Protein–RNA interactions for Protein: Q2VIQ3

KIF4B, Chromosome-associated kinesin KIF4B, humanhuman

Predictions only

Length 1,234 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KIF4BQ2VIQ3 DZIP1L-204ENST00000469243 2107 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
KIF4BQ2VIQ3 ADAM6-201ENST00000606026 1843 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
KIF4BQ2VIQ3 LINC00658-202ENST00000420529 1542 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
KIF4BQ2VIQ3 KLHL42-201ENST00000381271 6703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
KIF4BQ2VIQ3 SERTAD4-201ENST00000367012 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
KIF4BQ2VIQ3 FRMPD4-201ENST00000380682 8465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
KIF4BQ2VIQ3 AP1M1-202ENST00000429941 1578 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
KIF4BQ2VIQ3 TMEM19-201ENST00000266673 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
KIF4BQ2VIQ3 FLII-221ENST00000578558 2377 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
KIF4BQ2VIQ3 RPS15-201ENST00000233609 534 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
KIF4BQ2VIQ3 SMS-201ENST00000379404 1174 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
KIF4BQ2VIQ3 TMEM239-202ENST00000380585 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
KIF4BQ2VIQ3 AC016825.1-201ENST00000433600 778 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
KIF4BQ2VIQ3 LINC02028-203ENST00000443776 453 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
KIF4BQ2VIQ3 PENK-202ENST00000451791 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
KIF4BQ2VIQ3 AC009403.1-204ENST00000469539 597 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
KIF4BQ2VIQ3 AC113383.1-201ENST00000514696 582 ntTSL 4 BASIC18.44■□□□□ 0.54
KIF4BQ2VIQ3 AP003419.2-201ENST00000543494 711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
KIF4BQ2VIQ3 RPS15-205ENST00000586686 562 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
KIF4BQ2VIQ3 RPS15-208ENST00000591804 711 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
KIF4BQ2VIQ3 RPS15-209ENST00000592588 510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
KIF4BQ2VIQ3 AC025181.2-201ENST00000606994 802 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
KIF4BQ2VIQ3 PRSS30P-206ENST00000641773 873 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
KIF4BQ2VIQ3 AP001781.3-201ENST00000622211 2939 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
KIF4BQ2VIQ3 AC103702.1-201ENST00000548801 2630 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
KIF4BQ2VIQ3 CLMAT3-201ENST00000510576 1973 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
KIF4BQ2VIQ3 AC136759.1-201ENST00000534201 2163 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
KIF4BQ2VIQ3 WDR45-202ENST00000356463 1688 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
KIF4BQ2VIQ3 TRIM39-205ENST00000396551 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
KIF4BQ2VIQ3 ANTXRL-205ENST00000620264 2206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
KIF4BQ2VIQ3 CDH6-205ENST00000514738 2569 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
KIF4BQ2VIQ3 SQSTM1-213ENST00000510187 1714 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
KIF4BQ2VIQ3 SEPT8-204ENST00000378699 2289 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
KIF4BQ2VIQ3 RNF168-201ENST00000318037 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
KIF4BQ2VIQ3 MRPS7-201ENST00000245539 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
KIF4BQ2VIQ3 CLN5-208ENST00000636183 6664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
KIF4BQ2VIQ3 FAM189B-202ENST00000361361 3082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
KIF4BQ2VIQ3 MPP1-205ENST00000413259 2195 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
KIF4BQ2VIQ3 BMP2K-201ENST00000335016 3804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
KIF4BQ2VIQ3 NFYC-202ENST00000372651 1202 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
KIF4BQ2VIQ3 BEX2-202ENST00000372677 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
KIF4BQ2VIQ3 PRTFDC1-203ENST00000376378 747 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
KIF4BQ2VIQ3 MIR33B-201ENST00000385104 96 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
KIF4BQ2VIQ3 SMARCE1-204ENST00000400122 1263 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
KIF4BQ2VIQ3 LDHBP1-201ENST00000455730 1119 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
KIF4BQ2VIQ3 RN7SL11P-201ENST00000471305 293 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
KIF4BQ2VIQ3 TCEAL4-208ENST00000472484 1273 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
KIF4BQ2VIQ3 DERL3-208ENST00000476077 969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
KIF4BQ2VIQ3 PGAP2-224ENST00000490830 810 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
KIF4BQ2VIQ3 UCHL1-207ENST00000508768 827 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
KIF4BQ2VIQ3 AC097103.2-206ENST00000514729 588 ntTSL 4 BASIC18.43■□□□□ 0.54
KIF4BQ2VIQ3 AC090502.1-202ENST00000515416 966 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
KIF4BQ2VIQ3 SMARCE1-213ENST00000578044 1184 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
KIF4BQ2VIQ3 SMARCE1-216ENST00000580419 1228 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
KIF4BQ2VIQ3 AC105105.3-201ENST00000585470 646 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
KIF4BQ2VIQ3 CROCCP3-204ENST00000590118 574 ntTSL 4 BASIC18.43■□□□□ 0.54
KIF4BQ2VIQ3 Metazoa_SRP.69-201ENST00000615730 281 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
KIF4BQ2VIQ3 AL021997.3-201ENST00000621053 557 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.43■□□□□ 0.54
KIF4BQ2VIQ3 MEF2C-227ENST00000626391 1182 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
KIF4BQ2VIQ3 MEF2C-231ENST00000628656 1254 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
KIF4BQ2VIQ3 EIF4G1-202ENST00000346169 5516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
KIF4BQ2VIQ3 CCNA2-202ENST00000618014 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
KIF4BQ2VIQ3 PRRT4-201ENST00000446477 3544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
KIF4BQ2VIQ3 ADGRA1-202ENST00000392607 4283 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
KIF4BQ2VIQ3 SNUPN-206ENST00000564675 1682 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
KIF4BQ2VIQ3 PIKFYVE-204ENST00000407449 1898 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
KIF4BQ2VIQ3 GLMP-214ENST00000614643 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
KIF4BQ2VIQ3 CLCNKB-201ENST00000375667 2129 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
KIF4BQ2VIQ3 KCNC1-202ENST00000379472 7965 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
KIF4BQ2VIQ3 MYRIP-202ENST00000396217 4877 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
KIF4BQ2VIQ3 AC068418.2-201ENST00000577309 3703 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
KIF4BQ2VIQ3 C7orf33-201ENST00000307003 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
KIF4BQ2VIQ3 MPP1-204ENST00000393531 1389 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
KIF4BQ2VIQ3 TGIF1-201ENST00000330513 1980 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
KIF4BQ2VIQ3 EPHA10-203ENST00000427468 3167 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
KIF4BQ2VIQ3 ROBO3-201ENST00000397801 4569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
KIF4BQ2VIQ3 ROBO3-220ENST00000538940 4551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
KIF4BQ2VIQ3 MANSC1-201ENST00000396349 2220 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
KIF4BQ2VIQ3 AMT-224ENST00000635808 1610 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
KIF4BQ2VIQ3 OTUD7A-201ENST00000307050 10770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
KIF4BQ2VIQ3 F11R-206ENST00000621309 4770 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
KIF4BQ2VIQ3 HARS-205ENST00000457527 1896 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
KIF4BQ2VIQ3 KCNC2-209ENST00000550433 2931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
KIF4BQ2VIQ3 ANKK1-201ENST00000303941 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
KIF4BQ2VIQ3 AC105917.1-201ENST00000506637 2539 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
KIF4BQ2VIQ3 GNAI2-207ENST00000451956 1486 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
KIF4BQ2VIQ3 TMEM256-201ENST00000302422 486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
KIF4BQ2VIQ3 KCNAB2-207ENST00000378111 822 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
KIF4BQ2VIQ3 SHANK2-204ENST00000409530 2123 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
KIF4BQ2VIQ3 CD8A-204ENST00000409781 597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
KIF4BQ2VIQ3 LINC02158-201ENST00000432377 897 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
KIF4BQ2VIQ3 AC253536.4-201ENST00000440539 267 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
KIF4BQ2VIQ3 LYRM4-206ENST00000468929 1168 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
KIF4BQ2VIQ3 AC092944.1-202ENST00000487238 483 ntTSL 4 BASIC18.42■□□□□ 0.54
KIF4BQ2VIQ3 FGFR3P5-201ENST00000564496 886 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
KIF4BQ2VIQ3 AC005730.2-201ENST00000564549 1184 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
KIF4BQ2VIQ3 MIR5572-201ENST00000583188 137 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
KIF4BQ2VIQ3 EDDM13-208ENST00000637802 854 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
KIF4BQ2VIQ3 PMS1-212ENST00000432292 3234 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
KIF4BQ2VIQ3 MAGEA4-205ENST00000393920 1721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.2 ms