Protein–RNA interactions for Protein: Q13131

PRKAA1, 5'-AMP-activated protein kinase catalytic subunit alpha-1, humanhuman

Predictions only

Length 559 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRKAA1Q13131 PHYH-203ENST00000396920 1829 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PRKAA1Q13131 MAGEA12-201ENST00000357916 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PRKAA1Q13131 MTX3-201ENST00000509852 1655 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PRKAA1Q13131 UHRF1BP1-202ENST00000452449 4706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PRKAA1Q13131 LTA-214ENST00000454783 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PRKAA1Q13131 WASH3P-207ENST00000560956 1394 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
PRKAA1Q13131 ZNF777-201ENST00000247930 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PRKAA1Q13131 AC245052.4-201ENST00000452097 4158 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PRKAA1Q13131 C1R-202ENST00000536053 2347 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PRKAA1Q13131 CIAPIN1-201ENST00000394391 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PRKAA1Q13131 PTGES3L-AARSD1-204ENST00000421990 2150 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PRKAA1Q13131 MBD1-211ENST00000585595 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PRKAA1Q13131 HMGA1-204ENST00000401473 1887 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PRKAA1Q13131 CLEC16A-203ENST00000409790 6891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PRKAA1Q13131 FAM210A-202ENST00000402563 4240 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PRKAA1Q13131 AC026688.2-201ENST00000518984 1734 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PRKAA1Q13131 AC104407.1-201ENST00000511017 1568 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PRKAA1Q13131 ANXA4-202ENST00000409920 1414 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PRKAA1Q13131 ZSCAN2-203ENST00000334141 993 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PRKAA1Q13131 LCE3E-201ENST00000368789 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PRKAA1Q13131 IDH3B-202ENST00000380851 1230 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PRKAA1Q13131 AL035633.1-201ENST00000406139 838 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
PRKAA1Q13131 ESPNP-202ENST00000414828 571 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PRKAA1Q13131 AC104135.1-201ENST00000418001 763 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PRKAA1Q13131 LEPROTL1-202ENST00000442880 908 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PRKAA1Q13131 LINC00229-201ENST00000443783 500 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PRKAA1Q13131 SPTLC1P1-201ENST00000447199 261 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
PRKAA1Q13131 AL033519.3-201ENST00000450618 595 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PRKAA1Q13131 RAD51D-205ENST00000460118 1064 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PRKAA1Q13131 SLC35B4-204ENST00000470969 1033 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PRKAA1Q13131 AC084125.2-203ENST00000532766 821 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PRKAA1Q13131 COQ6-210ENST00000554920 649 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PRKAA1Q13131 AC133919.2-202ENST00000563515 416 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PRKAA1Q13131 AC129507.1-201ENST00000570711 1013 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PRKAA1Q13131 LINC01975-201ENST00000571890 549 ntTSL 4 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PRKAA1Q13131 KLK15-203ENST00000596931 692 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PRKAA1Q13131 KLK15-204ENST00000598239 855 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PRKAA1Q13131 DUSP13-214ENST00000607131 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PRKAA1Q13131 SRRT-217ENST00000618411 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PRKAA1Q13131 SLC38A10-202ENST00000374759 4300 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PRKAA1Q13131 AMPD2-218ENST00000528454 2728 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PRKAA1Q13131 STIP1-207ENST00000538945 1900 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PRKAA1Q13131 SPEG-205ENST00000396698 3379 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PRKAA1Q13131 NR3C1-203ENST00000394464 6795 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PRKAA1Q13131 MBD1-217ENST00000588937 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PRKAA1Q13131 CRLF2-203ENST00000400841 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PRKAA1Q13131 AMT-204ENST00000427987 1646 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PRKAA1Q13131 GRAP-201ENST00000284154 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PRKAA1Q13131 LIMK2-204ENST00000406516 2657 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PRKAA1Q13131 IDH3G-203ENST00000370093 1662 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PRKAA1Q13131 NBEA-203ENST00000379939 10738 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PRKAA1Q13131 GOLM1-203ENST00000388712 3046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PRKAA1Q13131 TRAPPC8-201ENST00000283351 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PRKAA1Q13131 ZFP30-201ENST00000351218 6090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PRKAA1Q13131 ZNF800-201ENST00000265827 4203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PRKAA1Q13131 TTC29-208ENST00000513335 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PRKAA1Q13131 RTEL1-205ENST00000370018 4955 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PRKAA1Q13131 COG3-201ENST00000349995 4498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PRKAA1Q13131 NDRG2-207ENST00000397847 2084 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PRKAA1Q13131 TOM1L2-202ENST00000379504 2418 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PRKAA1Q13131 GLUL-202ENST00000331872 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PRKAA1Q13131 SMARCA2-203ENST00000349721 5761 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PRKAA1Q13131 GGT1-201ENST00000248923 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PRKAA1Q13131 E2F6-202ENST00000381525 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PRKAA1Q13131 NFIA-205ENST00000371189 1989 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PRKAA1Q13131 HAND2-AS1-202ENST00000502896 5278 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PRKAA1Q13131 SPDYE19P-201ENST00000338590 713 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
PRKAA1Q13131 TCEAL3-202ENST00000372627 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PRKAA1Q13131 AGER-204ENST00000375067 1250 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PRKAA1Q13131 MAP9-202ENST00000379248 1165 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PRKAA1Q13131 NUDT1-205ENST00000397048 783 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PRKAA1Q13131 MEP1AP4-201ENST00000423244 1087 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
PRKAA1Q13131 RASL12-203ENST00000434605 982 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PRKAA1Q13131 AL034550.1-201ENST00000442179 986 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PRKAA1Q13131 APOA1-AS-201ENST00000444200 563 ntTSL 4 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PRKAA1Q13131 AC139713.2-206ENST00000499587 566 ntTSL 4 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PRKAA1Q13131 AC093004.1-201ENST00000508850 424 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
PRKAA1Q13131 TUBB3-203ENST00000553967 736 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PRKAA1Q13131 NDUFA4L2-206ENST00000556732 883 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PRKAA1Q13131 ZNF710-AS1-201ENST00000558334 1168 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PRKAA1Q13131 CD300LG-205ENST00000586233 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PRKAA1Q13131 AC005746.1-201ENST00000589244 672 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PRKAA1Q13131 DDIAS-203ENST00000525361 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PRKAA1Q13131 RPTOR-201ENST00000306801 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PRKAA1Q13131 CRB2-201ENST00000359999 3659 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PRKAA1Q13131 EXOC6B-209ENST00000634650 2583 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PRKAA1Q13131 PIMREG-201ENST00000250056 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PRKAA1Q13131 AC007541.1-201ENST00000570282 1469 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
PRKAA1Q13131 LIMK2-203ENST00000340552 2789 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PRKAA1Q13131 CHN2-201ENST00000222792 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PRKAA1Q13131 PITX2-204ENST00000394595 1693 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PRKAA1Q13131 C11orf16-202ENST00000525780 1685 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PRKAA1Q13131 CAMK2D-205ENST00000394524 5294 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PRKAA1Q13131 FKBP5-201ENST00000357266 3772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PRKAA1Q13131 PDGFA-201ENST00000354513 1308 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PRKAA1Q13131 LSM6-201ENST00000296581 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PRKAA1Q13131 FKBP6-202ENST00000413573 1507 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PRKAA1Q13131 CYP2R1-207ENST00000532378 1746 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PRKAA1Q13131 RASSF5-201ENST00000577571 3496 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PRKAA1Q13131 DLX6-202ENST00000518156 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.2 ms