Protein–RNA interactions for Protein: Q08499

PDE4D, cAMP-specific 3',5'-cyclic phosphodiesterase 4D, humanhuman

Predictions only

Length 809 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE4DQ08499 STAT5B-201ENST00000293328 5103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
PDE4DQ08499 SLC39A9-209ENST00000556605 2065 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
PDE4DQ08499 TAF6-209ENST00000452041 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
PDE4DQ08499 ACSM2B-207ENST00000565232 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
PDE4DQ08499 ZNF7-207ENST00000528372 2905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
PDE4DQ08499 ARL8B-208ENST00000611208 2981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
PDE4DQ08499 SYN1-202ENST00000340666 3172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
PDE4DQ08499 ZNF687-201ENST00000324048 5378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
PDE4DQ08499 ZNF276-201ENST00000289816 4589 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
PDE4DQ08499 MC1R-202ENST00000555147 3099 ntAPPRIS P1 BASIC17.59■□□□□ 0.41
PDE4DQ08499 KCNC2-207ENST00000548513 3026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
PDE4DQ08499 MIEF2-203ENST00000395704 2879 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
PDE4DQ08499 AP000866.1-201ENST00000499143 2886 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
PDE4DQ08499 ATP6V0A1-204ENST00000537728 2774 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
PDE4DQ08499 PLEKHA4-202ENST00000355496 2614 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
PDE4DQ08499 CCDC110-209ENST00000510617 2592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
PDE4DQ08499 RGL3-201ENST00000380456 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
PDE4DQ08499 PPM1J-202ENST00000464951 2474 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
PDE4DQ08499 CHRNG-202ENST00000389494 2262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
PDE4DQ08499 TRIP10-210ENST00000600428 2249 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
PDE4DQ08499 MLPH-204ENST00000410032 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
PDE4DQ08499 MYOC-201ENST00000037502 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
PDE4DQ08499 TIRAP-203ENST00000392680 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
PDE4DQ08499 FAM49B-201ENST00000401979 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
PDE4DQ08499 LINC00996-201ENST00000477392 2043 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
PDE4DQ08499 TPRX1-201ENST00000322175 1924 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
PDE4DQ08499 RNASEH1-201ENST00000315212 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
PDE4DQ08499 SEC13-201ENST00000337354 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
PDE4DQ08499 RB1CC1-202ENST00000435644 6614 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
PDE4DQ08499 AL583835.2-202ENST00000421363 1104 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
PDE4DQ08499 AC009908.1-201ENST00000523030 412 ntTSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
PDE4DQ08499 LINC02281-201ENST00000549013 375 ntTSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
PDE4DQ08499 IFI27L1-210ENST00000556381 804 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
PDE4DQ08499 LINC02299-201ENST00000556669 430 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
PDE4DQ08499 AL133153.2-201ENST00000557524 303 ntTSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
PDE4DQ08499 GNRHR2-203ENST00000581100 1187 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
PDE4DQ08499 BX539320.1-201ENST00000623759 877 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
PDE4DQ08499 AL391650.2-201ENST00000640097 941 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
PDE4DQ08499 MKNK2-201ENST00000250896 3774 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
PDE4DQ08499 YY1AP1-210ENST00000368339 3073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
PDE4DQ08499 LRP10-201ENST00000359591 6886 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
PDE4DQ08499 ROBO3-201ENST00000397801 4569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
PDE4DQ08499 ROBO3-220ENST00000538940 4551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
PDE4DQ08499 TRPC6-206ENST00000532133 2648 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
PDE4DQ08499 AC023024.1-201ENST00000558838 2590 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
PDE4DQ08499 AC073264.3-201ENST00000636941 2577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
PDE4DQ08499 GHDC-203ENST00000428494 2518 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
PDE4DQ08499 MAP2K3-202ENST00000342679 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
PDE4DQ08499 AC067930.6-201ENST00000623257 4947 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
PDE4DQ08499 CNPPD1-202ENST00000409789 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
PDE4DQ08499 MLPH-203ENST00000409373 2031 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
PDE4DQ08499 GRID2IP-201ENST00000435185 3215 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
PDE4DQ08499 CNN1-210ENST00000592923 1848 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.41
PDE4DQ08499 WAC-203ENST00000354911 3042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
PDE4DQ08499 NRCAM-217ENST00000613830 3025 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
PDE4DQ08499 PCDHA6-203ENST00000529310 5374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
PDE4DQ08499 ACBD5-202ENST00000375897 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.41
PDE4DQ08499 CBX7-201ENST00000216133 4081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
PDE4DQ08499 AC138035.3-201ENST00000622706 2791 ntBASIC17.58■□□□□ 0.41
PDE4DQ08499 SLC4A2-214ENST00000485713 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
PDE4DQ08499 ADAM15-205ENST00000360674 2732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
PDE4DQ08499 RASA1-201ENST00000274376 3752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
PDE4DQ08499 KRT82-201ENST00000257974 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
PDE4DQ08499 RDM1-224ENST00000619262 1535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
PDE4DQ08499 DUSP18-201ENST00000334679 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
PDE4DQ08499 C7orf49-201ENST00000393114 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
PDE4DQ08499 LINC01205-202ENST00000497996 1493 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.41
PDE4DQ08499 UBE3B-201ENST00000340074 1448 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
PDE4DQ08499 TDRD6-201ENST00000316081 6817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
PDE4DQ08499 IL6ST-209ENST00000502326 3007 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
PDE4DQ08499 POLR2I-201ENST00000221859 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
PDE4DQ08499 AKIP1-202ENST00000309357 1232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
PDE4DQ08499 ZNF804B-201ENST00000333190 4659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
PDE4DQ08499 NDUFA3-203ENST00000391763 338 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
PDE4DQ08499 BRWD1P1-201ENST00000401091 371 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
PDE4DQ08499 PRAP1-201ENST00000433452 971 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
PDE4DQ08499 ACTBP11-201ENST00000436287 1126 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
PDE4DQ08499 YBX1P6-201ENST00000442962 1002 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
PDE4DQ08499 AL355994.2-201ENST00000447882 704 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
PDE4DQ08499 STARD4-205ENST00000505803 803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
PDE4DQ08499 STARD4-207ENST00000509887 1186 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
PDE4DQ08499 AC000032.1-201ENST00000562538 491 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
PDE4DQ08499 AL109954.1-202ENST00000564051 2148 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
PDE4DQ08499 FAM192A-212ENST00000566077 1066 ntTSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.4
PDE4DQ08499 AC009134.1-201ENST00000571939 443 ntTSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.4
PDE4DQ08499 AC068473.4-201ENST00000587527 585 ntTSL 4 BASIC17.58■□□□□ 0.4
PDE4DQ08499 FBXL12-211ENST00000591009 1005 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
PDE4DQ08499 LARP4-220ENST00000615080 856 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
PDE4DQ08499 AC004834.1-204ENST00000640670 1055 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
PDE4DQ08499 PITPNC1-203ENST00000580974 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
PDE4DQ08499 DNAJB9-201ENST00000249356 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
PDE4DQ08499 PBX1-219ENST00000560641 3225 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
PDE4DQ08499 AL354813.1-201ENST00000526566 2437 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
PDE4DQ08499 CNST-203ENST00000366513 5126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
PDE4DQ08499 JAKMIP1-204ENST00000409831 2371 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
PDE4DQ08499 TOM1-209ENST00000447733 2317 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
PDE4DQ08499 TSSC2-204ENST00000529482 2337 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
PDE4DQ08499 NTRK2-205ENST00000376208 8178 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
PDE4DQ08499 NME7-201ENST00000367811 1642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
PDE4DQ08499 PRKAG3-206ENST00000529249 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.8 ms