Protein–RNA interactions for Protein: Q15699

ALX1, ALX homeobox protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 326 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ALX1Q15699 TPD52L1-214ENST00000534199 811 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
ALX1Q15699 AC138466.3-201ENST00000619983 221 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
ALX1Q15699 AC044839.1-204ENST00000634777 1058 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
ALX1Q15699 ABCB8-212ENST00000477719 1625 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
ALX1Q15699 GATA3-201ENST00000346208 2654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
ALX1Q15699 SMURF2-201ENST00000262435 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
ALX1Q15699 MARS-233ENST00000628866 2583 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
ALX1Q15699 MBD1-217ENST00000588937 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
ALX1Q15699 ZNF131-214ENST00000509634 3340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
ALX1Q15699 SLC12A8-207ENST00000469902 2989 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
ALX1Q15699 MLLT3-210ENST00000630269 2040 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
ALX1Q15699 PCDHGC5-202ENST00000610789 2763 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.96■□□□□ 0.46
ALX1Q15699 NFATC2-206ENST00000609943 5690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
ALX1Q15699 MRPS17-201ENST00000285298 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
ALX1Q15699 DNAJC19-201ENST00000382564 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
ALX1Q15699 HMBOX1-210ENST00000523613 1730 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
ALX1Q15699 CHST14-201ENST00000306243 3574 ntAPPRIS P1 BASIC17.95■□□□□ 0.46
ALX1Q15699 PACSIN2-201ENST00000263246 3249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
ALX1Q15699 CALCOCO2-211ENST00000508679 1396 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
ALX1Q15699 ALOX12B-201ENST00000319144 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
ALX1Q15699 GPI-205ENST00000586425 1799 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
ALX1Q15699 TEX12-201ENST00000280358 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
ALX1Q15699 ITPA-201ENST00000380113 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
ALX1Q15699 ITPA-202ENST00000399838 897 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
ALX1Q15699 PSORS1C3-201ENST00000412143 593 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
ALX1Q15699 RPS24-203ENST00000435275 656 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
ALX1Q15699 DGCR5-204ENST00000440005 1299 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
ALX1Q15699 KCNQ1-AS1-201ENST00000440887 1084 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
ALX1Q15699 AL590640.2-201ENST00000457038 527 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
ALX1Q15699 AC078785.1-201ENST00000496389 734 ntTSL 3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
ALX1Q15699 AC018653.3-202ENST00000538062 735 ntTSL 3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
ALX1Q15699 PUDP-206ENST00000540122 825 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
ALX1Q15699 AC090502.1-201ENST00000549905 748 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
ALX1Q15699 AC090502.1-204ENST00000551210 469 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
ALX1Q15699 AL355102.5-201ENST00000554769 572 ntTSL 4 BASIC17.95■□□□□ 0.46
ALX1Q15699 AP005482.1-201ENST00000563722 1273 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
ALX1Q15699 MIR4259-201ENST00000584466 101 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
ALX1Q15699 ECM1P1-201ENST00000604092 1279 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
ALX1Q15699 RPS24-214ENST00000613865 538 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
ALX1Q15699 PPP2R5C-204ENST00000422945 4481 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
ALX1Q15699 MAEL-202ENST00000367872 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
ALX1Q15699 GOLGA5-201ENST00000163416 2969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
ALX1Q15699 GMIP-204ENST00000587238 2987 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
ALX1Q15699 DNAJC22-201ENST00000395069 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
ALX1Q15699 AJ011931.1-201ENST00000618749 2492 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
ALX1Q15699 HNRNPR-212ENST00000606561 1837 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
ALX1Q15699 CNKSR1-201ENST00000361530 2625 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
ALX1Q15699 BANP-201ENST00000286122 2368 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
ALX1Q15699 SLC35G5-201ENST00000382435 1321 ntAPPRIS P1 BASIC17.95■□□□□ 0.46
ALX1Q15699 AL138725.1-201ENST00000407347 1314 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
ALX1Q15699 CMPK1-203ENST00000371873 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
ALX1Q15699 AC144831.1-201ENST00000573312 2656 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
ALX1Q15699 PCED1B-201ENST00000432328 1862 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
ALX1Q15699 SPPL2B-207ENST00000610743 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
ALX1Q15699 DHX30-205ENST00000445061 4065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
ALX1Q15699 JPH4-202ENST00000397118 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
ALX1Q15699 CBS-204ENST00000398165 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
ALX1Q15699 TBC1D3G-201ENST00000569055 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
ALX1Q15699 TBC1D3H-201ENST00000610350 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
ALX1Q15699 TBC1D3L-202ENST00000617678 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
ALX1Q15699 UBE3B-212ENST00000540230 1541 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
ALX1Q15699 CCNA2-202ENST00000618014 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
ALX1Q15699 TMEM198B-203ENST00000482378 2230 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
ALX1Q15699 CHD1L-203ENST00000369259 2358 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
ALX1Q15699 TP73-208ENST00000378295 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
ALX1Q15699 LSS-205ENST00000457828 4390 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
ALX1Q15699 PEMT-203ENST00000395782 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
ALX1Q15699 C15orf48-202ENST00000396650 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
ALX1Q15699 TRA2B-205ENST00000453386 2952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
ALX1Q15699 PRPS2-205ENST00000489404 763 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
ALX1Q15699 CEP57L1-208ENST00000519095 908 ntTSL 3 BASIC17.94■□□□□ 0.46
ALX1Q15699 FLJ27354-203ENST00000526694 851 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
ALX1Q15699 ATXN2-AS-201ENST00000547021 485 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
ALX1Q15699 GLIS2-AS1-201ENST00000576080 340 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
ALX1Q15699 SPECC1-223ENST00000584527 940 ntTSL 3 BASIC17.94■□□□□ 0.46
ALX1Q15699 YIF1B-216ENST00000592694 1181 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
ALX1Q15699 AC008750.3-201ENST00000601148 437 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
ALX1Q15699 UBE2E3-205ENST00000602475 602 ntTSL 3 BASIC17.94■□□□□ 0.46
ALX1Q15699 AC017083.2-201ENST00000608069 979 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
ALX1Q15699 ARL8B-208ENST00000611208 2981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
ALX1Q15699 EGLN3-201ENST00000250457 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
ALX1Q15699 LINC01185-202ENST00000452343 1705 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
ALX1Q15699 AC005885.1-204ENST00000637885 2885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
ALX1Q15699 PRPSAP2-216ENST00000536323 1872 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
ALX1Q15699 ATF7-205ENST00000548446 1892 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
ALX1Q15699 ANXA8L1-208ENST00000622769 1861 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
ALX1Q15699 TUBA8-202ENST00000330423 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
ALX1Q15699 CYB5R3-205ENST00000407623 2153 ntTSL 3 BASIC17.94■□□□□ 0.46
ALX1Q15699 POFUT2-214ENST00000615172 2472 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
ALX1Q15699 RAB11FIP5-205ENST00000486777 6120 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
ALX1Q15699 NUP88-207ENST00000573584 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
ALX1Q15699 AC118344.1-201ENST00000378432 1462 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
ALX1Q15699 STK24-203ENST00000397517 4578 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
ALX1Q15699 ATG10-203ENST00000458350 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
ALX1Q15699 ZNF764-202ENST00000395091 2970 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
ALX1Q15699 PLPPR4-203ENST00000457765 4846 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
ALX1Q15699 NDRG1-202ENST00000414097 3755 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
ALX1Q15699 SPAG6-201ENST00000313311 2421 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
ALX1Q15699 KAT8-201ENST00000219797 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
ALX1Q15699 RAB5B-202ENST00000448789 1530 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
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