MMP17-203ENST00000535004 719 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
MYRIPQ8NFW9 AP2S1-204ENST00000597020 707 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
MYRIPQ8NFW9 TXNDC12-205ENST00000610127 806 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
MYRIPQ8NFW9 SMN2-213ENST00000614240 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
MYRIPQ8NFW9 ADAMTS10-201ENST00000270328 4194 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
MYRIPQ8NFW9 KIAA0895-207ENST00000436884 1952 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
MYRIPQ8NFW9 SCUBE1-202ENST00000360835 9808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
MYRIPQ8NFW9 AP002761.4-201ENST00000565433 3361 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
MYRIPQ8NFW9 LRP8-201ENST00000306052 7648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
MYRIPQ8NFW9 DPEP1-201ENST00000261615 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
MYRIPQ8NFW9 HYOU1-218ENST00000614668 1569 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
MYRIPQ8NFW9 ZNF785-201ENST00000395216 3282 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
MYRIPQ8NFW9 NLRP7-207ENST00000590030 3209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
MYRIPQ8NFW9 TNFAIP8L1-201ENST00000327473 3814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
MYRIPQ8NFW9 TNFAIP8L1-202ENST00000536716 3845 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
MYRIPQ8NFW9 LINC01257-201ENST00000376678 2473 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
MYRIPQ8NFW9 ZNF519-206ENST00000589498 2117 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
MYRIPQ8NFW9 NIPAL3-203ENST00000358028 1757 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
MYRIPQ8NFW9 ADD2-202ENST00000355733 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
MYRIPQ8NFW9 DDX17-202ENST00000396821 4791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
MYRIPQ8NFW9 PCDHB18P-202ENST00000526308 3197 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
MYRIPQ8NFW9 ARHGEF4-217ENST00000611048 3486 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
MYRIPQ8NFW9 KIF26A-201ENST00000315264 6714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
MYRIPQ8NFW9 FAM160B1-202ENST00000369248 5810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
MYRIPQ8NFW9 RUNX3-203ENST00000399916 4340 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
MYRIPQ8NFW9 CYP4F11-204ENST00000591841 2531 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
MYRIPQ8NFW9 FAM219A-207ENST00000379089 3624 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
MYRIPQ8NFW9 SLC9B1-201ENST00000296422 1879 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
MYRIPQ8NFW9 FAM103A1-201ENST00000304191 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
MYRIPQ8NFW9 MED16-201ENST00000269814 1199 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
MYRIPQ8NFW9 SUMF2-203ENST00000395435 1287 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
MYRIPQ8NFW9 LENG8-AS1-201ENST00000416022 582 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
MYRIPQ8NFW9 NUS1P2-201ENST00000417358 873 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
MYRIPQ8NFW9 MAN2B2-202ENST00000504248 2968 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
MYRIPQ8NFW9 MTRF1LP2-201ENST00000506027 1122 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
MYRIPQ8NFW9 ATP6V0A2-207ENST00000544833 1013 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
MYRIPQ8NFW9 PNN-202ENST00000553331 656 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
MYRIPQ8NFW9 DHRS4-205ENST00000558263 1089 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
MYRIPQ8NFW9 DHRS4L2-207ENST00000558753 556 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
MYRIPQ8NFW9 ZFPM1-205ENST00000569086 563 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
MYRIPQ8NFW9 AC011476.2-201ENST00000585492 1271 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
MYRIPQ8NFW9 RLN3-202ENST00000585987 541 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
MYRIPQ8NFW9 TUBB4A-209ENST00000598006 565 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
MYRIPQ8NFW9 CAP2-202ENST00000378990 1812 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
MYRIPQ8NFW9 CBLB-204ENST00000405772 3237 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
MYRIPQ8NFW9 KCNMA1-262ENST00000639489 4302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
MYRIPQ8NFW9 PLD1-201ENST00000331659 2906 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
MYRIPQ8NFW9 AL589702.1-201ENST00000641229 1509 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
MYRIPQ8NFW9 USP49-201ENST00000373006 3177 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
MYRIPQ8NFW9 TUNAR-201ENST00000503525 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
MYRIPQ8NFW9 ABCC10-201ENST00000244533 5088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
MYRIPQ8NFW9 CCDC126-202ENST00000409765 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
MYRIPQ8NFW9 PELP1-201ENST00000301396 3673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
MYRIPQ8NFW9 WARS2-201ENST00000235521 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
MYRIPQ8NFW9 SLC4A8-205ENST00000535225 2262 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
MYRIPQ8NFW9 ATG5-201ENST00000343245 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
MYRIPQ8NFW9 TRIB2-202ENST00000381465 2778 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
MYRIPQ8NFW9 TAP2-201ENST00000374897 5684 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
MYRIPQ8NFW9 CES3-202ENST00000394037 3817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
MYRIPQ8NFW9 ECHDC1-220ENST00000528402 1449 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
MYRIPQ8NFW9 ZNF721-205ENST00000511833 2966 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.53■□□□□ 0.24
MYRIPQ8NFW9 ZBED1-202ENST00000381222 4507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
MYRIPQ8NFW9 PITPNM2-AS1-201ENST00000506255 2191 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
MYRIPQ8NFW9 DNAJC22-202ENST00000549441 4412 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
MYRIPQ8NFW9 GFAP-201ENST00000253408 3135 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
MYRIPQ8NFW9 ADAT1-201ENST00000307921 1869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
MYRIPQ8NFW9 TLX1NB-202ENST00000445873 1862 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
MYRIPQ8NFW9 STX1A-201ENST00000222812 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 90.6 ms