Protein–RNA interactions for Protein: Q14596

NBR1, Next to BRCA1 gene 1 protein, humanhuman

Predictions only

Length 966 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NBR1Q14596 MBD1-209ENST00000398495 2178 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
NBR1Q14596 FAM218A-201ENST00000513876 2175 ntAPPRIS P1 BASIC19.1■□□□□ 0.65
NBR1Q14596 TMEM47-201ENST00000275954 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
NBR1Q14596 PARP1-203ENST00000366794 3958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
NBR1Q14596 FANCA-203ENST00000389302 1641 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
NBR1Q14596 CDHR5-203ENST00000397542 3489 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
NBR1Q14596 NUDT3-201ENST00000607016 9905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
NBR1Q14596 ZMYND15-201ENST00000269289 2448 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
NBR1Q14596 C2-206ENST00000442278 2434 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
NBR1Q14596 GABRG3-208ENST00000615808 10768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
NBR1Q14596 DDX31-202ENST00000372153 3285 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
NBR1Q14596 ABCB7-201ENST00000253577 2377 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
NBR1Q14596 ANKMY1-210ENST00000406958 2396 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
NBR1Q14596 CALR-201ENST00000316448 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
NBR1Q14596 PRMT2-207ENST00000440086 1932 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
NBR1Q14596 GPX3-209ENST00000614343 1478 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
NBR1Q14596 STEAP3-202ENST00000393107 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
NBR1Q14596 SLC9B2-202ENST00000394785 3126 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
NBR1Q14596 APOB-202ENST00000399256 3128 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
NBR1Q14596 ZMYM3-206ENST00000373988 6021 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
NBR1Q14596 MYO3A-201ENST00000265944 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
NBR1Q14596 PLEKHG2-206ENST00000458508 3898 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
NBR1Q14596 AC104109.2-201ENST00000602919 1418 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
NBR1Q14596 KIRREL1-204ENST00000368173 7519 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
NBR1Q14596 MAPT-IT1-201ENST00000624111 3016 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
NBR1Q14596 ISY1-203ENST00000393295 3842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
NBR1Q14596 AC092535.1-201ENST00000417557 2165 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
NBR1Q14596 BUD13-202ENST00000375445 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
NBR1Q14596 TET2-207ENST00000513237 10166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
NBR1Q14596 TET2-209ENST00000540549 10166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
NBR1Q14596 MUTYH-209ENST00000448481 1706 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
NBR1Q14596 DHRS7-212ENST00000611054 1321 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
NBR1Q14596 AC011474.4-201ENST00000623523 2076 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
NBR1Q14596 TOMM40L-209ENST00000545897 2807 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
NBR1Q14596 CTSG-201ENST00000216336 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
NBR1Q14596 DCD-201ENST00000293371 645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
NBR1Q14596 MCFD2-205ENST00000409218 648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
NBR1Q14596 YIPF7-202ENST00000415895 1196 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
NBR1Q14596 TSPY3-202ENST00000440483 414 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
NBR1Q14596 VN2R19P-201ENST00000442399 1052 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
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NBR1Q14596 CNOT8-225ENST00000524105 904 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
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NBR1Q14596 CD63-204ENST00000546939 779 ntTSL 3 BASIC19.09■□□□□ 0.65
NBR1Q14596 HEXA-210ENST00000567213 1000 ntTSL 3 BASIC19.09■□□□□ 0.65
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NBR1Q14596 AC062028.1-203ENST00000447433 1472 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
NBR1Q14596 NDRG2-226ENST00000554104 2146 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
NBR1Q14596 PANX2-202ENST00000395842 3051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
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NBR1Q14596 SYDE1-201ENST00000342784 3264 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
NBR1Q14596 COL6A1-207ENST00000612273 3251 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
NBR1Q14596 STX10-201ENST00000242770 1099 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
NBR1Q14596 LST1-202ENST00000303757 604 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
NBR1Q14596 AQP12A-201ENST00000337801 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
NBR1Q14596 MUC1-204ENST00000343256 648 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
NBR1Q14596 OTOS-202ENST00000391989 645 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.08■□□□□ 0.64
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NBR1Q14596 EEF1E1-205ENST00000507463 654 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
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NBR1Q14596 PTHLH-207ENST00000539239 890 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
NBR1Q14596 RPL18-208ENST00000549920 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
NBR1Q14596 RPL18-209ENST00000550645 463 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
NBR1Q14596 RPL18-214ENST00000552588 559 ntTSL 3 BASIC19.08■□□□□ 0.64
NBR1Q14596 OVCA2-201ENST00000572195 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
NBR1Q14596 AC005412.3-201ENST00000580309 715 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
NBR1Q14596 STX10-204ENST00000587230 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
NBR1Q14596 SIGLEC29P-201ENST00000599873 1114 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
NBR1Q14596 TMIGD2-203ENST00000600114 489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
NBR1Q14596 PTENP1-AS-201ENST00000627688 873 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
NBR1Q14596 PSMA6-216ENST00000627895 484 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
NBR1Q14596 DAB2IP-202ENST00000309989 3500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
NBR1Q14596 MAP3K4-204ENST00000392142 5490 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
NBR1Q14596 KIFC3-204ENST00000465878 3225 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
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