Protein–RNA interactions for Protein: Q4LDR2

CTXN3, Cortexin-3, humanhuman

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Length 81 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTXN3Q4LDR2 XRRA1-202ENST00000340360 5681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CTXN3Q4LDR2 COX6A2-201ENST00000287490 440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CTXN3Q4LDR2 BEX5-201ENST00000333643 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CTXN3Q4LDR2 ANAPC11-202ENST00000357385 881 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CTXN3Q4LDR2 NUDT1-206ENST00000397049 714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CTXN3Q4LDR2 SMIM11A-203ENST00000399299 1033 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CTXN3Q4LDR2 ZNF564-202ENST00000416136 255 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CTXN3Q4LDR2 AC104306.2-201ENST00000451877 341 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
CTXN3Q4LDR2 CD74-212ENST00000524315 584 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CTXN3Q4LDR2 AC084859.1-201ENST00000533002 670 ntTSL 4 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CTXN3Q4LDR2 IFT20-214ENST00000585089 1071 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CTXN3Q4LDR2 AC011447.3-204ENST00000585498 883 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CTXN3Q4LDR2 CCDC140-201ENST00000295226 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CTXN3Q4LDR2 AC020658.6-201ENST00000623564 1870 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
CTXN3Q4LDR2 ASCL1-201ENST00000266744 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CTXN3Q4LDR2 DACT1-202ENST00000395153 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CTXN3Q4LDR2 C2CD4C-201ENST00000332235 3129 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CTXN3Q4LDR2 FAM83C-201ENST00000374408 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CTXN3Q4LDR2 PLPPR2-201ENST00000251473 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CTXN3Q4LDR2 SGK2-206ENST00000423407 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CTXN3Q4LDR2 SELPLG-201ENST00000228463 1704 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CTXN3Q4LDR2 NOMO1-207ENST00000610363 3765 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CTXN3Q4LDR2 NIN-203ENST00000382041 6496 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CTXN3Q4LDR2 RSPH3-201ENST00000252655 2175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CTXN3Q4LDR2 MST1L-201ENST00000442552 2185 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
CTXN3Q4LDR2 ZBTB10-202ENST00000426744 9878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CTXN3Q4LDR2 ATG10-203ENST00000458350 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CTXN3Q4LDR2 SHANK1-204ENST00000391814 6622 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CTXN3Q4LDR2 MBD4-204ENST00000503197 2099 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CTXN3Q4LDR2 PCDH1-203ENST00000394536 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CTXN3Q4LDR2 ALOX15B-204ENST00000572022 2396 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CTXN3Q4LDR2 TNKS1BP1-201ENST00000358252 5795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CTXN3Q4LDR2 PITX2-205ENST00000394598 1906 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CTXN3Q4LDR2 MTCL1-203ENST00000400050 6042 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CTXN3Q4LDR2 DPEP1-202ENST00000393092 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CTXN3Q4LDR2 CAMKK2-211ENST00000538733 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CTXN3Q4LDR2 AC010424.3-201ENST00000635510 1745 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CTXN3Q4LDR2 NFATC4-201ENST00000250373 4749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CTXN3Q4LDR2 BATF-201ENST00000286639 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CTXN3Q4LDR2 CFLAR-203ENST00000341222 1283 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CTXN3Q4LDR2 VAMP4-202ENST00000367740 1193 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CTXN3Q4LDR2 TREM2-203ENST00000373122 1012 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CTXN3Q4LDR2 TREML1-201ENST00000373127 1194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CTXN3Q4LDR2 ITPA-201ENST00000380113 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CTXN3Q4LDR2 PPP1R14B-202ENST00000392210 600 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CTXN3Q4LDR2 ITPA-202ENST00000399838 897 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CTXN3Q4LDR2 C2orf15-202ENST00000409684 1058 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CTXN3Q4LDR2 AL731661.1-201ENST00000438217 758 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CTXN3Q4LDR2 VGLL4-214ENST00000451674 938 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CTXN3Q4LDR2 AL591846.1-201ENST00000451736 433 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
CTXN3Q4LDR2 RPSAP36-202ENST00000494591 1261 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
CTXN3Q4LDR2 AC006487.1-201ENST00000514506 1221 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CTXN3Q4LDR2 AP002748.3-205ENST00000525142 567 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CTXN3Q4LDR2 AP002748.3-203ENST00000533502 581 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CTXN3Q4LDR2 DUX4L47-201ENST00000566374 394 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
CTXN3Q4LDR2 AC007861.2-201ENST00000573819 571 ntTSL 4 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CTXN3Q4LDR2 TNNT1-209ENST00000587758 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CTXN3Q4LDR2 LFNG-202ENST00000338732 1968 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CTXN3Q4LDR2 STK17A-201ENST00000319357 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CTXN3Q4LDR2 NACAD-202ENST00000490531 4780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CTXN3Q4LDR2 AL162231.1-201ENST00000421828 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CTXN3Q4LDR2 GFRA2-204ENST00000518077 1503 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CTXN3Q4LDR2 NAP1L4-222ENST00000620138 2479 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CTXN3Q4LDR2 FXYD3-202ENST00000346446 1320 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CTXN3Q4LDR2 LZTS1-201ENST00000265801 5459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CTXN3Q4LDR2 AC018755.2-201ENST00000599649 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CTXN3Q4LDR2 ISLR-201ENST00000249842 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CTXN3Q4LDR2 PES1-204ENST00000402284 2144 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CTXN3Q4LDR2 LONRF3-203ENST00000422289 2898 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CTXN3Q4LDR2 MEG9-201ENST00000429368 2638 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CTXN3Q4LDR2 CREB3L2-204ENST00000456390 2360 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CTXN3Q4LDR2 THEMIS2-203ENST00000373925 1650 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CTXN3Q4LDR2 IFT140-201ENST00000361339 2987 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CTXN3Q4LDR2 SNAP47-203ENST00000366760 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CTXN3Q4LDR2 TMA16-201ENST00000358572 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CTXN3Q4LDR2 KATNA1-203ENST00000367411 1984 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CTXN3Q4LDR2 SYBU-230ENST00000532779 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CTXN3Q4LDR2 HAUS2-208ENST00000568876 1702 ntTSL 4 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CTXN3Q4LDR2 NFYC-205ENST00000372654 1455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CTXN3Q4LDR2 RPS3-201ENST00000278572 907 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CTXN3Q4LDR2 HIST3H3-201ENST00000366696 481 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CTXN3Q4LDR2 SLC29A1-206ENST00000371755 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CTXN3Q4LDR2 SETD4-205ENST00000399208 1165 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CTXN3Q4LDR2 MIR1247-201ENST00000408206 136 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
CTXN3Q4LDR2 SAP30L-202ENST00000426761 777 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CTXN3Q4LDR2 AL391280.1-201ENST00000506969 1062 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
CTXN3Q4LDR2 ANAPC13-205ENST00000511751 896 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CTXN3Q4LDR2 AC090735.1-201ENST00000523881 488 ntTSL 4 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CTXN3Q4LDR2 AC120498.1-201ENST00000563593 476 ntTSL 4 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CTXN3Q4LDR2 AC012645.3-203ENST00000567153 520 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CTXN3Q4LDR2 RN7SL713P-201ENST00000582127 302 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
CTXN3Q4LDR2 PPY2P-201ENST00000582808 702 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
CTXN3Q4LDR2 PPY2P-202ENST00000583761 657 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CTXN3Q4LDR2 AC004466.1-201ENST00000599515 1080 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
CTXN3Q4LDR2 AC008750.3-201ENST00000601148 437 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CTXN3Q4LDR2 AL022328.3-201ENST00000607943 679 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
CTXN3Q4LDR2 FDPS-221ENST00000612683 1198 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CTXN3Q4LDR2 AC044839.1-204ENST00000634777 1058 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CTXN3Q4LDR2 SUPT20H-201ENST00000350612 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CTXN3Q4LDR2 PARP9-204ENST00000471785 3040 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
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