Protein–RNA interactions for Protein: Q13111

CHAF1A, Chromatin assembly factor 1 subunit A, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 956 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHAF1AQ13111 PIGT-201ENST00000279035 1880 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
CHAF1AQ13111 PPP1R21-201ENST00000281394 3137 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
CHAF1AQ13111 RNASEH1-201ENST00000315212 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
CHAF1AQ13111 ARL10-201ENST00000310389 10845 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
CHAF1AQ13111 NAT8-201ENST00000272425 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
CHAF1AQ13111 FAM86MP-201ENST00000340703 885 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
CHAF1AQ13111 RPF1-202ENST00000370656 724 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
CHAF1AQ13111 TMEM239-202ENST00000380585 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
CHAF1AQ13111 PDGFB-202ENST00000381551 1125 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
CHAF1AQ13111 ZG16B-201ENST00000382280 831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
CHAF1AQ13111 NGDN-202ENST00000408901 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
CHAF1AQ13111 AC007405.2-202ENST00000418106 540 ntTSL 4 BASIC18.91■□□□□ 0.62
CHAF1AQ13111 RPL7P3-201ENST00000441388 714 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
CHAF1AQ13111 SNHG11-212ENST00000449351 954 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
CHAF1AQ13111 SYNPR-202ENST00000450542 1004 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
CHAF1AQ13111 LLPH-AS1-201ENST00000510317 623 ntTSL 4 BASIC18.91■□□□□ 0.62
CHAF1AQ13111 RCN1-210ENST00000532942 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
CHAF1AQ13111 ELOF1-208ENST00000591912 899 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
CHAF1AQ13111 UBL5-208ENST00000593087 320 ntTSL 3 BASIC18.91■□□□□ 0.62
CHAF1AQ13111 AC093813.1-201ENST00000605066 256 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
CHAF1AQ13111 DDX5-201ENST00000225792 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
CHAF1AQ13111 KCP-208ENST00000620378 4515 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
CHAF1AQ13111 DNASE2-201ENST00000222219 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
CHAF1AQ13111 WRAP73-202ENST00000378322 1998 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
CHAF1AQ13111 SLC43A1-204ENST00000528450 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
CHAF1AQ13111 COL11A2-202ENST00000361917 6104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
CHAF1AQ13111 DNAJB9-201ENST00000249356 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
CHAF1AQ13111 SLC44A2-203ENST00000586078 3784 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
CHAF1AQ13111 B9D1-209ENST00000477478 1353 ntTSL 3 BASIC18.91■□□□□ 0.62
CHAF1AQ13111 ALOX12-AS1-201ENST00000399540 1730 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
CHAF1AQ13111 LOXL3-203ENST00000409249 2431 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
CHAF1AQ13111 AP002360.1-202ENST00000530460 2462 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
CHAF1AQ13111 UCP3-202ENST00000426995 1406 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
CHAF1AQ13111 C12orf73-207ENST00000549478 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
CHAF1AQ13111 PNMA3-202ENST00000593810 1432 ntAPPRIS P1 BASIC18.91■□□□□ 0.62
CHAF1AQ13111 SLC12A9-201ENST00000354161 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
CHAF1AQ13111 VWF-201ENST00000261405 8838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
CHAF1AQ13111 LINC02551-202ENST00000533812 2203 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
CHAF1AQ13111 ROR2-202ENST00000375715 2993 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
CHAF1AQ13111 ZC2HC1C-202ENST00000439583 1509 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
CHAF1AQ13111 GHDC-201ENST00000301671 2650 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
CHAF1AQ13111 TSNARE1-201ENST00000307180 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
CHAF1AQ13111 ARHGEF7-204ENST00000375736 5032 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
CHAF1AQ13111 CRK-201ENST00000300574 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
CHAF1AQ13111 AC141586.1-201ENST00000399702 2748 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
CHAF1AQ13111 KRT76-201ENST00000332411 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
CHAF1AQ13111 TEX30-203ENST00000376022 828 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
CHAF1AQ13111 Z94721.1-201ENST00000444102 385 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
CHAF1AQ13111 ADAM15-208ENST00000447332 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
CHAF1AQ13111 CSF2RBP1-201ENST00000447905 391 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
CHAF1AQ13111 TMEM225B-203ENST00000453227 1041 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
CHAF1AQ13111 DMKN-216ENST00000458071 510 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.9■□□□□ 0.62
CHAF1AQ13111 TMEM14B-204ENST00000461342 559 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
CHAF1AQ13111 FAM162A-202ENST00000469967 1015 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
CHAF1AQ13111 AC082651.1-201ENST00000478468 832 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
CHAF1AQ13111 RMDN1-212ENST00000519966 1164 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
CHAF1AQ13111 AC008011.2-201ENST00000538113 792 ntTSL 3 BASIC18.9■□□□□ 0.62
CHAF1AQ13111 DPF3-210ENST00000556509 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
CHAF1AQ13111 LINC02109-201ENST00000565798 869 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
CHAF1AQ13111 AC024619.2-201ENST00000581964 517 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
CHAF1AQ13111 RASD2-201ENST00000216127 3412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
CHAF1AQ13111 ENO3-206ENST00000519584 1322 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
CHAF1AQ13111 FDFT1-224ENST00000618539 2660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
CHAF1AQ13111 AL121845.3-201ENST00000490623 3119 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
CHAF1AQ13111 CHRNG-202ENST00000389494 2262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
CHAF1AQ13111 SMG1P3-206ENST00000522841 2774 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
CHAF1AQ13111 KCNC1-201ENST00000265969 4295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
CHAF1AQ13111 PDP1-201ENST00000297598 4272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
CHAF1AQ13111 FBXL5-201ENST00000341285 3385 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
CHAF1AQ13111 DOK5-202ENST00000395939 1453 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
CHAF1AQ13111 Z99756.1-201ENST00000458463 1951 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
CHAF1AQ13111 PPM1A-203ENST00000395076 8184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
CHAF1AQ13111 TUBGCP2-203ENST00000368563 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
CHAF1AQ13111 APH1A-204ENST00000414276 1718 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
CHAF1AQ13111 OTULIN-201ENST00000284274 7800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
CHAF1AQ13111 SYT5-207ENST00000590851 3619 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
CHAF1AQ13111 NR2C1-203ENST00000393101 1822 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
CHAF1AQ13111 CNGA4-201ENST00000379936 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
CHAF1AQ13111 RBCK1-201ENST00000353660 2511 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
CHAF1AQ13111 CGB5-201ENST00000301408 841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
CHAF1AQ13111 MORN2-204ENST00000409665 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
CHAF1AQ13111 AL121601.1-201ENST00000426367 326 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
CHAF1AQ13111 CEP57L1-208ENST00000519095 908 ntTSL 3 BASIC18.89■□□□□ 0.61
CHAF1AQ13111 AP006621.2-201ENST00000533938 284 ntTSL 3 BASIC18.89■□□□□ 0.61
CHAF1AQ13111 USB1-203ENST00000539737 1212 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
CHAF1AQ13111 MIR4538-201ENST00000581377 78 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
CHAF1AQ13111 SLC2A13-201ENST00000280871 7003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
CHAF1AQ13111 FAM153B-220ENST00000515817 1966 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
CHAF1AQ13111 SALL3-205ENST00000575389 3996 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
CHAF1AQ13111 ZNF382-202ENST00000423582 2657 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
CHAF1AQ13111 MAP4K1-208ENST00000589130 2654 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
CHAF1AQ13111 BLK-205ENST00000529894 2017 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
CHAF1AQ13111 ABTB1-206ENST00000468137 2065 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
CHAF1AQ13111 GEM-202ENST00000396194 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
CHAF1AQ13111 NPHP4-201ENST00000378156 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
CHAF1AQ13111 CERK-201ENST00000216264 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
CHAF1AQ13111 TBC1D22A-205ENST00000406733 2267 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
CHAF1AQ13111 CCDC136-212ENST00000487361 2268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
CHAF1AQ13111 PIP4K2C-207ENST00000550465 1532 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
CHAF1AQ13111 MAP2K6-209ENST00000613873 1509 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
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