Protein–RNA interactions for Protein: Q5VT28

FAM27B, Protein FAM27A/B/C, humanhuman

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Length 67 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM27BQ5VT28 LINC01089-209ENST00000542933 1220 ntTSL 3 BASIC13.42□□□□□ -0.26
FAM27BQ5VT28 IL32-234ENST00000552936 713 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.42□□□□□ -0.26
FAM27BQ5VT28 AL359711.2-201ENST00000563105 872 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
FAM27BQ5VT28 AC005262.2-201ENST00000587701 452 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
FAM27BQ5VT28 AC133539.2-201ENST00000604757 467 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
FAM27BQ5VT28 ALDH3B1-203ENST00000612297 1231 ntTSL 3 BASIC13.42□□□□□ -0.26
FAM27BQ5VT28 PCDHGC4-204ENST00000618371 812 ntTSL 3 BASIC13.42□□□□□ -0.26
FAM27BQ5VT28 SPDYE6-201ENST00000563237 1691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
FAM27BQ5VT28 FGD5P1-202ENST00000614866 2498 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
FAM27BQ5VT28 NOVA2-201ENST00000263257 7803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
FAM27BQ5VT28 AMZ1-201ENST00000312371 5516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
FAM27BQ5VT28 TMEM119-201ENST00000392806 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
FAM27BQ5VT28 COX10-AS1-202ENST00000449363 1944 ntTSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
FAM27BQ5VT28 ETV7-201ENST00000339796 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
FAM27BQ5VT28 ZNF365-205ENST00000395254 4173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
FAM27BQ5VT28 CAP1-205ENST00000372802 2964 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
FAM27BQ5VT28 AC138517.2-201ENST00000637503 2594 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
FAM27BQ5VT28 DPYSL3-201ENST00000343218 5476 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
FAM27BQ5VT28 MBD1-209ENST00000398495 2178 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
FAM27BQ5VT28 SERPINE2-202ENST00000409304 2161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
FAM27BQ5VT28 SLC6A11-201ENST00000254488 4296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
FAM27BQ5VT28 DHODH-201ENST00000219240 2426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
FAM27BQ5VT28 HNRNPA1P48-201ENST00000562726 1377 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
FAM27BQ5VT28 TBPL2-201ENST00000247219 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
FAM27BQ5VT28 FRMD5-202ENST00000417257 5011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
FAM27BQ5VT28 TPO-203ENST00000346956 2923 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
FAM27BQ5VT28 ARIH2-205ENST00000449376 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
FAM27BQ5VT28 AC004223.3-201ENST00000593039 1638 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
FAM27BQ5VT28 CROT-201ENST00000331536 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
FAM27BQ5VT28 LINC01136-203ENST00000457348 2539 ntTSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
FAM27BQ5VT28 AGER-206ENST00000375070 1463 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
FAM27BQ5VT28 C7orf49-201ENST00000393114 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
FAM27BQ5VT28 AGER-208ENST00000438221 1493 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
FAM27BQ5VT28 CTNNBL1-209ENST00000621317 1990 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
FAM27BQ5VT28 TRA2A-202ENST00000392502 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
FAM27BQ5VT28 TGFBR2-202ENST00000359013 4605 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
FAM27BQ5VT28 NPHP3-AS1-201ENST00000489343 2957 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
FAM27BQ5VT28 HDHD3-201ENST00000238379 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
FAM27BQ5VT28 KIRREL1-202ENST00000360089 3304 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
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FAM27BQ5VT28 CNTFR-204ENST00000610543 1926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
FAM27BQ5VT28 FKBP6-204ENST00000431982 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
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FAM27BQ5VT28 CRLS1-203ENST00000452938 3859 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
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FAM27BQ5VT28 ABCC1-202ENST00000399410 6552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
FAM27BQ5VT28 NOX3-201ENST00000159060 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
FAM27BQ5VT28 NDUFV1-202ENST00000415352 1512 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
FAM27BQ5VT28 FOXI2-201ENST00000388920 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
FAM27BQ5VT28 LCE3E-201ENST00000368789 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
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FAM27BQ5VT28 YTHDF3-AS1-201ENST00000603538 718 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
FAM27BQ5VT28 TOM1L1-201ENST00000348161 1895 ntTSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
FAM27BQ5VT28 GABARAP-201ENST00000302386 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
FAM27BQ5VT28 MRPL11-201ENST00000310999 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
FAM27BQ5VT28 SPAAR-202ENST00000443779 1612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
FAM27BQ5VT28 STBD1-201ENST00000237642 3420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
FAM27BQ5VT28 EPHA5-202ENST00000354839 3427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
FAM27BQ5VT28 TM2D3-207ENST00000559107 1353 ntTSL 3 BASIC13.41□□□□□ -0.26
FAM27BQ5VT28 FRMD5-209ENST00000484674 2319 ntTSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
FAM27BQ5VT28 GPKOW-201ENST00000156109 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
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FAM27BQ5VT28 MAPT-213ENST00000571987 2277 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
FAM27BQ5VT28 SOX30-202ENST00000311371 2716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
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FAM27BQ5VT28 SLC25A38-201ENST00000273158 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
FAM27BQ5VT28 PES1-204ENST00000402284 2144 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
FAM27BQ5VT28 MEGF10-202ENST00000418761 2238 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
FAM27BQ5VT28 REC8-209ENST00000611366 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
FAM27BQ5VT28 PLAGL1-206ENST00000416623 3237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
FAM27BQ5VT28 MYOZ1-201ENST00000359322 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
FAM27BQ5VT28 GNB2-202ENST00000393924 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
FAM27BQ5VT28 MBD1-204ENST00000347968 3091 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
FAM27BQ5VT28 DTX4-204ENST00000532982 1708 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
FAM27BQ5VT28 EPOP-201ENST00000621654 3719 ntAPPRIS P1 BASIC13.4□□□□□ -0.26
FAM27BQ5VT28 TSFM-201ENST00000323833 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
FAM27BQ5VT28 TNFRSF12A-202ENST00000341627 881 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
FAM27BQ5VT28 FAM104B-202ENST00000358460 1179 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
FAM27BQ5VT28 PGGT1B-202ENST00000379615 903 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
FAM27BQ5VT28 PABPN1L-202ENST00000419291 1272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
FAM27BQ5VT28 AC093459.1-202ENST00000438963 768 ntTSL 3 BASIC13.4□□□□□ -0.26
FAM27BQ5VT28 GALT-202ENST00000450095 1280 ntTSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
FAM27BQ5VT28 AC097717.1-202ENST00000457577 740 ntTSL 3 BASIC13.4□□□□□ -0.26
FAM27BQ5VT28 KRBOX4-206ENST00000478600 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
FAM27BQ5VT28 KRBOX4-207ENST00000487081 1247 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
FAM27BQ5VT28 TIMM8B-201ENST00000504148 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
FAM27BQ5VT28 HNRNPA1P13-201ENST00000510646 963 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
FAM27BQ5VT28 FAM212B-207ENST00000534365 1217 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
FAM27BQ5VT28 AC005520.2-201ENST00000556194 573 ntTSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
FAM27BQ5VT28 AC140912.1-201ENST00000577171 1054 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
FAM27BQ5VT28 IFT20-206ENST00000578122 834 ntTSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
FAM27BQ5VT28 IFT20-208ENST00000578985 831 ntTSL 3 BASIC13.4□□□□□ -0.26
FAM27BQ5VT28 ANAPC11-216ENST00000579133 563 ntTSL 3 BASIC13.4□□□□□ -0.26
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