Protein–RNA interactions for Protein: Q13772

NCOA4, Nuclear receptor coactivator 4, humanhuman

Predictions only

Length 614 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NCOA4Q13772 RHOG-203ENST00000396979 1289 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
NCOA4Q13772 DGCR6-202ENST00000413981 1039 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
NCOA4Q13772 COX5BP8-201ENST00000416911 349 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
NCOA4Q13772 NME2P1-201ENST00000426182 414 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
NCOA4Q13772 LACTB2-203ENST00000522447 1034 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
NCOA4Q13772 RHOG-204ENST00000533217 886 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
NCOA4Q13772 AC007569.1-201ENST00000550306 600 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
NCOA4Q13772 SPATA8-AS1-201ENST00000558722 465 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
NCOA4Q13772 LINC02109-201ENST00000565798 869 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
NCOA4Q13772 AC005253.2-201ENST00000593791 432 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
NCOA4Q13772 AC010319.3-201ENST00000597028 470 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
NCOA4Q13772 ATF5-205ENST00000600336 682 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
NCOA4Q13772 OAS1-202ENST00000445409 1684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
NCOA4Q13772 SCLT1-208ENST00000506368 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
NCOA4Q13772 COX10-201ENST00000261643 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
NCOA4Q13772 ELMOD1-201ENST00000265840 2852 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
NCOA4Q13772 PPP2R5D-202ENST00000394110 2894 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
NCOA4Q13772 HGSNAT-207ENST00000521576 2332 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
NCOA4Q13772 ZBED1P1-201ENST00000502364 1930 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
NCOA4Q13772 ARL5B-201ENST00000377275 7196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
NCOA4Q13772 INPP5B-204ENST00000373026 3230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
NCOA4Q13772 TC2N-206ENST00000556018 1770 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
NCOA4Q13772 SLC39A1-201ENST00000310483 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
NCOA4Q13772 NEK7-202ENST00000367385 4149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
NCOA4Q13772 LMF2-201ENST00000216080 2658 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
NCOA4Q13772 GNS-201ENST00000258145 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
NCOA4Q13772 RAB3IL1-201ENST00000301773 2125 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
NCOA4Q13772 RASA1-201ENST00000274376 3752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
NCOA4Q13772 CTNNBL1-209ENST00000621317 1990 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
NCOA4Q13772 SPAG1-202ENST00000388798 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
NCOA4Q13772 CAP1-205ENST00000372802 2964 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
NCOA4Q13772 CTSD-211ENST00000637387 1597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
NCOA4Q13772 JAKMIP1-205ENST00000410077 1835 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
NCOA4Q13772 REXO1L5P-201ENST00000622260 2098 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
NCOA4Q13772 EIF2S2-201ENST00000374980 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
NCOA4Q13772 CXorf40A-209ENST00000441248 2411 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
NCOA4Q13772 DUSP11-201ENST00000272444 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
NCOA4Q13772 MAGEA12-201ENST00000357916 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
NCOA4Q13772 SPDYE6-201ENST00000563237 1691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
NCOA4Q13772 C5orf38-207ENST00000515640 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
NCOA4Q13772 PCSK2-205ENST00000536609 2275 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
NCOA4Q13772 RCOR3-203ENST00000419091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
NCOA4Q13772 VANGL2-201ENST00000368061 5340 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
NCOA4Q13772 TSC1-202ENST00000403810 1507 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
NCOA4Q13772 TEX28-203ENST00000617225 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
NCOA4Q13772 NEDD1-213ENST00000557644 2367 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
NCOA4Q13772 SLC4A3-202ENST00000317151 4069 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
NCOA4Q13772 RNU1-114P-201ENST00000365297 166 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
NCOA4Q13772 KIAA0907-201ENST00000368319 1155 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
NCOA4Q13772 WDR38-201ENST00000373574 1252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
NCOA4Q13772 BRF1-202ENST00000379932 884 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
NCOA4Q13772 AL512384.1-201ENST00000406683 331 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
NCOA4Q13772 CC2D2B-203ENST00000423344 1241 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
NCOA4Q13772 AL929472.3-201ENST00000433474 700 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
NCOA4Q13772 AC093433.1-201ENST00000458048 571 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
NCOA4Q13772 KRBOX4-206ENST00000478600 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
NCOA4Q13772 LEPROTL1-204ENST00000518192 847 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
NCOA4Q13772 LSM1-203ENST00000520755 975 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
NCOA4Q13772 C14orf178-204ENST00000557011 474 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
NCOA4Q13772 AC005225.4-201ENST00000557330 545 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
NCOA4Q13772 AC009486.1-201ENST00000569860 813 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
NCOA4Q13772 IFT20-209ENST00000579419 787 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
NCOA4Q13772 ZNF180-204ENST00000586637 1023 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
NCOA4Q13772 AC012645.4-201ENST00000610691 1061 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
NCOA4Q13772 AP005019.2-201ENST00000615104 511 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
NCOA4Q13772 WDR45-230ENST00000634559 1192 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
NCOA4Q13772 TJP2-212ENST00000636438 4689 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
NCOA4Q13772 USP43-201ENST00000285199 4169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
NCOA4Q13772 AQP6-204ENST00000615425 2245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
NCOA4Q13772 PCDHGB8P-201ENST00000502926 1973 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
NCOA4Q13772 CD1B-201ENST00000368168 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
NCOA4Q13772 NUP88-207ENST00000573584 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
NCOA4Q13772 MBD1-222ENST00000590208 2913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
NCOA4Q13772 EID3-201ENST00000527879 1467 ntAPPRIS P1 BASIC16.47■□□□□ 0.23
NCOA4Q13772 RBFOX1-212ENST00000550418 4775 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
NCOA4Q13772 NMNAT3-201ENST00000296202 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
NCOA4Q13772 TC2N-201ENST00000340892 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
NCOA4Q13772 IL1RN-203ENST00000361779 1922 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
NCOA4Q13772 LRCH3-202ENST00000414675 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
NCOA4Q13772 COX10-AS1-202ENST00000449363 1944 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
NCOA4Q13772 KIF18B-204ENST00000593135 2745 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
NCOA4Q13772 PUS7-202ENST00000469408 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
NCOA4Q13772 ZNF276-201ENST00000289816 4589 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
NCOA4Q13772 CROT-201ENST00000331536 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
NCOA4Q13772 GJB6-202ENST00000356192 2131 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
NCOA4Q13772 NUCKS1-201ENST00000367142 6496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
NCOA4Q13772 CD300C-201ENST00000330793 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
NCOA4Q13772 CRHBP-201ENST00000274368 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
NCOA4Q13772 TMEM198B-201ENST00000471276 1958 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
NCOA4Q13772 PHRF1-203ENST00000416188 5227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
NCOA4Q13772 NKIRAS1-203ENST00000415901 1644 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
NCOA4Q13772 RHD-206ENST00000423810 1637 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
NCOA4Q13772 NEU3-206ENST00000532963 1643 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
NCOA4Q13772 ZNF19-208ENST00000565637 2612 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
NCOA4Q13772 COLGALT2-201ENST00000361927 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
NCOA4Q13772 SNX14-215ENST00000513865 2259 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
NCOA4Q13772 GABARAPL1-218ENST00000546017 2294 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
NCOA4Q13772 NPY-201ENST00000242152 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
NCOA4Q13772 NDUFB8-202ENST00000370320 684 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
NCOA4Q13772 CRYAA-203ENST00000398133 600 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48 ms