Protein–RNA interactions for Protein: Q14003

KCNC3, Potassium voltage-gated channel subfamily C member 3, humanhuman

Predictions only

Length 757 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNC3Q14003 C11orf16-201ENST00000326053 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
KCNC3Q14003 AMOTL2-211ENST00000513145 2653 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
KCNC3Q14003 TPPP-201ENST00000360578 6022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
KCNC3Q14003 SELPLG-201ENST00000228463 1704 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
KCNC3Q14003 TTC29-202ENST00000398886 1729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
KCNC3Q14003 GATA6-201ENST00000269216 3770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
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KCNC3Q14003 MITF-204ENST00000352241 4814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
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KCNC3Q14003 CCDC140-201ENST00000295226 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
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KCNC3Q14003 GEM-202ENST00000396194 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
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KCNC3Q14003 HSF5-201ENST00000323777 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
KCNC3Q14003 TVP23C-203ENST00000428082 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
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KCNC3Q14003 NUDT1-202ENST00000343985 771 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
KCNC3Q14003 TPD52L2-207ENST00000369927 1094 ntTSL 4 BASIC15.92■□□□□ 0.14
KCNC3Q14003 EDF1-202ENST00000371648 809 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
KCNC3Q14003 AC073316.1-202ENST00000402115 988 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
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KCNC3Q14003 ADAMTSL1-210ENST00000431052 824 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
KCNC3Q14003 PABPC5-AS1-201ENST00000456187 426 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
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KCNC3Q14003 ADIG-204ENST00000537425 770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
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KCNC3Q14003 AL160314.3-201ENST00000556041 767 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
KCNC3Q14003 AL445483.1-201ENST00000568695 736 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
KCNC3Q14003 SNORD3B-2-202ENST00000571722 791 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
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KCNC3Q14003 AC020922.3-201ENST00000595064 547 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
KCNC3Q14003 TUBB4A-212ENST00000601152 590 ntTSL 4 BASIC15.91■□□□□ 0.14
KCNC3Q14003 NEAT1-203ENST00000601801 487 ntTSL 4 BASIC15.91■□□□□ 0.14
KCNC3Q14003 GPR89B-201ENST00000314163 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
KCNC3Q14003 GPS1-227ENST00000623761 1943 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
KCNC3Q14003 AL157791.1-201ENST00000553667 1699 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
KCNC3Q14003 CLPTM1-203ENST00000546079 2342 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
KCNC3Q14003 TRIM11-201ENST00000284551 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
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KCNC3Q14003 TK2-207ENST00000544898 3441 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
KCNC3Q14003 PLEKHB1-202ENST00000354190 2380 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
KCNC3Q14003 PCDH8P1-201ENST00000428983 2773 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
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