Protein–RNA interactions for Protein: Q13790

APOF, Apolipoprotein F, humanhuman

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Length 326 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOFQ13790 LRRC20-204ENST00000373224 3095 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.28□□□□□ -0.12
APOFQ13790 MAP7-204ENST00000454590 3119 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.28□□□□□ -0.12
APOFQ13790 LINC01725-203ENST00000417975 3177 ntTSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
APOFQ13790 SFSWAP-210ENST00000541286 3219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
APOFQ13790 CTXND1-201ENST00000560778 6890 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.28□□□□□ -0.12
APOFQ13790 AC007326.2-201ENST00000624224 7579 ntBASIC14.28□□□□□ -0.12
APOFQ13790 IRF4-201ENST00000380956 5331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
APOFQ13790 SNAP29-201ENST00000215730 4287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
APOFQ13790 CBX6-201ENST00000216083 3191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.28□□□□□ -0.12
APOFQ13790 AC004870.1-201ENST00000315132 882 ntBASIC14.28□□□□□ -0.12
APOFQ13790 PHKG2-201ENST00000328273 1536 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.28□□□□□ -0.12
APOFQ13790 UNC5A-201ENST00000329542 3812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
APOFQ13790 NF2-205ENST00000361452 5884 ntTSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
APOFQ13790 IDH3G-203ENST00000370093 1662 ntTSL 2 BASIC14.28□□□□□ -0.12
APOFQ13790 ACADM-202ENST00000370841 2619 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
APOFQ13790 SLC35C2-203ENST00000372227 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
APOFQ13790 FOXP3-201ENST00000376197 1326 ntTSL 2 BASIC14.28□□□□□ -0.12
APOFQ13790 ADCY8-202ENST00000377928 3363 ntTSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
APOFQ13790 SLC22A23-202ENST00000380302 2883 ntTSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
APOFQ13790 ZFP82-201ENST00000392161 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
APOFQ13790 AP1S3-202ENST00000396653 589 ntTSL 4 BASIC14.28□□□□□ -0.12
APOFQ13790 ITGB2-208ENST00000397857 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.28□□□□□ -0.12
APOFQ13790 CYTH4-203ENST00000405206 636 ntTSL 4 BASIC14.28□□□□□ -0.12
APOFQ13790 CES1P1-201ENST00000421606 1704 ntBASIC14.28□□□□□ -0.12
APOFQ13790 SLC2A4-202ENST00000424875 1852 ntTSL 2 BASIC14.28□□□□□ -0.12
APOFQ13790 AL451069.2-201ENST00000428814 297 ntTSL 3 BASIC14.28□□□□□ -0.12
APOFQ13790 SIGLEC8-203ENST00000430817 1528 ntTSL 2 BASIC14.28□□□□□ -0.12
APOFQ13790 CRCP-205ENST00000431089 942 ntTSL 2 BASIC14.28□□□□□ -0.12
APOFQ13790 COMMD5-203ENST00000450361 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
APOFQ13790 TPT1P11-201ENST00000458482 498 ntBASIC14.28□□□□□ -0.12
APOFQ13790 ILDR1-205ENST00000462014 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
APOFQ13790 RPS6KA2-204ENST00000481261 2297 ntTSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
APOFQ13790 BX890604.1-208ENST00000490920 726 ntTSL 2 BASIC14.28□□□□□ -0.12
APOFQ13790 MRPL49-203ENST00000526171 501 ntTSL 2 BASIC14.28□□□□□ -0.12
APOFQ13790 P2RX5-207ENST00000551178 1863 ntTSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
APOFQ13790 LGMN-211ENST00000555699 1728 ntTSL 5 BASIC14.28□□□□□ -0.12
APOFQ13790 AC018845.2-201ENST00000568326 409 ntBASIC14.28□□□□□ -0.12
APOFQ13790 AC024267.1-201ENST00000582320 895 ntBASIC14.28□□□□□ -0.12
APOFQ13790 AL691432.1-201ENST00000596308 1422 ntBASIC14.28□□□□□ -0.12
APOFQ13790 SIRT6-214ENST00000601488 1361 ntTSL 3 BASIC14.28□□□□□ -0.12
APOFQ13790 AC016727.1-203ENST00000603199 540 ntTSL 4 BASIC14.28□□□□□ -0.12
APOFQ13790 HMOX2-216ENST00000613539 1703 ntTSL 5 BASIC14.28□□□□□ -0.12
APOFQ13790 DIP2A-201ENST00000400274 7023 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.28□□□□□ -0.12
APOFQ13790 ATE1-202ENST00000369040 4803 ntTSL 2 BASIC14.28□□□□□ -0.12
APOFQ13790 SLC4A7-212ENST00000446700 4000 ntTSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
APOFQ13790 STK32B-201ENST00000282908 3582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
APOFQ13790 LRRC20-201ENST00000355790 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
APOFQ13790 AC019294.4-201ENST00000561777 2905 ntBASIC14.28□□□□□ -0.12
APOFQ13790 MCHR1-201ENST00000249016 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
APOFQ13790 NUTM2G-201ENST00000354649 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.28□□□□□ -0.12
APOFQ13790 AL356258.1-201ENST00000605929 2246 ntTSL 2 BASIC14.27□□□□□ -0.12
APOFQ13790 SNX2-201ENST00000379516 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
APOFQ13790 EDEM2-202ENST00000374492 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
APOFQ13790 EP400NL-206ENST00000446190 3697 ntTSL 2 BASIC14.27□□□□□ -0.12
APOFQ13790 SNRPD3-201ENST00000215829 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
APOFQ13790 GTPBP8-202ENST00000383677 1787 ntTSL 3 BASIC14.27□□□□□ -0.12
APOFQ13790 PEPD-202ENST00000397032 1754 ntTSL 2 BASIC14.27□□□□□ -0.12
APOFQ13790 DNMT3L-201ENST00000270172 1706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
APOFQ13790 COPS3-201ENST00000268717 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
APOFQ13790 SWAP70-201ENST00000318950 4882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
APOFQ13790 FAM84A-201ENST00000295092 6355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
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APOFQ13790 NDRG4-221ENST00000563799 3014 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.27□□□□□ -0.12
APOFQ13790 IGDCC3-201ENST00000327987 4479 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
APOFQ13790 GPX3-209ENST00000614343 1478 ntTSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
APOFQ13790 CMPK1-203ENST00000371873 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
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APOFQ13790 IGFBP5-201ENST00000233813 6215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
APOFQ13790 TIMP2-201ENST00000262768 3652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
APOFQ13790 BEND3P3-201ENST00000611030 2440 ntBASIC14.27□□□□□ -0.13
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APOFQ13790 TP53I11-222ENST00000616990 3567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.27□□□□□ -0.13
APOFQ13790 GSPT1-202ENST00000434724 7105 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
APOFQ13790 UHRF1BP1-202ENST00000452449 4706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.27□□□□□ -0.13
APOFQ13790 GNAS-215ENST00000371102 3438 ntTSL 5 BASIC14.27□□□□□ -0.13
APOFQ13790 RBM47-203ENST00000381795 4473 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.27□□□□□ -0.13
APOFQ13790 KIF3A-201ENST00000378735 3266 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
APOFQ13790 PITPNM2-AS1-201ENST00000506255 2191 ntTSL 2 BASIC14.27□□□□□ -0.13
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APOFQ13790 CALCB-203ENST00000533448 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.27□□□□□ -0.13
APOFQ13790 KIAA1468-202ENST00000398130 6178 ntTSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
APOFQ13790 OSBPL2-201ENST00000313733 4009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
APOFQ13790 NATD1-201ENST00000611551 4931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
APOFQ13790 FECH-201ENST00000262093 3853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
APOFQ13790 ALDH3A2-226ENST00000631291 3822 ntTSL 5 BASIC14.27□□□□□ -0.13
APOFQ13790 BOLL-203ENST00000392296 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
APOFQ13790 AC114271.1-201ENST00000612689 2813 ntBASIC14.27□□□□□ -0.13
APOFQ13790 FFAR4-202ENST00000371483 3653 ntTSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
APOFQ13790 NAA60-202ENST00000407558 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
APOFQ13790 AC097376.2-205ENST00000610159 5334 ntBASIC14.27□□□□□ -0.13
APOFQ13790 ALOX15B-201ENST00000380173 2605 ntTSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
APOFQ13790 PABPC1-201ENST00000318607 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
APOFQ13790 SMARCA2-203ENST00000349721 5761 ntTSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
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