Protein–RNA interactions for Protein: Q16204

CCDC6, Coiled-coil domain-containing protein 6, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC6Q16204 KCTD14-201ENST00000353172 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CCDC6Q16204 CYB5R3-204ENST00000407332 1849 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CCDC6Q16204 NR2E3-202ENST00000617575 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CCDC6Q16204 NEK2-202ENST00000366999 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CCDC6Q16204 PIPOX-201ENST00000323372 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CCDC6Q16204 ANKMY2-201ENST00000306999 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CCDC6Q16204 OR2C3-201ENST00000366487 8467 ntAPPRIS P1 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CCDC6Q16204 APBA2-205ENST00000558330 3349 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CCDC6Q16204 AC009690.1-201ENST00000379915 4374 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CCDC6Q16204 COL17A1-201ENST00000353479 5734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CCDC6Q16204 CSF2-201ENST00000296871 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CCDC6Q16204 WDR45-201ENST00000322995 1444 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CCDC6Q16204 ZNF385A-201ENST00000338010 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CCDC6Q16204 FBXO42-201ENST00000375592 6202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CCDC6Q16204 NUDT1-206ENST00000397049 714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CCDC6Q16204 AL161785.3-201ENST00000435157 395 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CCDC6Q16204 RPS24-203ENST00000435275 656 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CCDC6Q16204 PLSCR4-204ENST00000446574 1442 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CCDC6Q16204 SVIL-AS1-208ENST00000446807 1007 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CCDC6Q16204 PRMT2-208ENST00000451211 1878 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CCDC6Q16204 SERBP1P3-201ENST00000459980 809 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
CCDC6Q16204 GALNTL6-205ENST00000511251 2905 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CCDC6Q16204 HGSNAT-207ENST00000521576 2332 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CCDC6Q16204 RHBDL2-203ENST00000540558 697 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CCDC6Q16204 TINF2-208ENST00000558566 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CCDC6Q16204 AC000032.1-201ENST00000562538 491 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CCDC6Q16204 AC120498.3-201ENST00000568884 542 ntTSL 4 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CCDC6Q16204 NAA38-207ENST00000576861 556 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CCDC6Q16204 AC008758.5-201ENST00000595562 617 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CCDC6Q16204 IRF3-217ENST00000597198 1741 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CCDC6Q16204 RPS24-214ENST00000613865 538 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CCDC6Q16204 HIST1H2BO-201ENST00000616182 381 ntAPPRIS P1 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CCDC6Q16204 HOTAIRM1_1.1-201ENST00000622675 125 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
CCDC6Q16204 AL160035.1-201ENST00000637583 576 ntTSL 4 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CCDC6Q16204 SUGP2-215ENST00000601879 5546 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CCDC6Q16204 LEKR1-209ENST00000491763 1940 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CCDC6Q16204 SPATA21-205ENST00000540400 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CCDC6Q16204 SH2B1-206ENST00000545570 1488 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CCDC6Q16204 RNFT2-203ENST00000392549 2896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CCDC6Q16204 FBXO41-201ENST00000295133 6928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CCDC6Q16204 RPS28-203ENST00000600659 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CCDC6Q16204 CALM1-216ENST00000626705 1341 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CCDC6Q16204 TRIM45-201ENST00000256649 3515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CCDC6Q16204 LCK-206ENST00000373564 2137 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CCDC6Q16204 ACAN-209ENST00000617301 8669 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CCDC6Q16204 HIST1H2AC-202ENST00000377791 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
CCDC6Q16204 AC105760.2-201ENST00000418430 2341 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.18
CCDC6Q16204 KIF7-201ENST00000394412 4551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.18
CCDC6Q16204 NUP50-201ENST00000347635 5233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CCDC6Q16204 RAPH1-202ENST00000319170 9808 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CCDC6Q16204 CMKLR1-204ENST00000550402 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CCDC6Q16204 CRK-202ENST00000398970 3675 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CCDC6Q16204 ITGBL1-207ENST00000622834 2369 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CCDC6Q16204 KIF3C-201ENST00000264712 5344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CCDC6Q16204 CAMK2D-211ENST00000511664 2210 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CCDC6Q16204 BCAS3-204ENST00000585744 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CCDC6Q16204 TMEM132E-203ENST00000631683 4379 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CCDC6Q16204 TBL2-205ENST00000432538 1573 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CCDC6Q16204 PAQR6-214ENST00000613336 1599 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CCDC6Q16204 NRAS-201ENST00000369535 4449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CCDC6Q16204 AC139530.2-201ENST00000571730 1922 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CCDC6Q16204 MED15-202ENST00000292733 3252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CCDC6Q16204 PAX3-207ENST00000409551 1782 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CCDC6Q16204 RASSF5-201ENST00000577571 3496 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CCDC6Q16204 FTH1-201ENST00000273550 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CCDC6Q16204 HDAC11-201ENST00000295757 2960 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CCDC6Q16204 GSTO1-201ENST00000369710 900 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CCDC6Q16204 SELENOM-202ENST00000402395 1054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CCDC6Q16204 MIR1908-201ENST00000410394 80 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
CCDC6Q16204 SAPCD1-209ENST00000425424 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
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CCDC6Q16204 AL669831.5-201ENST00000434264 844 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CCDC6Q16204 FADS2-205ENST00000517839 469 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CCDC6Q16204 GNLY-210ENST00000524600 750 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
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CCDC6Q16204 AC013451.1-201ENST00000554552 518 ntTSL 4 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CCDC6Q16204 TMEM170A-203ENST00000566980 547 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CCDC6Q16204 AC011499.1-201ENST00000586012 581 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CCDC6Q16204 AC093726.1-201ENST00000608064 963 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
CCDC6Q16204 MRNIP-225ENST00000610475 810 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CCDC6Q16204 AC087645.4-201ENST00000638890 792 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CCDC6Q16204 AL033527.5-201ENST00000641382 801 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
CCDC6Q16204 NDOR1-202ENST00000371521 2497 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CCDC6Q16204 CYTH3-201ENST00000350796 4505 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CCDC6Q16204 CYTH3-202ENST00000396741 4508 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CCDC6Q16204 SPAAR-202ENST00000443779 1612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CCDC6Q16204 ALG1-204ENST00000588623 2671 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CCDC6Q16204 PAK4-205ENST00000593690 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CCDC6Q16204 HIST1H2AC-203ENST00000602637 1462 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CCDC6Q16204 YTHDC1-202ENST00000355665 3244 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CCDC6Q16204 ARVCF-202ENST00000401994 2700 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CCDC6Q16204 PLAA-205ENST00000520884 2041 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CCDC6Q16204 PTHLH-202ENST00000395868 1674 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CCDC6Q16204 LINC01660-203ENST00000618517 1859 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CCDC6Q16204 MRPS22-212ENST00000495075 1547 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CCDC6Q16204 OPA1-205ENST00000361908 6439 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CCDC6Q16204 MIR137HG-202ENST00000424528 2639 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CCDC6Q16204 ATP6V0D1-201ENST00000290949 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CCDC6Q16204 CDC14C-201ENST00000428251 1719 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
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