Protein–RNA interactions for Protein: Q12988

HSPB3, Heat shock protein beta-3, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HSPB3Q12988 NFIC-201ENST00000341919 1573 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
HSPB3Q12988 GRAP-201ENST00000284154 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
HSPB3Q12988 ASAH1-221ENST00000636128 1608 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
HSPB3Q12988 ZNF563-201ENST00000293725 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
HSPB3Q12988 FOXRED1-213ENST00000532125 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
HSPB3Q12988 ACSS2-202ENST00000360596 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
HSPB3Q12988 MOXD1-202ENST00000367963 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
HSPB3Q12988 RASGEF1A-204ENST00000395810 3235 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
HSPB3Q12988 ZBED1-202ENST00000381222 4507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
HSPB3Q12988 PIGT-246ENST00000639499 2021 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
HSPB3Q12988 SLC39A9-209ENST00000556605 2065 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
HSPB3Q12988 REC8-209ENST00000611366 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
HSPB3Q12988 UBE2D3-207ENST00000394801 2368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
HSPB3Q12988 GTF2IRD1-205ENST00000476977 5868 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
HSPB3Q12988 ATP2B3-202ENST00000349466 4280 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
HSPB3Q12988 ARL15-201ENST00000502271 3248 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
HSPB3Q12988 STAT5A-211ENST00000590949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
HSPB3Q12988 MEF2D-201ENST00000348159 5965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
HSPB3Q12988 PATZ1-202ENST00000266269 3781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
HSPB3Q12988 TMEM201-202ENST00000340381 3776 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
HSPB3Q12988 FLYWCH2-201ENST00000293981 915 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC14.54□□□□□ -0.08
HSPB3Q12988 CCDC182-201ENST00000299415 832 ntAPPRIS P1 BASIC14.54□□□□□ -0.08
HSPB3Q12988 FAM19A3-202ENST00000369630 1282 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
HSPB3Q12988 COLEC11-205ENST00000402922 1134 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
HSPB3Q12988 PCAT6-201ENST00000417262 748 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
HSPB3Q12988 DIRC3-201ENST00000423123 552 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC14.54□□□□□ -0.08
HSPB3Q12988 AL589923.1-201ENST00000441473 316 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
HSPB3Q12988 AL158198.1-201ENST00000449143 380 ntTSL 3 BASIC14.54□□□□□ -0.08
HSPB3Q12988 AL512638.1-201ENST00000457493 794 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
HSPB3Q12988 NECTIN3-AS1-204ENST00000476301 568 ntTSL 4 BASIC14.54□□□□□ -0.08
HSPB3Q12988 C8orf88-201ENST00000517562 894 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
HSPB3Q12988 PXN-AS1-204ENST00000542265 854 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
HSPB3Q12988 TAPBPL-205ENST00000544021 772 ntTSL 3 BASIC14.54□□□□□ -0.08
HSPB3Q12988 LINC01481-203ENST00000549651 883 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
HSPB3Q12988 AC092337.1-201ENST00000568699 1129 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
HSPB3Q12988 GPALPP1-207ENST00000611650 899 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
HSPB3Q12988 SELENOH-206ENST00000622257 1291 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
HSPB3Q12988 AL158212.4-201ENST00000624062 1286 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
HSPB3Q12988 AC247036.4-201ENST00000632099 353 ntAPPRIS P1 BASIC14.54□□□□□ -0.08
HSPB3Q12988 WDR61-201ENST00000267973 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
HSPB3Q12988 NCAPH2-202ENST00000395698 1388 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
HSPB3Q12988 KCNJ5-203ENST00000533599 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
HSPB3Q12988 RERG-209ENST00000546331 1383 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
HSPB3Q12988 SELENON-203ENST00000374315 4212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
HSPB3Q12988 BTBD7P1-201ENST00000447253 1453 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
HSPB3Q12988 SHOX2-202ENST00000425436 1513 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
HSPB3Q12988 AC022144.1-201ENST00000602255 1580 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
HSPB3Q12988 CHRDL1-204ENST00000444321 1658 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
HSPB3Q12988 RHNO1-202ENST00000461997 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
HSPB3Q12988 PMP22-201ENST00000312280 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
HSPB3Q12988 CASQ1-201ENST00000368078 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
HSPB3Q12988 PCDHA9-202ENST00000532602 6293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
HSPB3Q12988 AC007728.2-201ENST00000563315 2296 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
HSPB3Q12988 AC013726.1-201ENST00000563747 2285 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
HSPB3Q12988 MAPT-213ENST00000571987 2277 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
HSPB3Q12988 ANXA6-215ENST00000523714 2451 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
HSPB3Q12988 DIO3OS-208ENST00000556120 2473 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
HSPB3Q12988 ZNF180-202ENST00000391956 3049 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
HSPB3Q12988 CDK16-202ENST00000357227 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
HSPB3Q12988 CYB561-203ENST00000392976 3151 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.54□□□□□ -0.08
HSPB3Q12988 PTBP1-203ENST00000356948 3598 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
HSPB3Q12988 TPGS2-201ENST00000334295 4030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
HSPB3Q12988 TPCN1-214ENST00000550785 5345 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
HSPB3Q12988 MYH6-202ENST00000405093 5941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
HSPB3Q12988 TNFRSF11A-202ENST00000586569 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
HSPB3Q12988 TSPAN11-201ENST00000261177 5505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
HSPB3Q12988 TK2-221ENST00000620035 5060 ntTSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
HSPB3Q12988 GLUL-202ENST00000331872 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
HSPB3Q12988 E2F6-202ENST00000381525 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
HSPB3Q12988 PAX6-203ENST00000379109 3182 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
HSPB3Q12988 DENND5B-202ENST00000389082 9470 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
HSPB3Q12988 CRHR2-208ENST00000506074 3109 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
HSPB3Q12988 PRDM6-201ENST00000407847 9267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
HSPB3Q12988 AL513477.1-201ENST00000602865 2407 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
HSPB3Q12988 PTPN5-202ENST00000396166 2299 ntTSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
HSPB3Q12988 VTN-201ENST00000226218 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
HSPB3Q12988 SLC25A38-201ENST00000273158 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
HSPB3Q12988 TBC1D3G-201ENST00000569055 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
HSPB3Q12988 TBC1D3H-201ENST00000610350 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
HSPB3Q12988 TBC1D3L-202ENST00000617678 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
HSPB3Q12988 AZGP1-202ENST00000411734 2027 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
HSPB3Q12988 MCM7-202ENST00000343023 1968 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
HSPB3Q12988 IL1RN-203ENST00000361779 1922 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
HSPB3Q12988 REXO1L4P-201ENST00000605109 1937 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
HSPB3Q12988 ATF7-205ENST00000548446 1892 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
HSPB3Q12988 LINC01101-201ENST00000622953 1884 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
HSPB3Q12988 DDIAS-203ENST00000525361 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
HSPB3Q12988 NUP62-212ENST00000597723 1824 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
HSPB3Q12988 TMEM150A-203ENST00000409668 1776 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
HSPB3Q12988 DMAP1-203ENST00000372289 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
HSPB3Q12988 MAGEA12-201ENST00000357916 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
HSPB3Q12988 LINC00221-201ENST00000603633 1656 ntTSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
HSPB3Q12988 TBX10-201ENST00000335385 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
HSPB3Q12988 CNN1-202ENST00000535659 1527 ntTSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
HSPB3Q12988 ARMCX4-202ENST00000423738 7424 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
HSPB3Q12988 LHCGR-202ENST00000401907 1477 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
HSPB3Q12988 HDAC8-202ENST00000373556 704 ntTSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
HSPB3Q12988 VAMP1-202ENST00000396308 1113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
HSPB3Q12988 FOLR3-201ENST00000442948 805 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
HSPB3Q12988 TMEM176B-205ENST00000450753 1006 ntTSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
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