Protein–RNA interactions for Protein: Q0VAF6

SYCN, Syncollin, humanhuman

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Length 134 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYCNQ0VAF6 CLCN2-202ENST00000344937 3187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
SYCNQ0VAF6 INPP5B-204ENST00000373026 3230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
SYCNQ0VAF6 PAPOLA-223ENST00000557320 3264 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
SYCNQ0VAF6 AC012313.3-202ENST00000599109 3322 ntTSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
SYCNQ0VAF6 UBC-205ENST00000536769 3745 ntAPPRIS P1 BASIC10.2□□□□□ -0.78
SYCNQ0VAF6 TBC1D24-207ENST00000627285 4382 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
SYCNQ0VAF6 MSL2-201ENST00000309993 4692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
SYCNQ0VAF6 ZNF395-201ENST00000344423 4808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
SYCNQ0VAF6 KCTD3-201ENST00000259154 3931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
SYCNQ0VAF6 LSM6-201ENST00000296581 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
SYCNQ0VAF6 PAQR6-204ENST00000356983 2143 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC10.2□□□□□ -0.78
SYCNQ0VAF6 KCNQ2-204ENST00000359125 3253 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
SYCNQ0VAF6 SMAP1-202ENST00000370452 2491 ntTSL 2 BASIC10.2□□□□□ -0.78
SYCNQ0VAF6 CAP1-205ENST00000372802 2964 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
SYCNQ0VAF6 LRCOL1-201ENST00000376608 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
SYCNQ0VAF6 RETN-202ENST00000381324 249 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
SYCNQ0VAF6 OCIAD1-202ENST00000381473 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
SYCNQ0VAF6 G6PD-203ENST00000393564 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
SYCNQ0VAF6 WRAP53-202ENST00000396463 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
SYCNQ0VAF6 WRB-204ENST00000398753 699 ntTSL 3 BASIC10.2□□□□□ -0.78
SYCNQ0VAF6 ZBTB14-202ENST00000400143 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
SYCNQ0VAF6 HNRNPA3P1-201ENST00000401429 1139 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
SYCNQ0VAF6 TBC1D8-202ENST00000409318 3803 ntTSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
SYCNQ0VAF6 AC093702.1-201ENST00000423433 367 ntTSL 3 BASIC10.2□□□□□ -0.78
SYCNQ0VAF6 DBH-AS1-201ENST00000425189 2139 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
SYCNQ0VAF6 AL133481.1-201ENST00000438554 511 ntTSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
SYCNQ0VAF6 PRMT2-207ENST00000440086 1932 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
SYCNQ0VAF6 AL589923.1-201ENST00000441473 316 ntTSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
SYCNQ0VAF6 SLC25A36-204ENST00000453248 1040 ntTSL 2 BASIC10.2□□□□□ -0.78
SYCNQ0VAF6 HNRNPA3P5-201ENST00000455201 833 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
SYCNQ0VAF6 KRT18P43-201ENST00000469825 1281 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
SYCNQ0VAF6 SEPT11-206ENST00000505788 2079 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
SYCNQ0VAF6 AC137894.1-201ENST00000526431 547 ntTSL 2 BASIC10.2□□□□□ -0.78
SYCNQ0VAF6 TMEM5-205ENST00000537373 1966 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
SYCNQ0VAF6 AL583722.1-201ENST00000540171 1307 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
SYCNQ0VAF6 AL512361.1-201ENST00000554200 418 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
SYCNQ0VAF6 MC1R-202ENST00000555147 3099 ntAPPRIS P1 BASIC10.2□□□□□ -0.78
SYCNQ0VAF6 LINGO1-204ENST00000561030 2677 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
SYCNQ0VAF6 AC138207.8-201ENST00000579692 739 ntTSL 3 BASIC10.2□□□□□ -0.78
SYCNQ0VAF6 ZNF286A-218ENST00000583566 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
SYCNQ0VAF6 BORCS8-206ENST00000585679 801 ntTSL 3 BASIC10.2□□□□□ -0.78
SYCNQ0VAF6 AP001160.2-201ENST00000596071 487 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
SYCNQ0VAF6 MAGEA2-202ENST00000598543 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
SYCNQ0VAF6 RIBC2-202ENST00000614167 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
SYCNQ0VAF6 CBY1-211ENST00000619293 1118 ntTSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
SYCNQ0VAF6 NNAT-201ENST00000062104 1297 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
SYCNQ0VAF6 NR2E3-203ENST00000621098 2064 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
SYCNQ0VAF6 FAM30A-205ENST00000630242 9612 ntTSL 2 BASIC10.2□□□□□ -0.78
SYCNQ0VAF6 SFT2D2-204ENST00000630869 1073 ntTSL 4 BASIC10.2□□□□□ -0.78
SYCNQ0VAF6 WDR45-240ENST00000635003 1376 ntTSL 3 BASIC10.2□□□□□ -0.78
SYCNQ0VAF6 AL109936.8-201ENST00000641772 604 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
SYCNQ0VAF6 MYLK-201ENST00000346322 5892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
SYCNQ0VAF6 MROH2A-201ENST00000389758 5355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
SYCNQ0VAF6 CACNA2D2-204ENST00000424201 5206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
SYCNQ0VAF6 PI4K2A-201ENST00000370631 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
SYCNQ0VAF6 DHX36-201ENST00000308361 3487 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
SYCNQ0VAF6 DNAJC14-203ENST00000357606 3416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
SYCNQ0VAF6 EPHX2-207ENST00000521400 3140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
SYCNQ0VAF6 PPP2R5D-202ENST00000394110 2894 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
SYCNQ0VAF6 RASA4B-207ENST00000541662 2794 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.2□□□□□ -0.78
SYCNQ0VAF6 TNRC18P2-201ENST00000417666 2714 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
SYCNQ0VAF6 TMEM50A-201ENST00000374358 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
SYCNQ0VAF6 LINC00884-202ENST00000448892 2680 ntTSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
SYCNQ0VAF6 POR-201ENST00000394893 2532 ntTSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
SYCNQ0VAF6 ALG9-201ENST00000398006 2345 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
SYCNQ0VAF6 HGSNAT-207ENST00000521576 2332 ntTSL 2 BASIC10.19□□□□□ -0.78
SYCNQ0VAF6 ZNF586-203ENST00000396154 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
SYCNQ0VAF6 TXNDC2-206ENST00000611534 2066 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
SYCNQ0VAF6 PI16-203ENST00000611814 2083 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
SYCNQ0VAF6 SLC36A1-207ENST00000520701 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
SYCNQ0VAF6 TPD52-201ENST00000379096 4041 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
SYCNQ0VAF6 CEACAM19-202ENST00000403660 1982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
SYCNQ0VAF6 SLC2A4-202ENST00000424875 1852 ntTSL 2 BASIC10.19□□□□□ -0.78
SYCNQ0VAF6 SNCAIP-207ENST00000504884 1885 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
SYCNQ0VAF6 HNRNPA1-202ENST00000340913 1842 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
SYCNQ0VAF6 PPP2R1A-201ENST00000322088 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
SYCNQ0VAF6 NUP160-201ENST00000378460 5376 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
SYCNQ0VAF6 BPGM-201ENST00000344924 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
SYCNQ0VAF6 NT5C3A-204ENST00000405342 1759 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
SYCNQ0VAF6 PHF19-203ENST00000419155 3525 ntTSL 2 BASIC10.19□□□□□ -0.78
SYCNQ0VAF6 MAGEA2B-202ENST00000370293 1714 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.19□□□□□ -0.78
SYCNQ0VAF6 CACNA1I-202ENST00000402142 10004 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
SYCNQ0VAF6 TTC13-201ENST00000366661 3253 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
SYCNQ0VAF6 NME7-201ENST00000367811 1642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
SYCNQ0VAF6 DDX55-203ENST00000421670 1574 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
SYCNQ0VAF6 NOX4-207ENST00000525196 1555 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
SYCNQ0VAF6 DUSP22-202ENST00000419235 3098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.19□□□□□ -0.78
SYCNQ0VAF6 TEKT4-201ENST00000295201 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
SYCNQ0VAF6 PLIN3-202ENST00000585479 1535 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
SYCNQ0VAF6 SLC9A8-201ENST00000361573 6094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
SYCNQ0VAF6 INSIG1-201ENST00000340368 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
SYCNQ0VAF6 PRRT3-202ENST00000411976 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
SYCNQ0VAF6 CYP2AB1P-202ENST00000454440 1456 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
SYCNQ0VAF6 AC138969.3-201ENST00000546612 1459 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
SYCNQ0VAF6 AC138932.2-201ENST00000548268 1459 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
SYCNQ0VAF6 AC126755.4-201ENST00000549796 1459 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
SYCNQ0VAF6 HNRNPK-204ENST00000376263 2942 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
SYCNQ0VAF6 ELMOD1-201ENST00000265840 2852 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
SYCNQ0VAF6 ZCCHC4-201ENST00000302874 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
SYCNQ0VAF6 DNAJA4-206ENST00000446172 1399 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
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