Protein–RNA interactions for Protein: Q13485

SMAD4, Mothers against decapentaplegic homolog 4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 552 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMAD4Q13485 TPST2-201ENST00000338754 5697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SMAD4Q13485 ILF3-AS1-201ENST00000591501 1983 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
SMAD4Q13485 SSC5D-202ENST00000587166 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SMAD4Q13485 SELENOS-201ENST00000398226 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SMAD4Q13485 SGCE-204ENST00000428696 1409 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SMAD4Q13485 SCN3B-202ENST00000392770 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SMAD4Q13485 THEMIS2-203ENST00000373925 1650 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SMAD4Q13485 OSGIN1-203ENST00000393306 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SMAD4Q13485 UGT3A2-204ENST00000513300 1924 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SMAD4Q13485 PCNA-202ENST00000379160 1359 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SMAD4Q13485 EIF2B4-206ENST00000451130 1633 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SMAD4Q13485 SMTNL1-202ENST00000527972 1649 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SMAD4Q13485 RBM4B-206ENST00000531036 1646 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SMAD4Q13485 ATP6AP2-213ENST00000636251 1877 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SMAD4Q13485 LENG8-209ENST00000616932 2825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SMAD4Q13485 SLC8A3-202ENST00000356921 5250 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SMAD4Q13485 CCDC184-201ENST00000316554 2343 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SMAD4Q13485 TAGLN3-201ENST00000273368 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SMAD4Q13485 THOC6-207ENST00000574549 1300 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SMAD4Q13485 FAM20A-205ENST00000592554 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SMAD4Q13485 GALNT11-205ENST00000430044 2727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SMAD4Q13485 CPEB3-203ENST00000614585 5789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SMAD4Q13485 MBP-201ENST00000354542 575 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SMAD4Q13485 RN7SKP230-201ENST00000365642 335 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
SMAD4Q13485 TP53I3-203ENST00000407482 747 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SMAD4Q13485 PSMA1-202ENST00000418988 1266 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SMAD4Q13485 LINC01433-201ENST00000419003 697 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SMAD4Q13485 MIR4435-2HG-204ENST00000419736 777 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SMAD4Q13485 AL020996.1-201ENST00000442055 435 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SMAD4Q13485 DCST1-AS1-201ENST00000452962 822 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SMAD4Q13485 ALG1L13P-202ENST00000519320 584 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
SMAD4Q13485 PPFIBP1-204ENST00000535047 875 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SMAD4Q13485 NUDT4P2-201ENST00000578341 546 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
SMAD4Q13485 SIGLEC18P-201ENST00000602271 909 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
SMAD4Q13485 KRTAP10-4-203ENST00000622352 1244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SMAD4Q13485 ASB3-202ENST00000394717 1734 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SMAD4Q13485 CRELD1-203ENST00000397170 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SMAD4Q13485 SIN3A-203ENST00000394949 4930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SMAD4Q13485 APBB3-205ENST00000412920 1455 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SMAD4Q13485 MANEAL-201ENST00000329006 1930 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SMAD4Q13485 PRMT5-203ENST00000397440 1907 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SMAD4Q13485 FAM234A-203ENST00000399932 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SMAD4Q13485 HERPUD1-201ENST00000300302 1862 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SMAD4Q13485 SLC29A2-202ENST00000357440 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SMAD4Q13485 STX17-205ENST00000525640 2523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SMAD4Q13485 SLC29A2-205ENST00000544554 2505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SMAD4Q13485 SCGN-202ENST00000377961 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SMAD4Q13485 DUSP4-201ENST00000240100 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SMAD4Q13485 ASTN2-205ENST00000361209 4622 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SMAD4Q13485 AC127383.1-201ENST00000444697 1800 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
SMAD4Q13485 MCMBP-201ENST00000360003 4169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SMAD4Q13485 COQ8A-201ENST00000366777 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SMAD4Q13485 TRAPPC11-201ENST00000334690 4552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SMAD4Q13485 AC004890.2-201ENST00000426347 2419 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SMAD4Q13485 CALCR-203ENST00000394441 1774 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SMAD4Q13485 MYO1B-204ENST00000392318 5082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SMAD4Q13485 SLC25A46-201ENST00000355943 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SMAD4Q13485 PCDHGC5-202ENST00000610789 2763 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SMAD4Q13485 EMILIN3-201ENST00000332312 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SMAD4Q13485 ENPP1-201ENST00000360971 7442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SMAD4Q13485 STMN1-203ENST00000399728 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SMAD4Q13485 TMEM51-204ENST00000428417 1942 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SMAD4Q13485 VSIG10L2-202ENST00000638636 2304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SMAD4Q13485 ARNTL-205ENST00000403510 2745 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SMAD4Q13485 PDE1C-206ENST00000396193 5109 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SMAD4Q13485 OLIG2-201ENST00000333337 3262 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SMAD4Q13485 IQCC-202ENST00000537469 2252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SMAD4Q13485 SEPT11-206ENST00000505788 2079 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SMAD4Q13485 C16orf89-201ENST00000315997 1872 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SMAD4Q13485 SPDEF-202ENST00000544425 1866 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SMAD4Q13485 LHCGR-202ENST00000401907 1477 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SMAD4Q13485 RAN-210ENST00000541630 1475 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SMAD4Q13485 HDDC2-202ENST00000398153 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SMAD4Q13485 AL391361.3-201ENST00000420601 379 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SMAD4Q13485 DUTP3-201ENST00000450025 415 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
SMAD4Q13485 ZAP70-202ENST00000451498 1085 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SMAD4Q13485 AC006122.1-201ENST00000493323 440 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
SMAD4Q13485 RN7SL81P-201ENST00000493781 261 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
SMAD4Q13485 TMCO5B-205ENST00000530020 894 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
SMAD4Q13485 DNAJB13-203ENST00000537753 912 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SMAD4Q13485 PIGH-209ENST00000559581 1049 ntTSL 4 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SMAD4Q13485 LINC02176-201ENST00000569104 598 ntTSL 4 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SMAD4Q13485 AC040162.4-201ENST00000574912 1185 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SMAD4Q13485 AC107464.3-201ENST00000609172 737 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
SMAD4Q13485 PAX4-207ENST00000611453 1235 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SMAD4Q13485 AP001527.2-201ENST00000614441 631 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
SMAD4Q13485 MYOZ3-209ENST00000615557 1031 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SMAD4Q13485 PDE8B-201ENST00000264917 5956 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SMAD4Q13485 ACTG1-208ENST00000575087 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SMAD4Q13485 ANTXR1-201ENST00000303714 5859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SMAD4Q13485 CES4A-206ENST00000540579 1825 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SMAD4Q13485 C14orf93-207ENST00000397382 1986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SMAD4Q13485 EIF1B-AS1-201ENST00000625390 1958 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SMAD4Q13485 BUD13-202ENST00000375445 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SMAD4Q13485 CLCN2-204ENST00000434054 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SMAD4Q13485 PITX2-205ENST00000394598 1906 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SMAD4Q13485 KPNA2-202ENST00000537025 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SMAD4Q13485 CASKIN2-201ENST00000321617 5015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SMAD4Q13485 UGDH-202ENST00000501493 2826 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SMAD4Q13485 CASZ1-202ENST00000377022 7936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
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