Protein–RNA interactions for Protein: Q494R4

CCDC153, Coiled-coil domain-containing protein 153, humanhuman

Predictions only

Length 210 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC153Q494R4 GRM5-205ENST00000455756 7927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
CCDC153Q494R4 GPC3-202ENST00000394299 2379 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
CCDC153Q494R4 TKT-201ENST00000296289 1931 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
CCDC153Q494R4 HSPA7-201ENST00000445535 1927 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
CCDC153Q494R4 RSPH6A-203ENST00000600188 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
CCDC153Q494R4 CYP2AB1P-202ENST00000454440 1456 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
CCDC153Q494R4 COMP-201ENST00000222271 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
CCDC153Q494R4 TRMT1-201ENST00000221504 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
CCDC153Q494R4 UNQ6494-202ENST00000617436 2163 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
CCDC153Q494R4 COL11A2-203ENST00000374708 6209 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
CCDC153Q494R4 LPAR5-201ENST00000329858 3171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
CCDC153Q494R4 NUP54-217ENST00000514987 1563 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
CCDC153Q494R4 DFNA5-201ENST00000342947 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
CCDC153Q494R4 NAGK-201ENST00000244204 1154 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
CCDC153Q494R4 CCL25-201ENST00000253451 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
CCDC153Q494R4 PFN4-201ENST00000313213 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
CCDC153Q494R4 RPL21-203ENST00000319826 806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
CCDC153Q494R4 NKIRAS1-204ENST00000416026 795 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
CCDC153Q494R4 GSKIP-201ENST00000438650 2140 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
CCDC153Q494R4 AC097532.1-201ENST00000440802 322 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
CCDC153Q494R4 SPDYE14P-201ENST00000442619 822 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
CCDC153Q494R4 RCHY1-208ENST00000512706 1011 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
CCDC153Q494R4 RPL10P19-202ENST00000520582 722 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
CCDC153Q494R4 KRT18P58-201ENST00000527480 1120 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
CCDC153Q494R4 GMDS-AS1-205ENST00000529893 900 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
CCDC153Q494R4 AC067930.5-201ENST00000531730 1173 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
CCDC153Q494R4 TNFRSF13B-203ENST00000579315 600 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
CCDC153Q494R4 CIRBP-204ENST00000585630 870 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
CCDC153Q494R4 NNAT-201ENST00000062104 1297 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
CCDC153Q494R4 FSIP1-201ENST00000350221 2805 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
CCDC153Q494R4 TLL1-206ENST00000513213 1829 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
CCDC153Q494R4 TAF4B-203ENST00000578121 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
CCDC153Q494R4 MIOS-201ENST00000340080 3453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
CCDC153Q494R4 KCNC3-202ENST00000474951 3347 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
CCDC153Q494R4 AKAP2-203ENST00000434623 4400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
CCDC153Q494R4 UPB1-202ENST00000382760 1928 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
CCDC153Q494R4 EXOC6B-202ENST00000410104 5795 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
CCDC153Q494R4 IL11RA-215ENST00000602473 1388 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
CCDC153Q494R4 B3GNTL1-211ENST00000576599 1787 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.02
CCDC153Q494R4 HM13-202ENST00000340852 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
CCDC153Q494R4 HAND2-AS1-202ENST00000502896 5278 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
CCDC153Q494R4 F2-201ENST00000311907 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
CCDC153Q494R4 PPM1F-201ENST00000263212 5143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
CCDC153Q494R4 IMPACT-201ENST00000284202 3792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
CCDC153Q494R4 ALDOA-228ENST00000627059 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
CCDC153Q494R4 PITPNM1-216ENST00000534749 4189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
CCDC153Q494R4 FGD5-206ENST00000543601 5768 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
CCDC153Q494R4 GPSM3-206ENST00000375040 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CCDC153Q494R4 MVB12B-206ENST00000489637 2666 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CCDC153Q494R4 RNF182-208ENST00000544682 3495 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CCDC153Q494R4 USP38-202ENST00000510377 4135 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CCDC153Q494R4 ARNT2-209ENST00000622346 2932 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CCDC153Q494R4 PES1-201ENST00000335214 1988 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CCDC153Q494R4 KLHDC7A-201ENST00000400664 5145 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CCDC153Q494R4 DMTN-209ENST00000517600 1569 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CCDC153Q494R4 DNM1P51-202ENST00000558801 8752 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CCDC153Q494R4 SLC1A7-206ENST00000620347 2873 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CCDC153Q494R4 ZNF84-215ENST00000543758 3501 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CCDC153Q494R4 FAM84A-201ENST00000295092 6355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CCDC153Q494R4 NATD1-201ENST00000611551 4931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CCDC153Q494R4 CD2BP2-203ENST00000569466 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CCDC153Q494R4 CUL3-202ENST00000344951 6592 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CCDC153Q494R4 DCUN1D3-201ENST00000324344 6162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CCDC153Q494R4 MYH11-201ENST00000300036 6029 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CCDC153Q494R4 GPAT4-201ENST00000396987 6298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CCDC153Q494R4 CCNB1-201ENST00000256442 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CCDC153Q494R4 GCLC-201ENST00000229416 3813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CCDC153Q494R4 PSMB6-201ENST00000270586 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CCDC153Q494R4 POP7-201ENST00000303151 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CCDC153Q494R4 ITLN1-201ENST00000326245 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CCDC153Q494R4 LRCOL1-201ENST00000376608 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CCDC153Q494R4 AQP7-204ENST00000379506 1062 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CCDC153Q494R4 RPP21-221ENST00000428040 594 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CCDC153Q494R4 GPS2P2-201ENST00000430745 888 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
CCDC153Q494R4 KRT18P64-201ENST00000434946 1219 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
CCDC153Q494R4 HYPK-202ENST00000442995 1051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CCDC153Q494R4 KRT18P43-201ENST00000469825 1281 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
CCDC153Q494R4 EHMT1-216ENST00000493484 1182 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CCDC153Q494R4 AC099805.1-202ENST00000519927 1057 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CCDC153Q494R4 ZNF576-206ENST00000533118 867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CCDC153Q494R4 AL928654.4-206ENST00000551180 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CCDC153Q494R4 AC026150.2-201ENST00000564693 1156 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
CCDC153Q494R4 AC138207.8-201ENST00000579692 739 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CCDC153Q494R4 AC025048.3-201ENST00000590609 569 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
CCDC153Q494R4 AC026803.2-201ENST00000599784 819 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CCDC153Q494R4 PSMB6-205ENST00000614486 871 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CCDC153Q494R4 AC005702.4-201ENST00000618393 416 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
CCDC153Q494R4 USP36-201ENST00000312010 5234 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CCDC153Q494R4 DPY19L2P2-201ENST00000312132 4078 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CCDC153Q494R4 PPP1R26P4-201ENST00000619065 3527 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
CCDC153Q494R4 WASHC2A-202ENST00000314664 4519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CCDC153Q494R4 F8-201ENST00000330287 2620 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CCDC153Q494R4 SNX2-201ENST00000379516 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CCDC153Q494R4 GREM1-202ENST00000560830 2648 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CCDC153Q494R4 STUM-202ENST00000366789 4093 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CCDC153Q494R4 RLF-201ENST00000372771 6246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CCDC153Q494R4 ZEB2-225ENST00000558170 4012 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CCDC153Q494R4 HDHD3-201ENST00000238379 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CCDC153Q494R4 MAGEA9-201ENST00000243314 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CCDC153Q494R4 TAF8-203ENST00000372982 1805 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.6 ms