Protein–RNA interactions for Protein: Q08477

CYP4F3, Docosahexaenoic acid omega-hydroxylase CYP4F3, humanhuman

Predictions only

Length 520 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CYP4F3Q08477 GRB2-202ENST00000316804 3248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CYP4F3Q08477 POP4-201ENST00000221770 2321 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CYP4F3Q08477 MAP2K3-202ENST00000342679 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CYP4F3Q08477 AC087481.3-201ENST00000602886 1894 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
CYP4F3Q08477 SLC44A3-206ENST00000527077 1943 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CYP4F3Q08477 PPP1R1B-205ENST00000579000 1466 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CYP4F3Q08477 GDF2-201ENST00000581492 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CYP4F3Q08477 PARD3B-204ENST00000406610 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CYP4F3Q08477 BRSK2-204ENST00000526678 2091 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CYP4F3Q08477 UBE2D1-204ENST00000615793 2621 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CYP4F3Q08477 PGBD2-201ENST00000329291 2136 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CYP4F3Q08477 MARCKS-201ENST00000612661 4275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CYP4F3Q08477 MAP3K1-201ENST00000399503 7011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CYP4F3Q08477 KIFC3-205ENST00000540079 2781 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CYP4F3Q08477 LINC02551-202ENST00000533812 2203 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CYP4F3Q08477 RIMS1-216ENST00000521978 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CYP4F3Q08477 C9orf78-201ENST00000372447 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CYP4F3Q08477 C15orf62-201ENST00000344320 2370 ntAPPRIS P1 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CYP4F3Q08477 LRRC57-202ENST00000397130 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CYP4F3Q08477 SPAG6-201ENST00000313311 2421 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CYP4F3Q08477 SULT1C4-201ENST00000272452 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CYP4F3Q08477 PIGT-201ENST00000279035 1880 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CYP4F3Q08477 LINC01136-203ENST00000457348 2539 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CYP4F3Q08477 PRSS55-201ENST00000328655 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CYP4F3Q08477 UROS-203ENST00000368786 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CYP4F3Q08477 LINC01248-201ENST00000458264 468 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CYP4F3Q08477 STAG3L5P-205ENST00000473757 1255 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CYP4F3Q08477 AL161781.2-201ENST00000509911 739 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CYP4F3Q08477 ACRV1-202ENST00000527795 782 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CYP4F3Q08477 LINC02279-201ENST00000553435 737 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CYP4F3Q08477 CX3CL1-203ENST00000564948 563 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CYP4F3Q08477 YIF1B-214ENST00000591784 940 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CYP4F3Q08477 KLK3-204ENST00000593997 1035 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CYP4F3Q08477 AC133539.2-201ENST00000604757 467 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
CYP4F3Q08477 ANKRD33-201ENST00000301190 1935 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CYP4F3Q08477 UHMK1-202ENST00000489294 8478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CYP4F3Q08477 REXO1L1P-202ENST00000608646 1974 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
CYP4F3Q08477 KRT82-201ENST00000257974 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CYP4F3Q08477 CAMK1D-204ENST00000619168 8153 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CYP4F3Q08477 FAM172A-204ENST00000505869 1387 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CYP4F3Q08477 PRG2-202ENST00000525955 1367 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CYP4F3Q08477 PSMC3-212ENST00000602866 1373 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CYP4F3Q08477 RABGAP1L-201ENST00000251507 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CYP4F3Q08477 AP000704.1-201ENST00000637940 2182 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CYP4F3Q08477 PFDN4-201ENST00000371419 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CYP4F3Q08477 CARMIL3-201ENST00000342740 4597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CYP4F3Q08477 HGSNAT-207ENST00000521576 2332 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CYP4F3Q08477 DMAC2-201ENST00000221943 1692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CYP4F3Q08477 MAP1S-201ENST00000324096 3419 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CYP4F3Q08477 TRIML1-201ENST00000332517 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CYP4F3Q08477 LINC01565-201ENST00000356020 2697 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CYP4F3Q08477 C11orf80-201ENST00000360962 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CYP4F3Q08477 TFB2M-201ENST00000366514 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CYP4F3Q08477 INPP5B-202ENST00000373023 4694 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CYP4F3Q08477 FAM192A-201ENST00000309137 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CYP4F3Q08477 FAM160B1-203ENST00000369250 2870 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CYP4F3Q08477 ANKMY1-207ENST00000403283 2874 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CYP4F3Q08477 AC011477.6-201ENST00000604980 1927 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
CYP4F3Q08477 SYBU-206ENST00000424158 3007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CYP4F3Q08477 RRP1-207ENST00000497547 3022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CYP4F3Q08477 STAT6-225ENST00000640254 2037 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CYP4F3Q08477 KIAA1211-206ENST00000541073 4117 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CYP4F3Q08477 COBL-203ENST00000395542 5339 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CYP4F3Q08477 PRLHR-201ENST00000239032 5446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CYP4F3Q08477 C18orf25-203ENST00000615052 5462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CYP4F3Q08477 COG3-201ENST00000349995 4498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CYP4F3Q08477 EPHA5-202ENST00000354839 3427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CYP4F3Q08477 ZNF451-201ENST00000357489 4998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CYP4F3Q08477 SPAG7-201ENST00000206020 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CYP4F3Q08477 STK40-202ENST00000373129 3846 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CYP4F3Q08477 TAGLN-202ENST00000392951 928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CYP4F3Q08477 AZGP1P1-201ENST00000411909 902 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
CYP4F3Q08477 ACTG1P3-201ENST00000431775 1114 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
CYP4F3Q08477 AL162726.2-201ENST00000438986 1017 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
CYP4F3Q08477 RPL7P3-201ENST00000441388 714 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
CYP4F3Q08477 RN7SL399P-201ENST00000471648 279 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
CYP4F3Q08477 FXR1-221ENST00000491674 365 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CYP4F3Q08477 AC108142.1-201ENST00000505389 286 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CYP4F3Q08477 AC008406.2-201ENST00000507058 532 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CYP4F3Q08477 HNRNPA1P13-201ENST00000510646 963 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
CYP4F3Q08477 AP001453.3-201ENST00000545800 853 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CYP4F3Q08477 LINC01595-201ENST00000555406 639 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CYP4F3Q08477 MIR5189-201ENST00000577370 114 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
CYP4F3Q08477 Z84492.1-201ENST00000606589 408 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CYP4F3Q08477 EID3-201ENST00000527879 1467 ntAPPRIS P1 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CYP4F3Q08477 C1orf43-202ENST00000362076 1551 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CYP4F3Q08477 OXCT1-AS1-201ENST00000508458 1731 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CYP4F3Q08477 SLC22A16-202ENST00000368919 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CYP4F3Q08477 TIRAP-203ENST00000392680 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CYP4F3Q08477 GRAMD1C-201ENST00000358160 4177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CYP4F3Q08477 AP000439.3-201ENST00000545202 2376 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CYP4F3Q08477 SLC29A2-207ENST00000619145 2380 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CYP4F3Q08477 CAMKK2-203ENST00000347034 5218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CYP4F3Q08477 ATP6V0A1-204ENST00000537728 2774 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CYP4F3Q08477 FGFR1OP2-201ENST00000229395 2924 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CYP4F3Q08477 CLCN2-202ENST00000344937 3187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CYP4F3Q08477 MEN1-207ENST00000377326 3150 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CYP4F3Q08477 ZFAND4-203ENST00000374366 3821 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CYP4F3Q08477 HSPH1-201ENST00000320027 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CYP4F3Q08477 PPM1F-203ENST00000407142 5587 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.3 ms