Protein–RNA interactions for Protein: Q149N8

SHPRH, E3 ubiquitin-protein ligase SHPRH, humanhuman

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Length 1,683 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SHPRHQ149N8 RN7SKP175-201ENST00000408472 289 ntBASIC20.69■□□□□ 0.9
SHPRHQ149N8 AL591242.1-203ENST00000434329 374 ntTSL 3 BASIC20.69■□□□□ 0.9
SHPRHQ149N8 RN7SL258P-201ENST00000478664 300 ntBASIC20.69■□□□□ 0.9
SHPRHQ149N8 AC130709.1-201ENST00000484779 1212 ntBASIC20.69■□□□□ 0.9
SHPRHQ149N8 AC008406.1-201ENST00000509530 541 ntTSL 3 BASIC20.69■□□□□ 0.9
SHPRHQ149N8 LINC02440-201ENST00000545276 680 ntTSL 2 BASIC20.69■□□□□ 0.9
SHPRHQ149N8 MIR5196-201ENST00000578146 115 ntBASIC20.69■□□□□ 0.9
SHPRHQ149N8 AL161773.1-201ENST00000624845 863 ntBASIC20.69■□□□□ 0.9
SHPRHQ149N8 PLS3-210ENST00000626746 216 ntTSL 4 BASIC20.69■□□□□ 0.9
SHPRHQ149N8 MBD3L2B-201ENST00000636986 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
SHPRHQ149N8 AL035460.1-201ENST00000380593 1866 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.69■□□□□ 0.9
SHPRHQ149N8 UGDH-202ENST00000501493 2826 ntTSL 2 BASIC20.69■□□□□ 0.9
SHPRHQ149N8 GHRLOS-201ENST00000439539 1708 ntTSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
SHPRHQ149N8 TBXAS1-201ENST00000336425 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
SHPRHQ149N8 SEMA4F-201ENST00000339773 2177 ntTSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
SHPRHQ149N8 B4GALT3-201ENST00000319769 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
SHPRHQ149N8 C11orf16-201ENST00000326053 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
SHPRHQ149N8 HOXD3-202ENST00000410016 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.69■□□□□ 0.9
SHPRHQ149N8 CCDC40-202ENST00000374876 2010 ntTSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
SHPRHQ149N8 TLK2-201ENST00000326270 3512 ntTSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
SHPRHQ149N8 P3H1-202ENST00000296388 2585 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
SHPRHQ149N8 AL158070.2-201ENST00000623713 1621 ntBASIC20.68■□□□□ 0.9
SHPRHQ149N8 MRPL23-204ENST00000397297 613 ntTSL 2 BASIC20.68■□□□□ 0.9
SHPRHQ149N8 BUD31-202ENST00000403633 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
SHPRHQ149N8 MRAS-205ENST00000474559 856 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.68■□□□□ 0.9
SHPRHQ149N8 AC084346.1-201ENST00000520962 528 ntTSL 4 BASIC20.68■□□□□ 0.9
SHPRHQ149N8 AC145207.8-201ENST00000580897 563 ntTSL 4 BASIC20.68■□□□□ 0.9
SHPRHQ149N8 AC103810.10-201ENST00000606504 343 ntBASIC20.68■□□□□ 0.9
SHPRHQ149N8 ROPN1-211ENST00000620893 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
SHPRHQ149N8 UCP2-201ENST00000310473 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
SHPRHQ149N8 KAT7-210ENST00000509773 1774 ntTSL 2 BASIC20.68■□□□□ 0.9
SHPRHQ149N8 CEACAM19-202ENST00000403660 1982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
SHPRHQ149N8 HNF1B-207ENST00000621123 1971 ntTSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
SHPRHQ149N8 EMILIN3-201ENST00000332312 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
SHPRHQ149N8 RRP1-207ENST00000497547 3022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
SHPRHQ149N8 TERT-202ENST00000334602 3210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
SHPRHQ149N8 FAM151A-202ENST00000371304 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.68■□□□□ 0.9
SHPRHQ149N8 MPDU1-201ENST00000250124 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
SHPRHQ149N8 PCCB-204ENST00000462637 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.68■□□□□ 0.9
SHPRHQ149N8 AC061961.1-201ENST00000443901 432 ntTSL 3 BASIC20.67■□□□□ 0.9
SHPRHQ149N8 AC018761.2-201ENST00000585496 296 ntTSL 3 BASIC20.67■□□□□ 0.9
SHPRHQ149N8 ACTL8-201ENST00000375406 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
SHPRHQ149N8 HIBCH-202ENST00000392332 2463 ntTSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
SHPRHQ149N8 NSD3-201ENST00000316985 3995 ntTSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
SHPRHQ149N8 SKOR1-203ENST00000554054 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.67■□□□□ 0.9
SHPRHQ149N8 RANBP9-201ENST00000011619 3113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
SHPRHQ149N8 C12orf29-201ENST00000356891 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
SHPRHQ149N8 ORMDL3-204ENST00000579695 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
SHPRHQ149N8 BRAP-201ENST00000327551 1947 ntTSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
SHPRHQ149N8 AP001122.1-202ENST00000501648 1916 ntTSL 2 BASIC20.67■□□□□ 0.9
SHPRHQ149N8 TEX264-201ENST00000341333 1340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
SHPRHQ149N8 AC132872.4-202ENST00000622924 2756 ntBASIC20.67■□□□□ 0.9
SHPRHQ149N8 SYBU-205ENST00000422135 3226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.67■□□□□ 0.9
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SHPRHQ149N8 BPGM-201ENST00000344924 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
SHPRHQ149N8 CKMT1A-204ENST00000434505 1779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.67■□□□□ 0.9
SHPRHQ149N8 SLC25A19-205ENST00000442286 1496 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.67■□□□□ 0.9
SHPRHQ149N8 MTMR12-203ENST00000382142 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
SHPRHQ149N8 RASGRP2-206ENST00000377494 2983 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.67■□□□□ 0.9
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SHPRHQ149N8 POLR2H-203ENST00000430783 1159 ntTSL 2 BASIC20.67■□□□□ 0.9
SHPRHQ149N8 SNHG17-208ENST00000456953 546 ntTSL 3 BASIC20.67■□□□□ 0.9
SHPRHQ149N8 HTATIP2-205ENST00000530266 713 ntTSL 3 BASIC20.67■□□□□ 0.9
SHPRHQ149N8 AC026803.1-201ENST00000569130 274 ntBASIC20.67■□□□□ 0.9
SHPRHQ149N8 PAM16-211ENST00000575848 518 ntTSL 3 BASIC20.67■□□□□ 0.9
SHPRHQ149N8 PAM16-214ENST00000576217 493 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.67■□□□□ 0.9
SHPRHQ149N8 MIR4683-201ENST00000579659 81 ntBASIC20.67■□□□□ 0.9
SHPRHQ149N8 ETV2-207ENST00000619399 994 ntTSL 5 BASIC20.67■□□□□ 0.9
SHPRHQ149N8 CKMT1A-208ENST00000626814 1073 ntTSL 5 BASIC20.67■□□□□ 0.9
SHPRHQ149N8 ZNF620-202ENST00000418905 2022 ntTSL 2 BASIC20.67■□□□□ 0.9
SHPRHQ149N8 CEP70-213ENST00000489254 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.67■□□□□ 0.9
SHPRHQ149N8 PPTC7-201ENST00000354300 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
SHPRHQ149N8 STX6-204ENST00000542060 4809 ntTSL 2 BASIC20.66■□□□□ 0.9
SHPRHQ149N8 PSMD14-201ENST00000409682 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
SHPRHQ149N8 CBWD5-204ENST00000377392 2863 ntTSL 2 BASIC20.66■□□□□ 0.9
SHPRHQ149N8 TDRKH-204ENST00000368825 2651 ntTSL 2 BASIC20.66■□□□□ 0.9
SHPRHQ149N8 AC007495.1-201ENST00000501259 2678 ntTSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
SHPRHQ149N8 JRK-203ENST00000571961 2687 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
SHPRHQ149N8 KRT8P21-201ENST00000430398 1491 ntBASIC20.66■□□□□ 0.9
SHPRHQ149N8 ZNF821-203ENST00000446827 1822 ntTSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
SHPRHQ149N8 MAP2K3-201ENST00000316920 1246 ntTSL 5 BASIC20.66■□□□□ 0.9
SHPRHQ149N8 RPL5P21-201ENST00000404620 815 ntBASIC20.66■□□□□ 0.9
SHPRHQ149N8 ADAMTSL1-210ENST00000431052 824 ntTSL 2 BASIC20.66■□□□□ 0.9
SHPRHQ149N8 IZUMO1R-202ENST00000440961 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.66■□□□□ 0.9
SHPRHQ149N8 MYLK-AS1-202ENST00000470449 760 ntTSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
SHPRHQ149N8 AC012158.2-201ENST00000536546 354 ntBASIC20.66■□□□□ 0.9
SHPRHQ149N8 MYOZ3-209ENST00000615557 1031 ntTSL 2 BASIC20.66■□□□□ 0.9
SHPRHQ149N8 AC244250.3-201ENST00000620749 366 ntBASIC20.66■□□□□ 0.9
SHPRHQ149N8 HTR4-213ENST00000631296 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
SHPRHQ149N8 AL590644.3-201ENST00000635428 1228 ntTSL 5 BASIC20.66■□□□□ 0.9
SHPRHQ149N8 HARS-205ENST00000457527 1896 ntTSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
SHPRHQ149N8 ZNF764-201ENST00000252797 2738 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
SHPRHQ149N8 TRAF3IP1-201ENST00000373327 4279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
SHPRHQ149N8 LINC00472-203ENST00000426635 2958 ntTSL 2 BASIC20.66■□□□□ 0.9
SHPRHQ149N8 GCK-203ENST00000395796 2539 ntTSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
SHPRHQ149N8 ARL6IP1-201ENST00000304414 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
SHPRHQ149N8 TIRAP-203ENST00000392680 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
SHPRHQ149N8 FAM222B-202ENST00000452648 2836 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.65■□□□□ 0.9
SHPRHQ149N8 YTHDF2-209ENST00000542507 2825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
SHPRHQ149N8 KRT23-201ENST00000209718 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
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