Protein–RNA interactions for Protein: Q13434

MKRN4P, Putative E3 ubiquitin-protein ligase makorin-4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 485 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MKRN4PQ13434 HOXB3-205ENST00000470495 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
MKRN4PQ13434 DAPK1-202ENST00000408954 5892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
MKRN4PQ13434 CDH15-201ENST00000289746 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
MKRN4PQ13434 SFRP1-201ENST00000220772 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
MKRN4PQ13434 PRKAG1-217ENST00000552212 1497 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
MKRN4PQ13434 LINC00942-201ENST00000515614 2417 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
MKRN4PQ13434 SNRPD3-201ENST00000215829 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
MKRN4PQ13434 AL034550.2-201ENST00000620523 1771 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
MKRN4PQ13434 SLAIN2-201ENST00000264313 6299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
MKRN4PQ13434 PELI2-201ENST00000267460 5909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
MKRN4PQ13434 SLC37A4-217ENST00000545985 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
MKRN4PQ13434 TTBK2-208ENST00000622375 6891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
MKRN4PQ13434 RRM2B-201ENST00000251810 4931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
MKRN4PQ13434 PDE1B-201ENST00000243052 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
MKRN4PQ13434 POMP-201ENST00000380842 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
MKRN4PQ13434 GCLC-213ENST00000616923 3694 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
MKRN4PQ13434 AC012321.1-201ENST00000561622 1588 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
MKRN4PQ13434 ARHGDIB-201ENST00000228945 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
MKRN4PQ13434 NUDT1-205ENST00000397048 783 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
MKRN4PQ13434 SUMF2-205ENST00000413756 1171 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
MKRN4PQ13434 AC136604.1-201ENST00000418535 575 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
MKRN4PQ13434 AL391069.1-201ENST00000422153 358 ntTSL 3 BASIC17.55■□□□□ 0.4
MKRN4PQ13434 MORF4L1P7-201ENST00000426038 703 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
MKRN4PQ13434 RPL37A-205ENST00000446558 495 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
MKRN4PQ13434 TMEM191A-209ENST00000452055 788 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
MKRN4PQ13434 AC000061.1-201ENST00000456270 376 ntTSL 3 BASIC17.55■□□□□ 0.4
MKRN4PQ13434 NSRP1-205ENST00000479218 540 ntTSL 3 BASIC17.55■□□□□ 0.4
MKRN4PQ13434 ROPN1-207ENST00000484329 566 ntTSL 3 BASIC17.55■□□□□ 0.4
MKRN4PQ13434 DCTD-213ENST00000510370 794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
MKRN4PQ13434 CLDND1-222ENST00000510545 2124 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
MKRN4PQ13434 AP000793.1-201ENST00000527364 740 ntTSL 3 BASIC17.55■□□□□ 0.4
MKRN4PQ13434 TPD52L1-214ENST00000534199 811 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
MKRN4PQ13434 AP000721.1-201ENST00000535431 559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
MKRN4PQ13434 AC090680.2-201ENST00000550279 742 ntTSL 3 BASIC17.55■□□□□ 0.4
MKRN4PQ13434 AP005482.1-201ENST00000563722 1273 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
MKRN4PQ13434 BLOC1S6-208ENST00000565323 688 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
MKRN4PQ13434 AC105020.3-201ENST00000566036 560 ntTSL 4 BASIC17.55■□□□□ 0.4
MKRN4PQ13434 CD226-202ENST00000577287 1009 ntTSL 3 BASIC17.55■□□□□ 0.4
MKRN4PQ13434 AC110760.3-201ENST00000598794 467 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
MKRN4PQ13434 MFSD4A-207ENST00000536357 1841 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
MKRN4PQ13434 PARVB-210ENST00000619710 1530 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
MKRN4PQ13434 C11orf24-201ENST00000304271 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
MKRN4PQ13434 SASH3-201ENST00000356892 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
MKRN4PQ13434 DLG4-201ENST00000302955 3184 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
MKRN4PQ13434 LONRF3-203ENST00000422289 2898 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
MKRN4PQ13434 C9orf78-201ENST00000372447 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
MKRN4PQ13434 AC118344.1-201ENST00000378432 1462 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
MKRN4PQ13434 ZDHHC4-203ENST00000396707 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
MKRN4PQ13434 SMG1P3-206ENST00000522841 2774 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
MKRN4PQ13434 NCOA6-206ENST00000612493 4082 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
MKRN4PQ13434 DCP1B-202ENST00000535873 2231 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
MKRN4PQ13434 AC073324.2-201ENST00000626532 2941 ntTSL 4 BASIC17.54■□□□□ 0.4
MKRN4PQ13434 C15orf62-201ENST00000344320 2370 ntAPPRIS P1 BASIC17.54■□□□□ 0.4
MKRN4PQ13434 SLC29A1-206ENST00000371755 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
MKRN4PQ13434 SPAAR-202ENST00000443779 1612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
MKRN4PQ13434 DZIP1L-204ENST00000469243 2107 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
MKRN4PQ13434 ORAI2-205ENST00000478730 5531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
MKRN4PQ13434 STK4-AS1-201ENST00000434401 2065 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
MKRN4PQ13434 ACSM2A-203ENST00000417235 1835 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
MKRN4PQ13434 LMO3-224ENST00000540848 1574 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
MKRN4PQ13434 CTSW-201ENST00000307886 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
MKRN4PQ13434 NRXN1-229ENST00000628515 3243 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
MKRN4PQ13434 GATA4-201ENST00000335135 3414 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
MKRN4PQ13434 STK24-203ENST00000397517 4578 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
MKRN4PQ13434 IL2-201ENST00000226730 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
MKRN4PQ13434 EIF4E-201ENST00000280892 1097 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
MKRN4PQ13434 IL32-202ENST00000325568 1105 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
MKRN4PQ13434 FAM104B-202ENST00000358460 1179 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
MKRN4PQ13434 AP000317.2-201ENST00000362077 641 ntTSL 3 BASIC17.54■□□□□ 0.4
MKRN4PQ13434 IL32-203ENST00000382213 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.54■□□□□ 0.4
MKRN4PQ13434 EEF1B2-202ENST00000392221 880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
MKRN4PQ13434 AKIP1-204ENST00000396648 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
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MKRN4PQ13434 LINC01717-201ENST00000415754 527 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
MKRN4PQ13434 AC115285.1-201ENST00000424879 736 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
MKRN4PQ13434 HIST2H2BA-202ENST00000430394 752 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
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MKRN4PQ13434 Z83846.1-201ENST00000446798 265 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
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MKRN4PQ13434 NDUFC1-206ENST00000505036 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
MKRN4PQ13434 USP32P1-208ENST00000506594 1164 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
MKRN4PQ13434 C8orf88-201ENST00000517562 894 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
MKRN4PQ13434 IL32-215ENST00000529550 772 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC17.54■□□□□ 0.4
MKRN4PQ13434 AC009163.1-201ENST00000530512 573 ntTSL 4 BASIC17.54■□□□□ 0.4
MKRN4PQ13434 AP000722.1-201ENST00000531176 775 ntTSL 3 BASIC17.54■□□□□ 0.4
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MKRN4PQ13434 AL133507.1-201ENST00000605269 557 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
MKRN4PQ13434 AL606495.2-201ENST00000605867 535 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
MKRN4PQ13434 NKPD1-201ENST00000317951 4233 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
MKRN4PQ13434 RIBC2-202ENST00000614167 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
MKRN4PQ13434 PRMT5-203ENST00000397440 1907 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
MKRN4PQ13434 FAM192A-201ENST00000309137 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
MKRN4PQ13434 ICA1L-201ENST00000358299 3457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
MKRN4PQ13434 PTK6-202ENST00000542869 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
MKRN4PQ13434 EXT2-210ENST00000533608 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
MKRN4PQ13434 BTD-207ENST00000449107 1820 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
MKRN4PQ13434 TBX5-203ENST00000405440 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
MKRN4PQ13434 AKAP9-205ENST00000394564 1356 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
MKRN4PQ13434 PLPPR4-202ENST00000370185 5369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
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