Protein–RNA interactions for Protein: Q12887

COX10, Protoheme IX farnesyltransferase, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 443 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COX10Q12887 BRK1-201ENST00000530758 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
COX10Q12887 AL356805.1-201ENST00000556383 341 ntTSL 3 BASIC14.2□□□□□ -0.14
COX10Q12887 GNAO1-210ENST00000569295 930 ntTSL 2 BASIC14.2□□□□□ -0.14
COX10Q12887 SMIM22-203ENST00000588500 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
COX10Q12887 ZNF773-202ENST00000593916 548 ntTSL 3 BASIC14.2□□□□□ -0.14
COX10Q12887 AC004832.1-201ENST00000610936 1005 ntTSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
COX10Q12887 C20orf181-201ENST00000623918 480 ntBASIC14.2□□□□□ -0.14
COX10Q12887 GNAO1-201ENST00000262493 3337 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
COX10Q12887 STMN1-203ENST00000399728 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.2□□□□□ -0.14
COX10Q12887 MUTYH-206ENST00000372115 1888 ntTSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
COX10Q12887 PTBP1-203ENST00000356948 3598 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
COX10Q12887 MSH5-203ENST00000375750 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
COX10Q12887 BRAT1-201ENST00000340611 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
COX10Q12887 ZNF777-201ENST00000247930 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
COX10Q12887 TARBP2-203ENST00000456234 1368 ntTSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
COX10Q12887 LINC02381-201ENST00000508564 1369 ntTSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
COX10Q12887 PSMD5-203ENST00000373904 1538 ntTSL 2 BASIC14.2□□□□□ -0.14
COX10Q12887 PDE6G-204ENST00000573076 1505 ntTSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
COX10Q12887 FARS2-202ENST00000324331 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
COX10Q12887 PITX2-204ENST00000394595 1693 ntTSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
COX10Q12887 ANKRD11-203ENST00000378330 9132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
COX10Q12887 FEM1A-201ENST00000269856 9593 ntAPPRIS P1 BASIC14.2□□□□□ -0.14
COX10Q12887 RTKN-202ENST00000272430 2142 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
COX10Q12887 NR3C1-209ENST00000503201 2594 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
COX10Q12887 TTLL13P-202ENST00000438251 2738 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
COX10Q12887 BRSK1-206ENST00000590333 2977 ntTSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
COX10Q12887 MUM1-201ENST00000415183 2837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
COX10Q12887 AFDN-205ENST00000392108 6812 ntTSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
COX10Q12887 RAB3IP-202ENST00000362025 2055 ntTSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
COX10Q12887 ABCC5-203ENST00000382494 1923 ntTSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
COX10Q12887 BPGM-201ENST00000344924 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
COX10Q12887 ASAH1-221ENST00000636128 1608 ntTSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
COX10Q12887 RBPMS-203ENST00000339877 1341 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
COX10Q12887 EPHA2-201ENST00000358432 3964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
COX10Q12887 PDE7A-203ENST00000401827 3673 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
COX10Q12887 CTNS-202ENST00000381870 2470 ntTSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
COX10Q12887 DUSP14-204ENST00000613659 1559 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.19□□□□□ -0.14
COX10Q12887 AKAP2-203ENST00000434623 4400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
COX10Q12887 ARAP3-201ENST00000239440 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
COX10Q12887 RPS27A-201ENST00000272317 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
COX10Q12887 S100A16-204ENST00000368706 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
COX10Q12887 YBX2P1-201ENST00000394192 760 ntBASIC14.19□□□□□ -0.14
COX10Q12887 PMP22-202ENST00000395936 816 ntTSL 3 BASIC14.19□□□□□ -0.14
COX10Q12887 LINC00029-202ENST00000414668 1117 ntTSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
COX10Q12887 PIK3CD-AS2-201ENST00000415330 939 ntTSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
COX10Q12887 C21orf33-205ENST00000427803 1077 ntTSL 2 BASIC14.19□□□□□ -0.14
COX10Q12887 MKNK2P1-201ENST00000437526 628 ntBASIC14.19□□□□□ -0.14
COX10Q12887 AHSA2-208ENST00000489653 1197 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
COX10Q12887 AC093904.3-201ENST00000492300 368 ntTSL 2 BASIC14.19□□□□□ -0.14
COX10Q12887 POLD2P1-201ENST00000511220 997 ntBASIC14.19□□□□□ -0.14
COX10Q12887 OR10S1-201ENST00000531945 1121 ntAPPRIS P2 BASIC14.19□□□□□ -0.14
COX10Q12887 AP000763.4-201ENST00000544674 752 ntTSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
COX10Q12887 AP3S2-204ENST00000558011 738 ntTSL 3 BASIC14.19□□□□□ -0.14
COX10Q12887 IL11-202ENST00000585513 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
COX10Q12887 OR10S1-202ENST00000641123 1121 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.19□□□□□ -0.14
COX10Q12887 NFATC1-218ENST00000592223 2531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
COX10Q12887 GLUL-203ENST00000339526 3942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
COX10Q12887 PXDN-201ENST00000252804 6808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
COX10Q12887 SENP3-202ENST00000429205 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
COX10Q12887 DNAJC22-201ENST00000395069 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
COX10Q12887 CDKN2AIP-201ENST00000302350 2646 ntTSL 2 BASIC14.19□□□□□ -0.14
COX10Q12887 WDR45-206ENST00000376368 1381 ntTSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
COX10Q12887 LLGL2-209ENST00000578363 1393 ntTSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
COX10Q12887 MAP4K1-203ENST00000586296 1363 ntTSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
COX10Q12887 KLK5-203ENST00000593428 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
COX10Q12887 TRIP10-208ENST00000596758 1920 ntTSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
COX10Q12887 KCNJ18-201ENST00000567955 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
COX10Q12887 DISC1-222ENST00000622252 6927 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
COX10Q12887 COPS7B-203ENST00000373608 2563 ntTSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
COX10Q12887 TRIM62-204ENST00000543586 1638 ntTSL 2 BASIC14.19□□□□□ -0.14
COX10Q12887 AGPAT1-201ENST00000336984 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
COX10Q12887 PNPLA5-202ENST00000381198 2000 ntTSL 2 BASIC14.19□□□□□ -0.14
COX10Q12887 DNAJC7-201ENST00000316603 1468 ntTSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
COX10Q12887 SLAIN1-216ENST00000488699 1461 ntTSL 2 BASIC14.18□□□□□ -0.14
COX10Q12887 IGSF11-209ENST00000491903 1487 ntTSL 2 BASIC14.18□□□□□ -0.14
COX10Q12887 CRTC1-202ENST00000338797 6929 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
COX10Q12887 PNPLA6-202ENST00000414982 4522 ntTSL 2 BASIC14.18□□□□□ -0.14
COX10Q12887 MCRIP1-207ENST00000574190 2775 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.18□□□□□ -0.14
COX10Q12887 SCARF1-201ENST00000263071 3443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
COX10Q12887 KATNA1-203ENST00000367411 1984 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.18□□□□□ -0.14
COX10Q12887 SEPT9-208ENST00000541152 3026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
COX10Q12887 PPFIA4-202ENST00000295706 6395 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.18□□□□□ -0.14
COX10Q12887 KREMEN1-203ENST00000407188 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
COX10Q12887 ARHGEF26-AS1-204ENST00000491862 2598 ntTSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
COX10Q12887 COLGALT1-201ENST00000252599 3704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
COX10Q12887 ARHGAP4-202ENST00000370016 3095 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.18□□□□□ -0.14
COX10Q12887 HVCN1-202ENST00000356742 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
COX10Q12887 NEDD4L-202ENST00000356462 3335 ntTSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
COX10Q12887 AMOTL2-201ENST00000249883 4488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
COX10Q12887 EPB41L3-201ENST00000341928 4706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
COX10Q12887 MRPL55-201ENST00000295008 632 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.18□□□□□ -0.14
COX10Q12887 FBXO44-205ENST00000376768 959 ntTSL 2 BASIC14.18□□□□□ -0.14
COX10Q12887 EEF1B2-202ENST00000392221 880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.18□□□□□ -0.14
COX10Q12887 ZFAND2B-207ENST00000409412 569 ntTSL 2 BASIC14.18□□□□□ -0.14
COX10Q12887 HRAS-204ENST00000417302 1233 ntTSL 5 BASIC14.18□□□□□ -0.14
COX10Q12887 AL589923.1-201ENST00000441473 316 ntTSL 5 BASIC14.18□□□□□ -0.14
COX10Q12887 NME4-207ENST00000450036 985 ntTSL 3 BASIC14.18□□□□□ -0.14
COX10Q12887 HRAS-205ENST00000451590 1151 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.18□□□□□ -0.14
COX10Q12887 LINC01640-201ENST00000452505 550 ntTSL 4 BASIC14.18□□□□□ -0.14
COX10Q12887 PAEP-208ENST00000479141 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.1 ms