Protein–RNA interactions for Protein: Q8NDW4

ZNF248, Zinc finger protein 248, humanhuman

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Length 579 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF248Q8NDW4 AC244250.1-201ENST00000438185 451 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
ZNF248Q8NDW4 HIST2H2BC-201ENST00000498492 580 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
ZNF248Q8NDW4 FBXL8-208ENST00000521920 574 ntTSL 4 BASIC14.7□□□□□ -0.06
ZNF248Q8NDW4 GABARAPL1-217ENST00000545887 571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
ZNF248Q8NDW4 CCDC144NL-AS1-209ENST00000577860 884 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
ZNF248Q8NDW4 MIR3619-201ENST00000579667 83 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
ZNF248Q8NDW4 NDUFV2P1-201ENST00000596415 907 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
ZNF248Q8NDW4 LINC00658-206ENST00000600157 901 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
ZNF248Q8NDW4 AC107373.2-201ENST00000607735 490 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
ZNF248Q8NDW4 DIO1-215ENST00000610607 796 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
ZNF248Q8NDW4 AC145423.3-201ENST00000615987 467 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
ZNF248Q8NDW4 AC138627.1-207ENST00000641560 1006 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
ZNF248Q8NDW4 IL32-201ENST00000008180 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
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ZNF248Q8NDW4 RGS11-202ENST00000316163 2376 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
ZNF248Q8NDW4 TPM1-201ENST00000267996 1670 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
ZNF248Q8NDW4 CCDC181-206ENST00000491570 1652 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
ZNF248Q8NDW4 OASL-204ENST00000620239 1695 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
ZNF248Q8NDW4 ADAMTS14-201ENST00000373207 5260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
ZNF248Q8NDW4 MEGF11-204ENST00000422354 5914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
ZNF248Q8NDW4 SEC14L4-201ENST00000255858 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
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ZNF248Q8NDW4 NAP1L4-222ENST00000620138 2479 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
ZNF248Q8NDW4 NOTCH4-201ENST00000375023 6745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
ZNF248Q8NDW4 KCNJ12-201ENST00000331718 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
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ZNF248Q8NDW4 CCDC110-209ENST00000510617 2592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
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ZNF248Q8NDW4 AC005253.1-201ENST00000597411 2001 ntTSL 4 BASIC14.68□□□□□ -0.06
ZNF248Q8NDW4 FADS1-201ENST00000350997 4525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
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ZNF248Q8NDW4 IGSF8-202ENST00000368086 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
ZNF248Q8NDW4 SNRPN-202ENST00000390687 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
ZNF248Q8NDW4 FAM83A-201ENST00000276699 1858 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
ZNF248Q8NDW4 AL353608.3-201ENST00000603200 2211 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
ZNF248Q8NDW4 PSME3-202ENST00000441946 2944 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
ZNF248Q8NDW4 TMTC2-203ENST00000548305 2682 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
ZNF248Q8NDW4 DYRK3-201ENST00000367106 2329 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
ZNF248Q8NDW4 VPS16-203ENST00000380469 2318 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
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