Protein–RNA interactions for Protein: Q13972

RASGRF1, Ras-specific guanine nucleotide-releasing factor 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,273 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RASGRF1Q13972 SERPINE2-202ENST00000409304 2161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
RASGRF1Q13972 C7orf31-201ENST00000283905 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
RASGRF1Q13972 PSMD13-215ENST00000621534 1572 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
RASGRF1Q13972 GNB2-202ENST00000393924 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
RASGRF1Q13972 SFRP1-201ENST00000220772 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
RASGRF1Q13972 ACSL1-208ENST00000507295 2490 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.53
RASGRF1Q13972 TBXAS1-208ENST00000448866 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
RASGRF1Q13972 PLEKHB2-207ENST00000438882 1460 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.53
RASGRF1Q13972 PLSCR4-204ENST00000446574 1442 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.53
RASGRF1Q13972 PAK1-210ENST00000528203 1878 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.53
RASGRF1Q13972 TMEM92-201ENST00000300433 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
RASGRF1Q13972 ROCK2-209ENST00000616279 6401 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
RASGRF1Q13972 ZMYND10-202ENST00000360165 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
RASGRF1Q13972 SPIN2A-201ENST00000374906 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
RASGRF1Q13972 KCNJ18-201ENST00000567955 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
RASGRF1Q13972 DDX19A-202ENST00000417604 1703 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
RASGRF1Q13972 NAGK-201ENST00000244204 1154 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
RASGRF1Q13972 IFNL2-201ENST00000331982 737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
RASGRF1Q13972 ANAPC11-202ENST00000357385 881 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
RASGRF1Q13972 TREM2-203ENST00000373122 1012 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
RASGRF1Q13972 NQO2-202ENST00000380430 1098 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
RASGRF1Q13972 C9orf116-205ENST00000429260 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
RASGRF1Q13972 AL162457.2-202ENST00000442888 679 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
RASGRF1Q13972 AL356489.1-201ENST00000449144 1144 ntTSL 3 BASIC18.33■□□□□ 0.52
RASGRF1Q13972 GDNF-AS1-201ENST00000503382 604 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
RASGRF1Q13972 FAM8A2P-201ENST00000528813 1142 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
RASGRF1Q13972 BLOC1S1-205ENST00000551926 531 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
RASGRF1Q13972 RNF41-210ENST00000552244 716 ntTSL 3 BASIC18.33■□□□□ 0.52
RASGRF1Q13972 AC110285.3-201ENST00000574472 665 ntTSL 3 BASIC18.33■□□□□ 0.52
RASGRF1Q13972 THAP4-206ENST00000612200 969 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
RASGRF1Q13972 FP565260.5-201ENST00000623188 479 ntTSL 3 BASIC18.33■□□□□ 0.52
RASGRF1Q13972 LBX1-201ENST00000370193 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
RASGRF1Q13972 MAPKAP1-206ENST00000373511 3252 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
RASGRF1Q13972 MLLT3-210ENST00000630269 2040 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
RASGRF1Q13972 GP5-201ENST00000401815 3534 ntAPPRIS P1 BASIC18.33■□□□□ 0.52
RASGRF1Q13972 LINC00658-202ENST00000420529 1542 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
RASGRF1Q13972 GATAD2A-202ENST00000360315 5671 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
RASGRF1Q13972 STARD7-201ENST00000337288 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
RASGRF1Q13972 TSC22D3-201ENST00000315660 2213 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
RASGRF1Q13972 ASAH1-249ENST00000637528 2215 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
RASGRF1Q13972 AP4M1-201ENST00000359593 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
RASGRF1Q13972 AP4M1-206ENST00000429084 1836 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
RASGRF1Q13972 PTGES3L-AARSD1-204ENST00000421990 2150 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
RASGRF1Q13972 CERS6-201ENST00000305747 7217 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
RASGRF1Q13972 MFSD1-203ENST00000415822 2423 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
RASGRF1Q13972 ARMC8-220ENST00000489213 1714 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
RASGRF1Q13972 PSMC3-212ENST00000602866 1373 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
RASGRF1Q13972 AC020907.1-201ENST00000616460 1350 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
RASGRF1Q13972 GATA4-201ENST00000335135 3414 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
RASGRF1Q13972 ATG9A-205ENST00000409618 4025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
RASGRF1Q13972 GATA4-206ENST00000528712 2614 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
RASGRF1Q13972 BET1L-201ENST00000325147 2916 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
RASGRF1Q13972 SYT3-201ENST00000338916 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
RASGRF1Q13972 ANGPTL8-201ENST00000252453 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
RASGRF1Q13972 RAB4B-201ENST00000357052 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
RASGRF1Q13972 UROS-203ENST00000368786 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
RASGRF1Q13972 LENEP-202ENST00000392487 555 ntAPPRIS P1 BASIC18.32■□□□□ 0.52
RASGRF1Q13972 DYNC1I1-203ENST00000413338 958 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
RASGRF1Q13972 LINC01762-204ENST00000434879 436 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
RASGRF1Q13972 CHMP1AP1-201ENST00000445563 662 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
RASGRF1Q13972 HSPB1P2-201ENST00000448722 546 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
RASGRF1Q13972 HIST2H2BB-201ENST00000449108 381 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
RASGRF1Q13972 TMEM14B-210ENST00000473276 730 ntTSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
RASGRF1Q13972 AC099548.2-209ENST00000480264 625 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
RASGRF1Q13972 COX14-203ENST00000550487 739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
RASGRF1Q13972 AF111167.2-202ENST00000558267 599 ntTSL 4 BASIC18.32■□□□□ 0.52
RASGRF1Q13972 RPS15-202ENST00000585665 467 ntTSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
RASGRF1Q13972 ANGPTL8-203ENST00000591200 504 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
RASGRF1Q13972 AC008403.1-201ENST00000595676 443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
RASGRF1Q13972 OCEL1-213ENST00000601529 942 ntTSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
RASGRF1Q13972 ZACNP1-201ENST00000612259 710 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
RASGRF1Q13972 TMEM14B-220ENST00000612333 888 ntTSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
RASGRF1Q13972 ANGPTL8-204ENST00000616433 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
RASGRF1Q13972 MIR6787-201ENST00000616675 61 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
RASGRF1Q13972 EDDM13-208ENST00000637802 854 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
RASGRF1Q13972 FOXE1-201ENST00000375123 3462 ntAPPRIS P1 BASIC18.32■□□□□ 0.52
RASGRF1Q13972 INTS14-204ENST00000442903 1863 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
RASGRF1Q13972 SCUBE2-207ENST00000520467 3148 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
RASGRF1Q13972 TUBGCP2-204ENST00000417178 4029 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
RASGRF1Q13972 ATP6V0A1-204ENST00000537728 2774 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
RASGRF1Q13972 MPPED1-202ENST00000417669 3657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
RASGRF1Q13972 ZNF750-202ENST00000572562 1513 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
RASGRF1Q13972 ARMC5-204ENST00000538189 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
RASGRF1Q13972 SLC35A1-202ENST00000369556 1720 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
RASGRF1Q13972 CRELD1-203ENST00000397170 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
RASGRF1Q13972 CXADR-201ENST00000284878 6254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
RASGRF1Q13972 MAP2K7-201ENST00000397979 3361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
RASGRF1Q13972 CGGBP1-201ENST00000309534 4495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
RASGRF1Q13972 ACE-202ENST00000290866 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
RASGRF1Q13972 NSFL1C-201ENST00000216879 3568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
RASGRF1Q13972 PI4KAP1-201ENST00000610959 2425 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
RASGRF1Q13972 STK24-203ENST00000397517 4578 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
RASGRF1Q13972 SSFA2-201ENST00000320370 4965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
RASGRF1Q13972 ANKRD24-202ENST00000318934 3906 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
RASGRF1Q13972 SLAIN2-201ENST00000264313 6299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
RASGRF1Q13972 HDHD3-201ENST00000238379 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
RASGRF1Q13972 TYSND1-201ENST00000287078 3644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
RASGRF1Q13972 PLVAP-201ENST00000252590 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
RASGRF1Q13972 CTHRC1-201ENST00000330295 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
RASGRF1Q13972 MUC1-202ENST00000338684 1107 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 63.3 ms