Protein–RNA interactions for Protein: Q13426

XRCC4, DNA repair protein XRCC4, humanhuman

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Length 336 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
XRCC4Q13426 AMMECR1-203ENST00000372059 3052 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
XRCC4Q13426 ROPN1-203ENST00000459660 1909 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
XRCC4Q13426 LPAR1-203ENST00000374431 3637 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
XRCC4Q13426 SLC2A4-204ENST00000571308 1768 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
XRCC4Q13426 RBPJ-205ENST00000355476 5990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
XRCC4Q13426 SLC1A7-206ENST00000620347 2873 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
XRCC4Q13426 FOXJ2-201ENST00000162391 5523 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
XRCC4Q13426 TTC39A-208ENST00000413473 2718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
XRCC4Q13426 RNF122-201ENST00000256257 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
XRCC4Q13426 CICP11-201ENST00000434745 2827 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
XRCC4Q13426 MRC2-202ENST00000446119 3201 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
XRCC4Q13426 EXD3-203ENST00000465160 1585 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
XRCC4Q13426 SIGLEC9-202ENST00000440804 1960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
XRCC4Q13426 PBX3-203ENST00000373487 2902 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
XRCC4Q13426 SLC38A9-202ENST00000396865 2927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
XRCC4Q13426 UBE2D3-207ENST00000394801 2368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
XRCC4Q13426 PIGG-202ENST00000383028 2787 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
XRCC4Q13426 KIAA0368-201ENST00000259335 7391 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
XRCC4Q13426 GYPC-201ENST00000259254 1246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
XRCC4Q13426 TMEM219-201ENST00000279396 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
XRCC4Q13426 LINC00313-201ENST00000332440 579 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
XRCC4Q13426 AQP7-204ENST00000379506 1062 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
XRCC4Q13426 RNASE10-202ENST00000430083 1172 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
XRCC4Q13426 AC092809.2-202ENST00000436706 790 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
XRCC4Q13426 LINC01160-201ENST00000441004 768 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
XRCC4Q13426 PIGZ-204ENST00000443835 675 ntTSL 4 BASIC15.97■□□□□ 0.15
XRCC4Q13426 PAX5-207ENST00000446742 885 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
XRCC4Q13426 AC097493.3-201ENST00000509725 367 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
XRCC4Q13426 IGHV3OR16-13-201ENST00000562905 353 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
XRCC4Q13426 AC027796.2-201ENST00000575326 344 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
XRCC4Q13426 AC104985.1-201ENST00000587528 507 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
XRCC4Q13426 AL844908.2-201ENST00000609461 460 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
XRCC4Q13426 TNN-201ENST00000239462 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
XRCC4Q13426 TCP11-206ENST00000412155 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
XRCC4Q13426 HSDL1-201ENST00000219439 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
XRCC4Q13426 DPYSL4-201ENST00000338492 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
XRCC4Q13426 ADAMTSL1-207ENST00000380566 2321 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
XRCC4Q13426 AL121723.1-201ENST00000445194 1519 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
XRCC4Q13426 SYNRG-225ENST00000619541 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
XRCC4Q13426 CRACR2A-201ENST00000252322 2186 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
XRCC4Q13426 SCLY-202ENST00000409736 1774 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
XRCC4Q13426 ARHGEF5-201ENST00000056217 5544 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
XRCC4Q13426 C17orf107-201ENST00000381365 3199 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
XRCC4Q13426 ZEB1-AS1-208ENST00000607166 2503 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
XRCC4Q13426 RAB3IP-204ENST00000378815 2386 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
XRCC4Q13426 SLC2A11-203ENST00000345044 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
XRCC4Q13426 TACR2-201ENST00000373306 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
XRCC4Q13426 STOML1-204ENST00000541638 6336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
XRCC4Q13426 USP28-214ENST00000545540 3431 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
XRCC4Q13426 ATXN7L1-207ENST00000477775 2426 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
XRCC4Q13426 CLCN7-202ENST00000382745 4720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
XRCC4Q13426 ECE1-201ENST00000264205 2381 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
XRCC4Q13426 C16orf92-201ENST00000300575 895 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
XRCC4Q13426 H3F3C-201ENST00000340398 1057 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.15
XRCC4Q13426 S100A14-204ENST00000368702 1218 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
XRCC4Q13426 CYB561D1-202ENST00000369868 1085 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
XRCC4Q13426 AC104457.1-201ENST00000401024 814 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
XRCC4Q13426 S100A14-206ENST00000476873 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
XRCC4Q13426 ZIC4-214ENST00000491672 925 ntTSL 4 BASIC15.96■□□□□ 0.15
XRCC4Q13426 AC020659.2-201ENST00000510176 585 ntTSL 4 BASIC15.96■□□□□ 0.15
XRCC4Q13426 RFPL4AP1-201ENST00000530883 850 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
XRCC4Q13426 RPL28-205ENST00000558131 444 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
XRCC4Q13426 AC116003.1-201ENST00000578340 536 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
XRCC4Q13426 AC004408.1-201ENST00000579256 573 ntTSL 4 BASIC15.96■□□□□ 0.15
XRCC4Q13426 SSH2-210ENST00000582084 560 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
XRCC4Q13426 TMEM179-205ENST00000615704 636 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
XRCC4Q13426 LAP3-211ENST00000618908 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
XRCC4Q13426 FAM92A-219ENST00000620645 1014 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
XRCC4Q13426 AL590560.3-201ENST00000623350 461 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
XRCC4Q13426 AL356481.3-201ENST00000630523 575 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
XRCC4Q13426 UBA1-202ENST00000377269 2497 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
XRCC4Q13426 PSD2-201ENST00000274710 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
XRCC4Q13426 CICP20-201ENST00000443330 2801 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
XRCC4Q13426 SUPT20H-212ENST00000475892 2836 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
XRCC4Q13426 ADAM33-206ENST00000617732 1971 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
XRCC4Q13426 ADAM15-209ENST00000449910 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
XRCC4Q13426 CRLS1-203ENST00000452938 3859 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
XRCC4Q13426 GPKOW-201ENST00000156109 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
XRCC4Q13426 AC026688.2-201ENST00000518984 1734 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
XRCC4Q13426 POMT1-204ENST00000402686 3038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
XRCC4Q13426 TJP2-212ENST00000636438 4689 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
XRCC4Q13426 CRYM-201ENST00000219599 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
XRCC4Q13426 COL6A2-201ENST00000300527 3461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
XRCC4Q13426 ATP5B-201ENST00000262030 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
XRCC4Q13426 DDIAS-203ENST00000525361 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.14
XRCC4Q13426 C22orf34-204ENST00000414287 2197 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
XRCC4Q13426 PTGES3L-AARSD1-204ENST00000421990 2150 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.14
XRCC4Q13426 TELO2-201ENST00000262319 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
XRCC4Q13426 PVR-202ENST00000344956 3166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
XRCC4Q13426 URAHP-202ENST00000409873 1349 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
XRCC4Q13426 TMEM127-201ENST00000258439 6266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
XRCC4Q13426 AC021683.3-202ENST00000592572 4440 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
XRCC4Q13426 NRCAM-217ENST00000613830 3025 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
XRCC4Q13426 LMF1-AS1-202ENST00000569574 1408 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
XRCC4Q13426 AC100757.3-201ENST00000622361 1406 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
XRCC4Q13426 E2F6-211ENST00000542100 3450 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
XRCC4Q13426 DBR1-201ENST00000260803 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
XRCC4Q13426 LZTR1-201ENST00000215739 4572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
XRCC4Q13426 LZTS1-201ENST00000265801 5459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
XRCC4Q13426 SIN3B-202ENST00000379803 5129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
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