Protein–RNA interactions for Protein: Q12829

RAB40B, Ras-related protein Rab-40B, humanhuman

Predictions only

Length 278 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB40BQ12829 NUCB1-201ENST00000405315 2668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
RAB40BQ12829 BTN1A1-201ENST00000244513 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
RAB40BQ12829 MPZL1-203ENST00000392121 3421 ntTSL 2 BASIC13.77□□□□□ -0.2
RAB40BQ12829 KIF19-202ENST00000389916 3643 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.2
RAB40BQ12829 SP6-201ENST00000342234 3800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
RAB40BQ12829 SLC6A20-202ENST00000358525 5423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
RAB40BQ12829 NUDT4-201ENST00000337179 9753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
RAB40BQ12829 HDHD3-201ENST00000238379 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
RAB40BQ12829 PF4-201ENST00000296029 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
RAB40BQ12829 SLC35G3-201ENST00000297307 2004 ntAPPRIS P1 BASIC13.77□□□□□ -0.21
RAB40BQ12829 SWI5-201ENST00000320188 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
RAB40BQ12829 SGK2-201ENST00000341458 2498 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
RAB40BQ12829 ZKSCAN7-202ENST00000341840 1757 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
RAB40BQ12829 DPM3-203ENST00000368400 409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
RAB40BQ12829 TOMM34-201ENST00000372813 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
RAB40BQ12829 PSMD5-203ENST00000373904 1538 ntTSL 2 BASIC13.77□□□□□ -0.21
RAB40BQ12829 UPB1-202ENST00000382760 1928 ntTSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
RAB40BQ12829 AL133267.1-201ENST00000398220 340 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
RAB40BQ12829 MRPL3P1-201ENST00000400109 1033 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
RAB40BQ12829 CDPF1-204ENST00000404744 1541 ntTSL 3 BASIC13.77□□□□□ -0.21
RAB40BQ12829 CCNL2-202ENST00000408918 1186 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
RAB40BQ12829 C2orf76-202ENST00000409466 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
RAB40BQ12829 SPDYE17-201ENST00000412399 783 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
RAB40BQ12829 ACP5-202ENST00000412435 1527 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.77□□□□□ -0.21
RAB40BQ12829 RNF183-202ENST00000416588 849 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.77□□□□□ -0.21
RAB40BQ12829 HRAS-204ENST00000417302 1233 ntTSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
RAB40BQ12829 C1orf210-201ENST00000423420 629 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.77□□□□□ -0.21
RAB40BQ12829 AL353705.2-201ENST00000428243 662 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
RAB40BQ12829 PRSS42-201ENST00000429665 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
RAB40BQ12829 TLX1NB-202ENST00000445873 1862 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
RAB40BQ12829 ROPN1-203ENST00000459660 1909 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
RAB40BQ12829 TRAK1-208ENST00000484786 2008 ntTSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
RAB40BQ12829 MAGED4B-207ENST00000485287 2618 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
RAB40BQ12829 KIAA0930-215ENST00000496226 589 ntTSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
RAB40BQ12829 GFRA2-204ENST00000518077 1503 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
RAB40BQ12829 PAAF1-205ENST00000535604 1695 ntTSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
RAB40BQ12829 FKBP5-203ENST00000539068 3827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
RAB40BQ12829 POLG2-201ENST00000539111 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
RAB40BQ12829 AC018653.3-201ENST00000544657 749 ntTSL 3 BASIC13.77□□□□□ -0.21
RAB40BQ12829 AL133352.1-203ENST00000557395 1234 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC13.77□□□□□ -0.21
RAB40BQ12829 PLA2G15-209ENST00000566188 1203 ntTSL 2 BASIC13.77□□□□□ -0.21
RAB40BQ12829 PRSS54-204ENST00000567164 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
RAB40BQ12829 ZMYND15-204ENST00000573751 2409 ntTSL 2 BASIC13.77□□□□□ -0.21
RAB40BQ12829 ARMC7-203ENST00000581078 1002 ntTSL 2 BASIC13.77□□□□□ -0.21
RAB40BQ12829 MAP4K1-203ENST00000586296 1363 ntTSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
RAB40BQ12829 TK1-203ENST00000588734 1681 ntTSL 2 BASIC13.77□□□□□ -0.21
RAB40BQ12829 GFOD2-203ENST00000602377 1991 ntTSL 4 BASIC13.77□□□□□ -0.21
RAB40BQ12829 AC026120.1-201ENST00000611536 926 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
RAB40BQ12829 AC092634.8-201ENST00000639687 773 ntTSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
RAB40BQ12829 MAPKBP1-215ENST00000514566 5394 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
RAB40BQ12829 EDIL3-201ENST00000296591 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
RAB40BQ12829 IRAK1-203ENST00000369980 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
RAB40BQ12829 GNAO1-201ENST00000262493 3337 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
RAB40BQ12829 GPRC5C-202ENST00000392627 2988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
RAB40BQ12829 PRSS30P-201ENST00000390681 2881 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
RAB40BQ12829 HSD17B4-222ENST00000515320 2494 ntTSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
RAB40BQ12829 CMBL-201ENST00000296658 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
RAB40BQ12829 APBA1-201ENST00000265381 6534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
RAB40BQ12829 FLII-201ENST00000327031 4338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
RAB40BQ12829 MEGF11-203ENST00000409699 6163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
RAB40BQ12829 NOP2-222ENST00000617555 2017 ntTSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
RAB40BQ12829 MUTYH-210ENST00000450313 1929 ntTSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
RAB40BQ12829 CDK2AP1-205ENST00000542174 1812 ntTSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
RAB40BQ12829 CFLAR-205ENST00000342795 1613 ntTSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
RAB40BQ12829 ESR2-206ENST00000553796 1634 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
RAB40BQ12829 PAX3-203ENST00000344493 3109 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
RAB40BQ12829 USP4-203ENST00000415188 1454 ntTSL 3 BASIC13.76□□□□□ -0.21
RAB40BQ12829 GAL3ST4-202ENST00000411994 1404 ntTSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
RAB40BQ12829 FGR-203ENST00000374005 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
RAB40BQ12829 CASP2-207ENST00000619992 4006 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
RAB40BQ12829 ATP6AP2-233ENST00000638153 1303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
RAB40BQ12829 NAGK-201ENST00000244204 1154 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
RAB40BQ12829 NUDT4P1-201ENST00000322209 1206 ntAPPRIS P1 BASIC13.76□□□□□ -0.21
RAB40BQ12829 CD1E-209ENST00000368164 869 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
RAB40BQ12829 SNRPB-201ENST00000381342 1154 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
RAB40BQ12829 AMACR-204ENST00000382085 1195 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
RAB40BQ12829 SH3TC1-202ENST00000382521 829 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
RAB40BQ12829 MAPK15-202ENST00000395107 834 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
RAB40BQ12829 UFD1-202ENST00000399523 1007 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
RAB40BQ12829 LBH-204ENST00000406087 559 ntTSL 4 BASIC13.76□□□□□ -0.21
RAB40BQ12829 ELOB-202ENST00000409477 997 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
RAB40BQ12829 AP000695.1-201ENST00000429588 893 ntTSL 3 BASIC13.76□□□□□ -0.21
RAB40BQ12829 SNRPB-202ENST00000438552 1008 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
RAB40BQ12829 CDKN2A-209ENST00000498628 926 ntTSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
RAB40BQ12829 AC079140.1-201ENST00000508039 487 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
RAB40BQ12829 SLED1-202ENST00000512051 380 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
RAB40BQ12829 SLC1A4-205ENST00000531327 1217 ntTSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
RAB40BQ12829 AP000275.2-202ENST00000553001 929 ntTSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
RAB40BQ12829 MIEN1-205ENST00000577810 806 ntTSL 3 BASIC13.76□□□□□ -0.21
RAB40BQ12829 TNNT1-211ENST00000588426 683 ntTSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
RAB40BQ12829 AC004832.1-201ENST00000610936 1005 ntTSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
RAB40BQ12829 LINC01197-204ENST00000611265 956 ntTSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
RAB40BQ12829 MALAT1-213ENST00000618227 593 ntTSL 3 BASIC13.76□□□□□ -0.21
RAB40BQ12829 GOLGA2-215ENST00000639983 1038 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
RAB40BQ12829 SOCS2-205ENST00000548537 3733 ntTSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
RAB40BQ12829 TPD52L2-206ENST00000358548 2275 ntTSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
RAB40BQ12829 AC138028.2-202ENST00000567968 4528 ntTSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
RAB40BQ12829 RPRD1A-202ENST00000399022 4438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
RAB40BQ12829 TAB1-201ENST00000216160 3237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
RAB40BQ12829 CDH1-213ENST00000612417 2068 ntTSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.6 ms