Protein–RNA interactions for Protein: Q14164

IKBKE, Inhibitor of nuclear factor kappa-B kinase subunit epsilon, humanhuman

Predictions only

Length 716 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IKBKEQ14164 MIR3907-201ENST00000579424 151 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
IKBKEQ14164 CROCCP3-204ENST00000590118 574 ntTSL 4 BASIC16.53■□□□□ 0.24
IKBKEQ14164 TUBB4A-212ENST00000601152 590 ntTSL 4 BASIC16.53■□□□□ 0.24
IKBKEQ14164 SPCS2P2-201ENST00000603270 608 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
IKBKEQ14164 AL645939.5-201ENST00000606834 243 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
IKBKEQ14164 HPSE2-205ENST00000614306 447 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
IKBKEQ14164 AC138466.3-201ENST00000619983 221 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
IKBKEQ14164 AC022748.3-201ENST00000621828 275 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
IKBKEQ14164 AC128714.1-201ENST00000637035 887 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
IKBKEQ14164 WASHC2C-204ENST00000374362 4623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
IKBKEQ14164 EYA2-208ENST00000497062 2384 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
IKBKEQ14164 JAK3-201ENST00000458235 5432 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
IKBKEQ14164 EHF-212ENST00000533754 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
IKBKEQ14164 GSDMA-203ENST00000635792 1546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
IKBKEQ14164 SPATA21-201ENST00000335496 2015 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
IKBKEQ14164 NIPAL3-204ENST00000374399 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
IKBKEQ14164 ZNF346-202ENST00000503039 2774 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
IKBKEQ14164 GTF2H1-203ENST00000453096 2707 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
IKBKEQ14164 NDUFA6-AS1-203ENST00000439129 2950 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
IKBKEQ14164 ARL6IP1-201ENST00000304414 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
IKBKEQ14164 AC092364.2-201ENST00000596710 2692 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
IKBKEQ14164 TNIP1-202ENST00000389378 2935 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
IKBKEQ14164 PPP1CA-201ENST00000312989 1389 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
IKBKEQ14164 C16orf89-201ENST00000315997 1872 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
IKBKEQ14164 COL23A1-202ENST00000407622 2329 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
IKBKEQ14164 BFSP2-201ENST00000302334 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
IKBKEQ14164 MTHFR-217ENST00000641820 1569 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
IKBKEQ14164 MTDH-201ENST00000336273 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
IKBKEQ14164 MAD1L1-202ENST00000399654 2762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
IKBKEQ14164 ELK1-203ENST00000376983 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
IKBKEQ14164 PAX3-206ENST00000392070 2258 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
IKBKEQ14164 HGNC:18790-203ENST00000433139 2254 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
IKBKEQ14164 ZKSCAN7-202ENST00000341840 1757 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
IKBKEQ14164 HSD17B6-205ENST00000554643 1751 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
IKBKEQ14164 AC055811.4-201ENST00000624039 1754 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
IKBKEQ14164 C2CD4A-201ENST00000355522 3445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
IKBKEQ14164 RAP1GAP2-209ENST00000637138 3175 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
IKBKEQ14164 RAB40AL-201ENST00000218249 1029 ntAPPRIS P1 BASIC16.52■□□□□ 0.24
IKBKEQ14164 MAX-201ENST00000246163 897 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
IKBKEQ14164 SRP14-201ENST00000267884 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
IKBKEQ14164 TPRKB-202ENST00000318190 819 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
IKBKEQ14164 AC091046.1-201ENST00000331871 207 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
IKBKEQ14164 SPAG11A-203ENST00000351436 534 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
IKBKEQ14164 SPAG11B-204ENST00000361111 534 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
IKBKEQ14164 TMEM210-201ENST00000413619 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
IKBKEQ14164 TMEM243-202ENST00000423734 601 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
IKBKEQ14164 AC013355.1-201ENST00000562625 723 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
IKBKEQ14164 RN7SL163P-201ENST00000583100 276 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
IKBKEQ14164 NAT9-224ENST00000583757 583 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
IKBKEQ14164 PPP1R21-202ENST00000294952 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
IKBKEQ14164 HS3ST3B1-201ENST00000360954 5367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
IKBKEQ14164 CYP11A1-201ENST00000268053 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
IKBKEQ14164 GPR89B-201ENST00000314163 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
IKBKEQ14164 CDC42EP4-201ENST00000335793 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
IKBKEQ14164 ESRRB-207ENST00000556177 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
IKBKEQ14164 B3GNT4-206ENST00000546192 2749 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
IKBKEQ14164 ARHGEF28-211ENST00000512883 2936 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
IKBKEQ14164 APLP1-202ENST00000537454 2266 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
IKBKEQ14164 BDP1-202ENST00000380675 2861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
IKBKEQ14164 MINDY1-201ENST00000312210 2400 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
IKBKEQ14164 USP37-202ENST00000338465 1771 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
IKBKEQ14164 MPP3-201ENST00000398389 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
IKBKEQ14164 SCRIB-202ENST00000356994 5218 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
IKBKEQ14164 TUBA3D-201ENST00000321253 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
IKBKEQ14164 FOXN1-203ENST00000579795 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
IKBKEQ14164 AC104809.1-201ENST00000425110 2345 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
IKBKEQ14164 C5orf24-204ENST00000504727 2923 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
IKBKEQ14164 SLC25A45-202ENST00000398802 2286 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
IKBKEQ14164 CMKLR1-206ENST00000552995 1890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
IKBKEQ14164 NID1-202ENST00000366595 5412 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
IKBKEQ14164 B9D1-202ENST00000268841 755 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
IKBKEQ14164 SYCE2-201ENST00000293695 1231 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
IKBKEQ14164 MRPS12-201ENST00000308018 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
IKBKEQ14164 RPP40-201ENST00000319533 1088 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
IKBKEQ14164 DUSP13-202ENST00000372700 781 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
IKBKEQ14164 FAM177A1-202ENST00000382406 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
IKBKEQ14164 IGHV3-21-201ENST00000390607 430 ntAPPRIS P1 BASIC16.51■□□□□ 0.23
IKBKEQ14164 KLK8-204ENST00000391806 1051 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
IKBKEQ14164 GATD1-203ENST00000397472 790 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
IKBKEQ14164 AL645608.5-201ENST00000398216 443 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
IKBKEQ14164 CD8A-204ENST00000409781 597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
IKBKEQ14164 LINC02158-201ENST00000432377 897 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
IKBKEQ14164 RNMTL1P1-201ENST00000454103 560 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
IKBKEQ14164 TUBB8P8-201ENST00000458717 1058 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
IKBKEQ14164 PGRMC2-206ENST00000512483 1144 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
IKBKEQ14164 AC024681.1-201ENST00000521917 487 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
IKBKEQ14164 MRNIP-220ENST00000523084 1096 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
IKBKEQ14164 EID1-202ENST00000560490 584 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
IKBKEQ14164 AC016044.1-201ENST00000560818 572 ntTSL 4 BASIC16.51■□□□□ 0.23
IKBKEQ14164 TMEM208-207ENST00000563953 887 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
IKBKEQ14164 C20orf141-202ENST00000603872 580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
IKBKEQ14164 AC026740.1-201ENST00000607068 791 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
IKBKEQ14164 AC004923.1-202ENST00000642106 209 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
IKBKEQ14164 ELAC1-201ENST00000269466 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
IKBKEQ14164 ZCCHC3-201ENST00000500893 3354 ntAPPRIS P1 BASIC16.51■□□□□ 0.23
IKBKEQ14164 MYB-242ENST00000618728 3545 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
IKBKEQ14164 CCDC83-201ENST00000280245 2358 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
IKBKEQ14164 HCN1-201ENST00000303230 9885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
IKBKEQ14164 C14orf93-207ENST00000397382 1986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
IKBKEQ14164 CLMAT3-201ENST00000510576 1973 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.2 ms