Protein–RNA interactions for Protein: Q16836

HADH, Hydroxyacyl-coenzyme A dehydrogenase, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 314 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HADHQ16836 STRN3-201ENST00000355683 3970 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
HADHQ16836 PPM1F-201ENST00000263212 5143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
HADHQ16836 DTX4-204ENST00000532982 1708 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
HADHQ16836 KIF18B-204ENST00000593135 2745 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
HADHQ16836 PHF24-201ENST00000242315 5718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
HADHQ16836 ZNF586-201ENST00000391702 2265 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
HADHQ16836 PSMB6-201ENST00000270586 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
HADHQ16836 TSPAN4-201ENST00000346501 882 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
HADHQ16836 AC018685.2-201ENST00000414065 547 ntTSL 4 BASIC16.09■□□□□ 0.17
HADHQ16836 AL161638.1-201ENST00000420354 481 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
HADHQ16836 FOLR3-201ENST00000442948 805 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
HADHQ16836 SDR39U1-212ENST00000555365 976 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
HADHQ16836 AC040162.1-202ENST00000573493 573 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
HADHQ16836 LITAF-218ENST00000576036 603 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.09■□□□□ 0.17
HADHQ16836 PSMB6-205ENST00000614486 871 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
HADHQ16836 GSG1L-203ENST00000447459 4916 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
HADHQ16836 AKNA-206ENST00000374088 5464 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
HADHQ16836 LINC01301-205ENST00000531654 1347 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
HADHQ16836 FGFR1OP2-201ENST00000229395 2924 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
HADHQ16836 CASQ1-201ENST00000368078 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
HADHQ16836 CHN2-201ENST00000222792 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
HADHQ16836 TPRX1-201ENST00000322175 1924 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
HADHQ16836 SCNN1D-205ENST00000379116 3044 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
HADHQ16836 NCAPH2-202ENST00000395698 1388 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
HADHQ16836 REXO1L4P-201ENST00000605109 1937 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
HADHQ16836 APP-208ENST00000439274 2517 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
HADHQ16836 MCM7-202ENST00000343023 1968 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
HADHQ16836 FAM110C-201ENST00000327669 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
HADHQ16836 GPR84-201ENST00000267015 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
HADHQ16836 MARK3-202ENST00000303622 3283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
HADHQ16836 ATP11B-201ENST00000323116 7325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
HADHQ16836 TRIM7-203ENST00000393315 2851 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
HADHQ16836 PI4K2B-201ENST00000264864 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
HADHQ16836 TIFA-201ENST00000361717 4157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
HADHQ16836 AC005264.1-201ENST00000587587 2319 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
HADHQ16836 RER1-203ENST00000378513 3000 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.17
HADHQ16836 UBL7-209ENST00000567435 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
HADHQ16836 PMP22-201ENST00000312280 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
HADHQ16836 PIMREG-205ENST00000572447 1948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
HADHQ16836 SLC17A5-201ENST00000355773 3455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
HADHQ16836 KCP-203ENST00000610776 5108 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
HADHQ16836 MTA1-203ENST00000406191 2770 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
HADHQ16836 CRB2-201ENST00000359999 3659 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
HADHQ16836 KIAA1468-202ENST00000398130 6178 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
HADHQ16836 TP73-204ENST00000378280 2062 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
HADHQ16836 SUN1-204ENST00000403868 978 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
HADHQ16836 BASP1P1-201ENST00000430708 665 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
HADHQ16836 KCNQ1DN-201ENST00000441418 1093 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
HADHQ16836 AC004066.1-201ENST00000502488 802 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
HADHQ16836 AC113383.1-201ENST00000514696 582 ntTSL 4 BASIC16.08■□□□□ 0.16
HADHQ16836 C8orf88-201ENST00000517562 894 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
HADHQ16836 TAPBPL-205ENST00000544021 772 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
HADHQ16836 GABARAPL1-217ENST00000545887 571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
HADHQ16836 SAMD11P1-201ENST00000571429 661 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
HADHQ16836 INO80C-210ENST00000590757 595 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
HADHQ16836 AC008738.7-201ENST00000609744 511 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
HADHQ16836 AC006538.3-201ENST00000612495 578 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
HADHQ16836 AC106028.4-201ENST00000614509 607 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
HADHQ16836 RDM1-220ENST00000616596 1032 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
HADHQ16836 RDM1-228ENST00000620284 1177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
HADHQ16836 PLEKHN1-201ENST00000379407 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
HADHQ16836 NOTCH4-201ENST00000375023 6745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
HADHQ16836 SOCS5-202ENST00000394861 4058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
HADHQ16836 PGC-202ENST00000373025 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
HADHQ16836 PIP5K1C-202ENST00000537021 3326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
HADHQ16836 TNFRSF11A-202ENST00000586569 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
HADHQ16836 UVSSA-208ENST00000511563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
HADHQ16836 MROH6-201ENST00000398882 3469 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
HADHQ16836 DDTL-201ENST00000215770 1545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
HADHQ16836 TEX28-203ENST00000617225 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
HADHQ16836 NFIC-201ENST00000341919 1573 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
HADHQ16836 PRPF38B-202ENST00000370022 1591 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
HADHQ16836 LINC00917-207ENST00000601556 2618 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
HADHQ16836 CLN3-201ENST00000333496 1608 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
HADHQ16836 GPKOW-201ENST00000156109 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
HADHQ16836 DMAP1-203ENST00000372289 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
HADHQ16836 CASC3-201ENST00000264645 4116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
HADHQ16836 PDZD3-212ENST00000531114 2996 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
HADHQ16836 MAGEA9-201ENST00000243314 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
HADHQ16836 AP4M1-205ENST00000422582 1814 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
HADHQ16836 FBLN2-203ENST00000404922 4318 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
HADHQ16836 PCDH17-201ENST00000377918 8232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
HADHQ16836 IL1RN-203ENST00000361779 1922 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
HADHQ16836 ADAD1-201ENST00000296513 1961 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
HADHQ16836 PCDHB14-201ENST00000239449 4828 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
HADHQ16836 WFIKKN2-202ENST00000426127 2193 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
HADHQ16836 CAMK2D-211ENST00000511664 2210 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
HADHQ16836 ADAMTS14-201ENST00000373207 5260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
HADHQ16836 PTPRU-205ENST00000460170 5337 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
HADHQ16836 TP53INP2-201ENST00000374809 4018 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
HADHQ16836 ZSCAN10-209ENST00000576985 2739 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
HADHQ16836 NTRK3-203ENST00000357724 2980 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
HADHQ16836 KLHDC7A-201ENST00000400664 5145 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
HADHQ16836 SLC2A11-203ENST00000345044 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
HADHQ16836 SLC39A8-202ENST00000394833 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
HADHQ16836 SYMPK-213ENST00000599460 5449 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
HADHQ16836 EPS8L2-223ENST00000533256 3266 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
HADHQ16836 CBX2-201ENST00000269399 1061 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
HADHQ16836 C1orf43-203ENST00000368516 872 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
HADHQ16836 COLEC11-205ENST00000402922 1134 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
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