Protein–RNA interactions for Protein: Q0VD83

APOBR, Apolipoprotein B receptor, humanhuman

Predictions only

Length 1,088 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOBRQ0VD83 ELAC1-201ENST00000269466 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
APOBRQ0VD83 FKBP9-201ENST00000242209 3462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
APOBRQ0VD83 E2F6-211ENST00000542100 3450 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
APOBRQ0VD83 GRAPL-201ENST00000344415 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
APOBRQ0VD83 AC093525.8-201ENST00000624099 1342 ntBASIC18■□□□□ 0.47
APOBRQ0VD83 REXO1L5P-201ENST00000622260 2098 ntBASIC18■□□□□ 0.47
APOBRQ0VD83 DHODH-201ENST00000219240 2426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
APOBRQ0VD83 CNN3-207ENST00000545882 1902 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
APOBRQ0VD83 ZNF586-201ENST00000391702 2265 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
APOBRQ0VD83 CLUH-202ENST00000570628 5244 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
APOBRQ0VD83 FBN2-205ENST00000508989 4987 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
APOBRQ0VD83 INTS4P2-202ENST00000614726 2019 ntBASIC18■□□□□ 0.47
APOBRQ0VD83 HMOX2-204ENST00000414777 1752 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
APOBRQ0VD83 ECHDC2-203ENST00000371522 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
APOBRQ0VD83 TEX28-203ENST00000617225 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
APOBRQ0VD83 SCAMP4-202ENST00000409472 2394 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
APOBRQ0VD83 COPE-202ENST00000349893 948 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
APOBRQ0VD83 ACTA1-201ENST00000366683 1122 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
APOBRQ0VD83 KRTAP6-3-201ENST00000391624 636 ntAPPRIS P1 BASIC18■□□□□ 0.47
APOBRQ0VD83 DERL3-204ENST00000406855 1063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
APOBRQ0VD83 AL353779.1-201ENST00000434793 351 ntBASIC18■□□□□ 0.47
APOBRQ0VD83 AC087294.1-202ENST00000439136 487 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
APOBRQ0VD83 AP001360.1-202ENST00000526934 479 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
APOBRQ0VD83 FAM212B-207ENST00000534365 1217 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
APOBRQ0VD83 CDK4-206ENST00000549606 558 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
APOBRQ0VD83 AC120045.2-201ENST00000567334 178 ntBASIC18■□□□□ 0.47
APOBRQ0VD83 AC087294.1-201ENST00000580291 1152 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
APOBRQ0VD83 INO80C-210ENST00000590757 595 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
APOBRQ0VD83 AC007431.3-201ENST00000623221 587 ntBASIC18■□□□□ 0.47
APOBRQ0VD83 LINC00592-202ENST00000640420 768 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
APOBRQ0VD83 MPDU1-201ENST00000250124 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
APOBRQ0VD83 LINC02551-202ENST00000533812 2203 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
APOBRQ0VD83 SHISA6-202ENST00000409168 7262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
APOBRQ0VD83 SUPT20H-212ENST00000475892 2836 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
APOBRQ0VD83 EHHADH-203ENST00000456310 2577 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
APOBRQ0VD83 CACNA1A-240ENST00000637432 7809 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
APOBRQ0VD83 DUS2-207ENST00000565263 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
APOBRQ0VD83 CNOT9-208ENST00000542068 3259 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
APOBRQ0VD83 RALGDS-202ENST00000372050 3634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
APOBRQ0VD83 ZNF180-202ENST00000391956 3049 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
APOBRQ0VD83 LINC00116-201ENST00000414416 2051 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
APOBRQ0VD83 CPEB2-201ENST00000259997 5612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
APOBRQ0VD83 SEC24D-202ENST00000419654 2786 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
APOBRQ0VD83 NFYC-205ENST00000372654 1455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
APOBRQ0VD83 BTBD11-204ENST00000420571 3478 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
APOBRQ0VD83 NUP62-212ENST00000597723 1824 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
APOBRQ0VD83 NF2-209ENST00000403999 2999 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
APOBRQ0VD83 ARIH2-205ENST00000449376 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
APOBRQ0VD83 PELP1-208ENST00000572293 5272 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
APOBRQ0VD83 CCNL1-202ENST00000295926 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
APOBRQ0VD83 NCK2-203ENST00000393349 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
APOBRQ0VD83 AGAP4-208ENST00000618171 2387 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
APOBRQ0VD83 NOX3-201ENST00000159060 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
APOBRQ0VD83 SPDYE6-201ENST00000563237 1691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
APOBRQ0VD83 TBCD-202ENST00000539345 3975 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
APOBRQ0VD83 MBD1-217ENST00000588937 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
APOBRQ0VD83 FOXRED2-204ENST00000397224 4967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
APOBRQ0VD83 MFRP-205ENST00000619721 3917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
APOBRQ0VD83 FURIN-207ENST00000618099 4345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
APOBRQ0VD83 RNF168-201ENST00000318037 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
APOBRQ0VD83 AL158070.2-201ENST00000623713 1621 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
APOBRQ0VD83 AP1M1-211ENST00000590756 1705 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
APOBRQ0VD83 STAT1-203ENST00000392323 2723 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
APOBRQ0VD83 UBXN1-201ENST00000294119 1291 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
APOBRQ0VD83 CTRB1-201ENST00000361017 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
APOBRQ0VD83 ZDHHC12-201ENST00000372663 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
APOBRQ0VD83 SDHB-201ENST00000375499 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
APOBRQ0VD83 RTN4RL2-202ENST00000395120 582 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
APOBRQ0VD83 RHOG-203ENST00000396979 1289 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
APOBRQ0VD83 RAB34-206ENST00000415040 1293 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
APOBRQ0VD83 MYCLP2-201ENST00000449268 967 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
APOBRQ0VD83 CCDC159-201ENST00000458408 1062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
APOBRQ0VD83 AC104596.2-201ENST00000512793 793 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
APOBRQ0VD83 AC067930.5-201ENST00000531730 1173 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
APOBRQ0VD83 RHOG-204ENST00000533217 886 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
APOBRQ0VD83 AC092552.1-201ENST00000547243 906 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
APOBRQ0VD83 C17orf49-209ENST00000552775 779 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
APOBRQ0VD83 CARHSP1-203ENST00000561530 729 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
APOBRQ0VD83 AC138028.3-201ENST00000561699 213 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
APOBRQ0VD83 AL359711.2-201ENST00000563105 872 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
APOBRQ0VD83 ZNF324B-203ENST00000594214 564 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
APOBRQ0VD83 TM4SF19-AS1-203ENST00000452051 1829 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
APOBRQ0VD83 AC007686.3-201ENST00000619017 3487 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
APOBRQ0VD83 PITX2-205ENST00000394598 1906 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
APOBRQ0VD83 PPP1R21-201ENST00000281394 3137 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
APOBRQ0VD83 HIST1H2AC-203ENST00000602637 1462 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
APOBRQ0VD83 RCAN3-202ENST00000374395 6802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
APOBRQ0VD83 PES1-204ENST00000402284 2144 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
APOBRQ0VD83 ARFIP1-204ENST00000429148 1599 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
APOBRQ0VD83 DUS4L-201ENST00000265720 2220 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
APOBRQ0VD83 TJP1-201ENST00000346128 7950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
APOBRQ0VD83 STK40-204ENST00000373132 3621 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
APOBRQ0VD83 FOXB1-201ENST00000396057 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
APOBRQ0VD83 PRODH2-201ENST00000301175 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
APOBRQ0VD83 PVR-203ENST00000403059 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
APOBRQ0VD83 DCAF5-201ENST00000341516 5953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
APOBRQ0VD83 ZNF772-202ENST00000356584 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
APOBRQ0VD83 MGEA5-201ENST00000357797 3263 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
APOBRQ0VD83 TMEM184A-201ENST00000297477 6276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
APOBRQ0VD83 ANKRD44-203ENST00000409153 2724 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.3 ms