Protein–RNA interactions for Protein: Q86YS3

RAB11FIP4, Rab11 family-interacting protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 637 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB11FIP4Q86YS3 GLIDR-202ENST00000625350 2588 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
RAB11FIP4Q86YS3 REC8-209ENST00000611366 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
RAB11FIP4Q86YS3 DMPK-202ENST00000343373 3227 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
RAB11FIP4Q86YS3 SF3A2-201ENST00000221494 1963 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
RAB11FIP4Q86YS3 BIRC2-214ENST00000621637 3331 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
RAB11FIP4Q86YS3 GNS-201ENST00000258145 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
RAB11FIP4Q86YS3 PKD1P5-201ENST00000532415 10291 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
RAB11FIP4Q86YS3 BUD31-201ENST00000222969 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
RAB11FIP4Q86YS3 NFU1-201ENST00000303698 1034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
RAB11FIP4Q86YS3 SCAND1-201ENST00000305978 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
RAB11FIP4Q86YS3 FIBP-201ENST00000338369 1261 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
RAB11FIP4Q86YS3 ATP1A1-AS1-202ENST00000369492 1011 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
RAB11FIP4Q86YS3 THPO-202ENST00000421442 1132 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
RAB11FIP4Q86YS3 LINC01605-204ENST00000522718 1093 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
RAB11FIP4Q86YS3 SLC8B1-206ENST00000549069 1058 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
RAB11FIP4Q86YS3 SDR39U1-212ENST00000555365 976 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
RAB11FIP4Q86YS3 CUEDC1-207ENST00000577840 875 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
RAB11FIP4Q86YS3 AC011497.1-201ENST00000596781 561 ntTSL 4 BASIC17.99■□□□□ 0.47
RAB11FIP4Q86YS3 AL157392.3-207ENST00000601758 744 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
RAB11FIP4Q86YS3 LINC01515-215ENST00000608678 854 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
RAB11FIP4Q86YS3 LHCGR-202ENST00000401907 1477 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
RAB11FIP4Q86YS3 DGAT2L6-201ENST00000333026 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
RAB11FIP4Q86YS3 RNFT2-203ENST00000392549 2896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
RAB11FIP4Q86YS3 WDTC1-202ENST00000361771 4275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
RAB11FIP4Q86YS3 FOXB1-201ENST00000396057 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
RAB11FIP4Q86YS3 AL138799.1-201ENST00000448213 1675 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
RAB11FIP4Q86YS3 TOM1L2-202ENST00000379504 2418 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
RAB11FIP4Q86YS3 ZNF772-202ENST00000356584 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
RAB11FIP4Q86YS3 MGEA5-201ENST00000357797 3263 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
RAB11FIP4Q86YS3 TPGS2-201ENST00000334295 4030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
RAB11FIP4Q86YS3 MROH6-201ENST00000398882 3469 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
RAB11FIP4Q86YS3 CICP24-201ENST00000605464 2705 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
RAB11FIP4Q86YS3 TNR-201ENST00000263525 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
RAB11FIP4Q86YS3 CAPN5-202ENST00000456580 2805 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
RAB11FIP4Q86YS3 TNFRSF11A-206ENST00000617039 3756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
RAB11FIP4Q86YS3 FECH-201ENST00000262093 3853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
RAB11FIP4Q86YS3 ELF2-202ENST00000379549 3005 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
RAB11FIP4Q86YS3 MAPT-204ENST00000344290 6816 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
RAB11FIP4Q86YS3 AIFM2-204ENST00000613322 3247 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
RAB11FIP4Q86YS3 C5orf38-207ENST00000515640 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
RAB11FIP4Q86YS3 SEC24D-202ENST00000419654 2786 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
RAB11FIP4Q86YS3 AP4M1-205ENST00000422582 1814 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
RAB11FIP4Q86YS3 PNPLA3-203ENST00000423180 2222 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
RAB11FIP4Q86YS3 STRA6-207ENST00000535552 2631 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
RAB11FIP4Q86YS3 IQCA1L-203ENST00000615129 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
RAB11FIP4Q86YS3 SAFB-205ENST00000588852 2842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
RAB11FIP4Q86YS3 PPP1R21-201ENST00000281394 3137 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
RAB11FIP4Q86YS3 E2F6-202ENST00000381525 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
RAB11FIP4Q86YS3 KCNQ1DN-201ENST00000441418 1093 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
RAB11FIP4Q86YS3 TMEM147-AS1-201ENST00000444728 487 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
RAB11FIP4Q86YS3 METTL21A-209ENST00000448823 869 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
RAB11FIP4Q86YS3 SPDYE16-201ENST00000515340 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
RAB11FIP4Q86YS3 SAMD11P1-201ENST00000571429 661 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
RAB11FIP4Q86YS3 COX11-202ENST00000571584 1108 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
RAB11FIP4Q86YS3 AP005482.2-201ENST00000587889 310 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
RAB11FIP4Q86YS3 TMEM261P1-201ENST00000604899 340 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
RAB11FIP4Q86YS3 ALDH3B1-203ENST00000612297 1231 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
RAB11FIP4Q86YS3 HIST1H2AB-201ENST00000615868 393 ntAPPRIS P1 BASIC17.98■□□□□ 0.47
RAB11FIP4Q86YS3 AC025048.6-201ENST00000634326 1161 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
RAB11FIP4Q86YS3 AC020915.1-201ENST00000413518 1469 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
RAB11FIP4Q86YS3 ZNF789-201ENST00000331410 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
RAB11FIP4Q86YS3 PPOX-201ENST00000352210 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
RAB11FIP4Q86YS3 USE1-206ENST00000595101 1776 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
RAB11FIP4Q86YS3 RWDD1-202ENST00000466444 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
RAB11FIP4Q86YS3 CC2D1B-202ENST00000371586 5642 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
RAB11FIP4Q86YS3 TXNDC2-206ENST00000611534 2066 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
RAB11FIP4Q86YS3 SLC26A10-201ENST00000320442 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
RAB11FIP4Q86YS3 AC058822.1-201ENST00000507166 2550 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
RAB11FIP4Q86YS3 TPBG-202ENST00000535040 3392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
RAB11FIP4Q86YS3 SLC6A11-201ENST00000254488 4296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
RAB11FIP4Q86YS3 PCDHA6-203ENST00000529310 5374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
RAB11FIP4Q86YS3 TAP2-205ENST00000620123 5676 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
RAB11FIP4Q86YS3 MAP7-207ENST00000616617 4326 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
RAB11FIP4Q86YS3 STAT1-203ENST00000392323 2723 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
RAB11FIP4Q86YS3 RCOR3-203ENST00000419091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
RAB11FIP4Q86YS3 MSTO2P-201ENST00000314835 1709 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
RAB11FIP4Q86YS3 ECE1-204ENST00000415912 5099 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
RAB11FIP4Q86YS3 TEKT4-201ENST00000295201 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
RAB11FIP4Q86YS3 CYB561-203ENST00000392976 3151 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
RAB11FIP4Q86YS3 EP400-203ENST00000333577 3092 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
RAB11FIP4Q86YS3 MBD1-209ENST00000398495 2178 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
RAB11FIP4Q86YS3 SPOCK2-202ENST00000373109 5445 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
RAB11FIP4Q86YS3 SMC4-204ENST00000462787 5033 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
RAB11FIP4Q86YS3 SETD1B-201ENST00000267197 5772 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
RAB11FIP4Q86YS3 TRIM50-202ENST00000453152 1599 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
RAB11FIP4Q86YS3 TCEAL4-209ENST00000472745 1571 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
RAB11FIP4Q86YS3 KCNT1-208ENST00000488444 3696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
RAB11FIP4Q86YS3 AC007787.1-201ENST00000588095 1583 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
RAB11FIP4Q86YS3 AL161772.1-201ENST00000610494 4412 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
RAB11FIP4Q86YS3 NAXD-202ENST00000424185 2311 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
RAB11FIP4Q86YS3 RBM46-204ENST00000514866 2315 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
RAB11FIP4Q86YS3 CDC25B-203ENST00000344256 3071 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
RAB11FIP4Q86YS3 FANK1-204ENST00000368695 1296 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
RAB11FIP4Q86YS3 NGF-201ENST00000369512 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
RAB11FIP4Q86YS3 GHSR-202ENST00000427970 912 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
RAB11FIP4Q86YS3 UFL1-AS1-201ENST00000430796 548 ntTSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
RAB11FIP4Q86YS3 PRAP1-201ENST00000433452 971 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
RAB11FIP4Q86YS3 AC140481.1-201ENST00000448777 706 ntTSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
RAB11FIP4Q86YS3 CXorf40A-211ENST00000450602 1204 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
RAB11FIP4Q86YS3 ARHGEF26-AS1-201ENST00000467912 628 ntTSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.7 ms