Protein–RNA interactions for Protein: Q3B726

TWISTNB, DNA-directed RNA polymerase I subunit RPA43, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 338 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TWISTNBQ3B726 DDIAS-203ENST00000525361 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.73
TWISTNBQ3B726 PSMC5-209ENST00000580864 1552 ntTSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.73
TWISTNBQ3B726 WASHC2C-202ENST00000359860 4471 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.73
TWISTNBQ3B726 ADAMTS1-201ENST00000284984 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
TWISTNBQ3B726 ANKFY1-202ENST00000570535 6458 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
TWISTNBQ3B726 TLE3-215ENST00000559048 2918 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.73
TWISTNBQ3B726 BMP3-201ENST00000282701 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
TWISTNBQ3B726 C1QB-201ENST00000314933 1044 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
TWISTNBQ3B726 ZNRD1-201ENST00000332435 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
TWISTNBQ3B726 ANKRD19P-201ENST00000338192 862 ntBASIC19.58■□□□□ 0.72
TWISTNBQ3B726 GABARAPL2-201ENST00000037243 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
TWISTNBQ3B726 CRYAA-202ENST00000398132 826 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
TWISTNBQ3B726 MIR1909-201ENST00000411312 80 ntBASIC19.58■□□□□ 0.72
TWISTNBQ3B726 ARSEP1-201ENST00000420443 635 ntBASIC19.58■□□□□ 0.72
TWISTNBQ3B726 Z98749.2-201ENST00000428294 700 ntTSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
TWISTNBQ3B726 AC016694.1-201ENST00000434179 700 ntBASIC19.58■□□□□ 0.72
TWISTNBQ3B726 SFTPC-202ENST00000437090 773 ntTSL 3 BASIC19.58■□□□□ 0.72
TWISTNBQ3B726 LIMS3-201ENST00000437679 1220 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
TWISTNBQ3B726 APRT-204ENST00000563655 709 ntTSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
TWISTNBQ3B726 GADD45B-204ENST00000587345 765 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
TWISTNBQ3B726 FP236240.1-204ENST00000624932 712 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
TWISTNBQ3B726 DCUN1D4-203ENST00000451288 4269 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
TWISTNBQ3B726 TCAF2P1-201ENST00000291129 2421 ntBASIC19.58■□□□□ 0.72
TWISTNBQ3B726 MYB-201ENST00000316528 3571 ntTSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
TWISTNBQ3B726 MYB-241ENST00000616088 3573 ntTSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
TWISTNBQ3B726 MPC2-202ENST00000367846 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
TWISTNBQ3B726 CIAPIN1-201ENST00000394391 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
TWISTNBQ3B726 FAM32A-201ENST00000263384 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
TWISTNBQ3B726 PDE4C-202ENST00000355502 5979 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
TWISTNBQ3B726 CCDC140-201ENST00000295226 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
TWISTNBQ3B726 UPF3B-202ENST00000345865 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
TWISTNBQ3B726 DUS2-202ENST00000432752 1864 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
TWISTNBQ3B726 MOB3B-201ENST00000262244 6454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
TWISTNBQ3B726 FOS-202ENST00000535987 1402 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
TWISTNBQ3B726 CDCP2-201ENST00000371330 2723 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
TWISTNBQ3B726 TRMO-203ENST00000375119 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
TWISTNBQ3B726 HDHD3-201ENST00000238379 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
TWISTNBQ3B726 NID1-202ENST00000366595 5412 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
TWISTNBQ3B726 LINC00691-201ENST00000432505 2232 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
TWISTNBQ3B726 SPAG6-201ENST00000313311 2421 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
TWISTNBQ3B726 KCNC2-207ENST00000548513 3026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
TWISTNBQ3B726 ACE3P-201ENST00000423435 1973 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
TWISTNBQ3B726 TSEN2-201ENST00000284995 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
TWISTNBQ3B726 TSC1-202ENST00000403810 1507 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
TWISTNBQ3B726 TBP-202ENST00000392092 1903 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
TWISTNBQ3B726 PPP1R21-202ENST00000294952 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
TWISTNBQ3B726 EPS8L2-201ENST00000318562 3148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
TWISTNBQ3B726 RGS6-210ENST00000553530 5685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
TWISTNBQ3B726 ELMOD1-201ENST00000265840 2852 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
TWISTNBQ3B726 SNX5-202ENST00000377768 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
TWISTNBQ3B726 PCSK2-205ENST00000536609 2275 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
TWISTNBQ3B726 MAGEA8-205ENST00000542674 2084 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.57■□□□□ 0.72
TWISTNBQ3B726 CES4A-203ENST00000535696 1472 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
TWISTNBQ3B726 CMA1-202ENST00000250378 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
TWISTNBQ3B726 GK-202ENST00000378941 458 ntTSL 3 BASIC19.57■□□□□ 0.72
TWISTNBQ3B726 AL121983.1-201ENST00000424181 335 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
TWISTNBQ3B726 AC234783.1-201ENST00000441761 496 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
TWISTNBQ3B726 AP000345.1-201ENST00000454863 569 ntTSL 4 BASIC19.57■□□□□ 0.72
TWISTNBQ3B726 AL121845.2-201ENST00000467211 252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.57■□□□□ 0.72
TWISTNBQ3B726 DNAJC19-208ENST00000486355 828 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
TWISTNBQ3B726 DNAJC19-209ENST00000491873 769 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
TWISTNBQ3B726 AC100818.1-201ENST00000524167 563 ntTSL 4 BASIC19.57■□□□□ 0.72
TWISTNBQ3B726 PUDP-206ENST00000540122 825 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
TWISTNBQ3B726 TSPAN11-204ENST00000546076 1058 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
TWISTNBQ3B726 EEF1AKMT3-204ENST00000551420 836 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
TWISTNBQ3B726 AC008969.1-205ENST00000553254 876 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
TWISTNBQ3B726 NCOA1-205ENST00000406961 7289 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
TWISTNBQ3B726 GSN-215ENST00000545652 2428 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
TWISTNBQ3B726 AC010327.3-201ENST00000591665 1643 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
TWISTNBQ3B726 PI4K2B-201ENST00000264864 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
TWISTNBQ3B726 TLL1-204ENST00000507499 4818 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
TWISTNBQ3B726 LINC00528-201ENST00000600723 2160 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
TWISTNBQ3B726 DRC3-216ENST00000584166 1953 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
TWISTNBQ3B726 OVCH1-AS1-204ENST00000641955 5529 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
TWISTNBQ3B726 KRT8-205ENST00000546897 1755 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
TWISTNBQ3B726 LY9-204ENST00000368039 1364 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
TWISTNBQ3B726 LTF-203ENST00000426532 2494 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
TWISTNBQ3B726 KDM4B-203ENST00000536461 5027 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
TWISTNBQ3B726 GABARAPL1-218ENST00000546017 2294 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
TWISTNBQ3B726 IQCA1L-203ENST00000615129 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
TWISTNBQ3B726 CLIC6-202ENST00000360731 3860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
TWISTNBQ3B726 C6orf106-203ENST00000374026 4232 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
TWISTNBQ3B726 GNB2-202ENST00000393924 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
TWISTNBQ3B726 FBXO45-202ENST00000440469 3689 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
TWISTNBQ3B726 HNRNPUL1-220ENST00000602130 2932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
TWISTNBQ3B726 TNFRSF14-AS1-202ENST00000432521 3608 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
TWISTNBQ3B726 SNRNP27-202ENST00000409116 1339 ntTSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
TWISTNBQ3B726 AURKC-203ENST00000448930 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
TWISTNBQ3B726 RNF32-202ENST00000317955 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
TWISTNBQ3B726 KIF22-208ENST00000569382 2020 ntTSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
TWISTNBQ3B726 OSBP2-209ENST00000438716 2747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
TWISTNBQ3B726 RAD23B-201ENST00000358015 4119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
TWISTNBQ3B726 INPP5B-204ENST00000373026 3230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
TWISTNBQ3B726 WFIKKN2-202ENST00000426127 2193 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
TWISTNBQ3B726 MBD1-211ENST00000585595 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
TWISTNBQ3B726 VRK3-207ENST00000594092 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
TWISTNBQ3B726 NCAPH2-201ENST00000299821 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
TWISTNBQ3B726 C20orf202-201ENST00000400633 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
TWISTNBQ3B726 CYTL1-201ENST00000307746 1003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
TWISTNBQ3B726 GJB6-202ENST00000356192 2131 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.7 ms