Protein–RNA interactions for Protein: Q8N488

RYBP, RING1 and YY1-binding protein, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 228 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RYBPQ8N488 TRAPPC2L-206ENST00000564365 1060 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
RYBPQ8N488 PAM16-204ENST00000571941 674 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
RYBPQ8N488 TRAPPC6A-204ENST00000588062 695 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
RYBPQ8N488 BRI3BPP1-201ENST00000594224 787 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
RYBPQ8N488 ZNF83-215ENST00000600714 810 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
RYBPQ8N488 AC000095.1-201ENST00000603208 874 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
RYBPQ8N488 GNRHR2-204ENST00000604273 1078 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
RYBPQ8N488 APOBEC3H-206ENST00000613677 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
RYBPQ8N488 LINC01663-201ENST00000614596 535 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
RYBPQ8N488 HIST1H2AB-201ENST00000615868 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.12
RYBPQ8N488 LRP8-201ENST00000306052 7648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
RYBPQ8N488 APOLD1-201ENST00000326765 4724 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
RYBPQ8N488 NEFL-203ENST00000619417 1879 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
RYBPQ8N488 RASA4B-207ENST00000541662 2794 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
RYBPQ8N488 ZNF7-218ENST00000544249 2125 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
RYBPQ8N488 GTF2H1-203ENST00000453096 2707 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
RYBPQ8N488 SYMPK-213ENST00000599460 5449 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
RYBPQ8N488 CSRNP2-201ENST00000228515 4471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
RYBPQ8N488 CRK-201ENST00000300574 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
RYBPQ8N488 KCNMA1-219ENST00000480683 2963 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
RYBPQ8N488 NWD2-201ENST00000309447 8325 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
RYBPQ8N488 TPCN1-214ENST00000550785 5345 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
RYBPQ8N488 FBP1-203ENST00000415431 1487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
RYBPQ8N488 KRT9-202ENST00000588431 1493 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
RYBPQ8N488 AC011899.2-202ENST00000438047 4302 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
RYBPQ8N488 AC022532.1-201ENST00000624563 1728 ntBASIC15.77■□□□□ 0.11
RYBPQ8N488 RAB11FIP1-201ENST00000287263 6253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
RYBPQ8N488 TEAD2-203ENST00000539846 1444 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
RYBPQ8N488 HEY1-201ENST00000337919 2296 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
RYBPQ8N488 AUTS2-218ENST00000615871 4511 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
RYBPQ8N488 CACNA2D3-202ENST00000415676 3661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
RYBPQ8N488 PTBP1-202ENST00000350092 3069 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
RYBPQ8N488 COX6B2-201ENST00000326529 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
RYBPQ8N488 TSPAN11-201ENST00000261177 5505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
RYBPQ8N488 ULK4-203ENST00000420927 1904 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
RYBPQ8N488 GSTO2-203ENST00000450629 1391 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
RYBPQ8N488 SAMD4A-204ENST00000554335 3003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
RYBPQ8N488 ASNA1-204ENST00000591090 1368 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
RYBPQ8N488 KCNQ2-204ENST00000359125 3253 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
RYBPQ8N488 GPD1L-201ENST00000282541 4060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
RYBPQ8N488 PCDHB14-201ENST00000239449 4828 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
RYBPQ8N488 RCL1-204ENST00000381750 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
RYBPQ8N488 TMEM139-205ENST00000410004 2114 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
RYBPQ8N488 AC097374.1-201ENST00000568768 6624 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
RYBPQ8N488 PRPF38B-202ENST00000370022 1591 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
RYBPQ8N488 VGLL4-202ENST00000413604 1554 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
RYBPQ8N488 SLC22A6-203ENST00000421062 1560 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
RYBPQ8N488 SLC43A2-201ENST00000301335 8136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
RYBPQ8N488 AEN-201ENST00000332810 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
RYBPQ8N488 SETD1B-203ENST00000604567 5969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
RYBPQ8N488 FAM8A1-201ENST00000259963 4677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
RYBPQ8N488 PLVAP-201ENST00000252590 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
RYBPQ8N488 SZT2-AS1-201ENST00000396885 699 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
RYBPQ8N488 SOCS2P1-201ENST00000417727 557 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
RYBPQ8N488 C1orf210-201ENST00000423420 629 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
RYBPQ8N488 AC073133.1-201ENST00000426187 432 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
RYBPQ8N488 ARL6IP4-207ENST00000426960 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
RYBPQ8N488 LINC01067-201ENST00000432575 664 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
RYBPQ8N488 RN7SL837P-201ENST00000463010 287 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
RYBPQ8N488 AC106886.2-201ENST00000483578 883 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
RYBPQ8N488 CSF1R-209ENST00000543093 921 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
RYBPQ8N488 CR383656.12-201ENST00000549567 513 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
RYBPQ8N488 AC105339.1-202ENST00000559535 1283 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
RYBPQ8N488 AC239798.4-201ENST00000609879 700 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
RYBPQ8N488 GRIA3-205ENST00000611689 936 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
RYBPQ8N488 SPIN2A-203ENST00000614076 966 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
RYBPQ8N488 R3HDM2-201ENST00000347140 4331 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
RYBPQ8N488 ZNF620-202ENST00000418905 2022 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
RYBPQ8N488 KIF17-201ENST00000247986 3969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
RYBPQ8N488 EI24-214ENST00000620753 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
RYBPQ8N488 DMRT2-202ENST00000302441 1495 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
RYBPQ8N488 STBD1-201ENST00000237642 3420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
RYBPQ8N488 FOLH1-202ENST00000340334 2697 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
RYBPQ8N488 PUF60-208ENST00000526683 2412 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
RYBPQ8N488 TBXAS1-201ENST00000336425 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
RYBPQ8N488 MLPH-204ENST00000410032 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
RYBPQ8N488 EOMES-201ENST00000295743 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
RYBPQ8N488 AC103702.1-201ENST00000548801 2630 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
RYBPQ8N488 ELP1-201ENST00000374647 5905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
RYBPQ8N488 SHISA9-201ENST00000423335 4043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
RYBPQ8N488 BICDL1-201ENST00000397558 3055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
RYBPQ8N488 DEF8-210ENST00000563594 4450 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
RYBPQ8N488 DOK3-203ENST00000377112 1884 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
RYBPQ8N488 HARS-205ENST00000457527 1896 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
RYBPQ8N488 UVSSA-206ENST00000507531 2597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
RYBPQ8N488 INSIG1-201ENST00000340368 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
RYBPQ8N488 H6PD-203ENST00000602477 5590 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
RYBPQ8N488 LOX-206ENST00000639739 1626 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
RYBPQ8N488 MARVELD1-201ENST00000285605 3221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
RYBPQ8N488 CAP1-205ENST00000372802 2964 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
RYBPQ8N488 LINC01270-201ENST00000371639 2281 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
RYBPQ8N488 MZF1-201ENST00000215057 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
RYBPQ8N488 TRIM50-202ENST00000453152 1599 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
RYBPQ8N488 HARS2-206ENST00000508522 1562 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
RYBPQ8N488 ANKRD50-202ENST00000515641 4212 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
RYBPQ8N488 AMT-232ENST00000636199 1546 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
RYBPQ8N488 UNC5B-202ENST00000373192 6451 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
RYBPQ8N488 SIK3-205ENST00000446921 3858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
RYBPQ8N488 WDR6-222ENST00000615452 1949 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
RYBPQ8N488 FOXR1-201ENST00000317011 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.2 ms