Protein–RNA interactions for Protein: Q13064

MKRN3, Probable E3 ubiquitin-protein ligase makorin-3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 507 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MKRN3Q13064 VPS29-201ENST00000360579 1091 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
MKRN3Q13064 UBL4A-201ENST00000369653 711 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
MKRN3Q13064 TMEM239-202ENST00000380585 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
MKRN3Q13064 NREP-204ENST00000419114 704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
MKRN3Q13064 AL606534.3-201ENST00000437499 373 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
MKRN3Q13064 PFN2-205ENST00000461868 613 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
MKRN3Q13064 AC005586.1-201ENST00000488310 577 ntTSL 4 BASIC17.82■□□□□ 0.44
MKRN3Q13064 TAPBP-241ENST00000489157 1299 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
MKRN3Q13064 AC105389.3-201ENST00000508038 907 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
MKRN3Q13064 SMIM23-202ENST00000523047 573 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
MKRN3Q13064 EHF-205ENST00000527935 557 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
MKRN3Q13064 FAM86B1-218ENST00000534520 808 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
MKRN3Q13064 AL928654.3-201ENST00000552675 445 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
MKRN3Q13064 AC103988.2-201ENST00000561804 725 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
MKRN3Q13064 AC135983.4-201ENST00000564116 1262 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
MKRN3Q13064 RN7SL163P-201ENST00000583100 276 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
MKRN3Q13064 INO80C-210ENST00000590757 595 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
MKRN3Q13064 AC008750.3-201ENST00000601148 437 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
MKRN3Q13064 ANGPTL8-204ENST00000616433 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
MKRN3Q13064 NDRG2-209ENST00000397853 2079 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
MKRN3Q13064 ZSCAN10-201ENST00000252463 2463 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
MKRN3Q13064 PAK4-203ENST00000360442 2855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
MKRN3Q13064 AGTPBP1-201ENST00000337006 4473 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
MKRN3Q13064 CCDC40-202ENST00000374876 2010 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
MKRN3Q13064 MVK-214ENST00000629016 1591 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
MKRN3Q13064 GLDC-201ENST00000321612 3900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
MKRN3Q13064 CHRFAM7A-203ENST00000401522 1913 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
MKRN3Q13064 AC021148.1-201ENST00000513652 1532 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
MKRN3Q13064 RASGRF1-202ENST00000419573 6294 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
MKRN3Q13064 DNAJC19-201ENST00000382564 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
MKRN3Q13064 ARL4C-202ENST00000390645 4013 ntAPPRIS P1 BASIC17.82■□□□□ 0.44
MKRN3Q13064 AL031282.2-201ENST00000598846 5079 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
MKRN3Q13064 NELFE-201ENST00000375425 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
MKRN3Q13064 KRT8P14-201ENST00000414254 1442 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
MKRN3Q13064 AC004233.2-201ENST00000573315 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
MKRN3Q13064 KAAG1-201ENST00000274766 1382 ntAPPRIS P1 BASIC17.81■□□□□ 0.44
MKRN3Q13064 HYAL1-202ENST00000320295 2324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
MKRN3Q13064 RUNX1-201ENST00000300305 6222 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
MKRN3Q13064 DIXDC1-208ENST00000615255 4825 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
MKRN3Q13064 RAB15-203ENST00000533601 3515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
MKRN3Q13064 C6orf52-201ENST00000259983 619 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
MKRN3Q13064 ODF4-201ENST00000328248 1156 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
MKRN3Q13064 LAMTOR4-201ENST00000341942 605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
MKRN3Q13064 VCX3B-201ENST00000381029 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
MKRN3Q13064 ELOCP6-201ENST00000429066 328 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
MKRN3Q13064 ELOCP12-201ENST00000458706 328 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
MKRN3Q13064 RN7SL181P-201ENST00000462921 277 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
MKRN3Q13064 LINC01629-201ENST00000553613 581 ntTSL 4 BASIC17.81■□□□□ 0.44
MKRN3Q13064 CRHR1-208ENST00000577353 1206 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
MKRN3Q13064 AC136475.1-202ENST00000602429 1151 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
MKRN3Q13064 AL353770.1-201ENST00000614915 403 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
MKRN3Q13064 AC006213.5-201ENST00000619673 288 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
MKRN3Q13064 CCDC197-205ENST00000636493 1279 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
MKRN3Q13064 CHRNE-201ENST00000293780 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
MKRN3Q13064 EIF4G3-212ENST00000602326 6196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
MKRN3Q13064 TSG101-204ENST00000536719 2101 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
MKRN3Q13064 AL391005.1-201ENST00000623953 2435 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
MKRN3Q13064 PPAN-P2RY11-202ENST00000428358 2661 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
MKRN3Q13064 GIGYF1-201ENST00000275732 6530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
MKRN3Q13064 ARNTL2-208ENST00000544915 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
MKRN3Q13064 DNMT3A-205ENST00000402667 2300 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
MKRN3Q13064 SCRIB-202ENST00000356994 5218 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
MKRN3Q13064 SCYL1-214ENST00000533862 2570 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
MKRN3Q13064 JRK-211ENST00000615982 2823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
MKRN3Q13064 PRRX1-202ENST00000367760 2217 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
MKRN3Q13064 GIMAP1-201ENST00000307194 4420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
MKRN3Q13064 FLJ38576-201ENST00000623820 2459 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
MKRN3Q13064 COPS7B-206ENST00000410017 2051 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
MKRN3Q13064 SLC2A6-201ENST00000371897 2301 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
MKRN3Q13064 IER3-201ENST00000259874 1244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
MKRN3Q13064 PSMB6-201ENST00000270586 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
MKRN3Q13064 CRYBA4-201ENST00000354760 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
MKRN3Q13064 PSMG4-203ENST00000380306 726 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
MKRN3Q13064 CSH2-203ENST00000392886 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
MKRN3Q13064 MYL3-202ENST00000395869 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
MKRN3Q13064 DMAC2-203ENST00000417807 1065 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
MKRN3Q13064 AL158013.1-202ENST00000419666 520 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
MKRN3Q13064 C9orf116-205ENST00000429260 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
MKRN3Q13064 AL137856.1-201ENST00000429398 773 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
MKRN3Q13064 AC098935.1-201ENST00000446057 611 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
MKRN3Q13064 KLK11-204ENST00000453757 1174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
MKRN3Q13064 PABPC5-AS1-201ENST00000456187 426 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
MKRN3Q13064 LINC02046-201ENST00000469812 378 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
MKRN3Q13064 TMEM14B-210ENST00000473276 730 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
MKRN3Q13064 CLDN11-207ENST00000486975 1139 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
MKRN3Q13064 AC125604.1-201ENST00000496255 707 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
MKRN3Q13064 CSTF3-206ENST00000524827 693 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
MKRN3Q13064 MRPL51-202ENST00000537701 601 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
MKRN3Q13064 AL079304.1-201ENST00000554595 828 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
MKRN3Q13064 CSH2-206ENST00000560142 749 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
MKRN3Q13064 AC011498.6-201ENST00000592034 510 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
MKRN3Q13064 CR589904.1-202ENST00000611154 660 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
MKRN3Q13064 PSMB6-205ENST00000614486 871 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
MKRN3Q13064 COX6A1P2-201ENST00000620597 330 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
MKRN3Q13064 CKMT1A-208ENST00000626814 1073 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
MKRN3Q13064 AC092506.1-204ENST00000634888 1066 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
MKRN3Q13064 LINC01672-205ENST00000635092 633 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
MKRN3Q13064 PLPPR4-203ENST00000457765 4846 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
MKRN3Q13064 MEF2C-AS1-210ENST00000514011 1754 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
MKRN3Q13064 GUCA1A-203ENST00000394237 2233 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
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