Protein–RNA interactions for Protein: Q07325

CXCL9, C-X-C motif chemokine 9, humanhuman

Predictions only

Length 125 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CXCL9Q07325 AC010531.4-203ENST00000561709 660 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CXCL9Q07325 AL603832.2-201ENST00000566195 2125 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
CXCL9Q07325 RPL19-207ENST00000582193 792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CXCL9Q07325 MIR6756-201ENST00000616240 63 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
CXCL9Q07325 MIR6769A-201ENST00000617340 73 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
CXCL9Q07325 KAZN-203ENST00000376030 6030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CXCL9Q07325 FAM151A-202ENST00000371304 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CXCL9Q07325 RUNX1-203ENST00000358356 2720 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CXCL9Q07325 VPS54-201ENST00000272322 3463 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CXCL9Q07325 CD83-201ENST00000379153 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CXCL9Q07325 F3-201ENST00000334047 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CXCL9Q07325 PIPOX-201ENST00000323372 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CXCL9Q07325 CES3-203ENST00000543856 3178 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CXCL9Q07325 STAR-201ENST00000276449 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CXCL9Q07325 SCAF11-204ENST00000395454 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CXCL9Q07325 PHKG1-205ENST00000452681 2226 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CXCL9Q07325 CRYBB1-201ENST00000215939 1102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CXCL9Q07325 FAM151A-201ENST00000302250 2005 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CXCL9Q07325 KIAA0391-202ENST00000321130 1589 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CXCL9Q07325 SLC6A9-202ENST00000360584 2330 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CXCL9Q07325 AL512430.1-201ENST00000392575 860 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
CXCL9Q07325 SELENOS-201ENST00000398226 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CXCL9Q07325 MSRB3-206ENST00000535664 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CXCL9Q07325 NR4A1-213ENST00000550082 2029 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CXCL9Q07325 TLE3-212ENST00000558201 2766 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CXCL9Q07325 AC005726.2-204ENST00000577790 511 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CXCL9Q07325 NAT9-220ENST00000582870 896 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CXCL9Q07325 AC008133.1-201ENST00000584688 557 ntTSL 4 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CXCL9Q07325 AC007881.3-201ENST00000608897 607 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
CXCL9Q07325 AL021453.1-201ENST00000333487 2989 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
CXCL9Q07325 SCRIB-203ENST00000377533 5108 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
CXCL9Q07325 MRPL57-201ENST00000309594 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
CXCL9Q07325 LAPTM4A-201ENST00000175091 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
CXCL9Q07325 MAN1C1-201ENST00000263979 2627 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
CXCL9Q07325 TUBB4B-201ENST00000340384 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CXCL9Q07325 PTK7-202ENST00000230419 4272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CXCL9Q07325 ZNF581-203ENST00000587252 1324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CXCL9Q07325 NKILA-202ENST00000614771 2598 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
CXCL9Q07325 AC025271.4-201ENST00000621477 1726 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
CXCL9Q07325 ACSF2-202ENST00000427954 2251 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CXCL9Q07325 LINC00487-201ENST00000382045 2131 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CXCL9Q07325 RUNX2-204ENST00000371438 5698 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CXCL9Q07325 FOXRED1-201ENST00000263578 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CXCL9Q07325 NFE2L1-214ENST00000582155 1998 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CXCL9Q07325 SH3GLB2-205ENST00000416629 1415 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CXCL9Q07325 TRAM1-201ENST00000262213 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CXCL9Q07325 TRMT10C-201ENST00000309922 1819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CXCL9Q07325 PDZK1IP1-201ENST00000294338 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CXCL9Q07325 COPS7B-205ENST00000409295 1009 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CXCL9Q07325 AC097065.1-201ENST00000425737 517 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
CXCL9Q07325 SKA2-202ENST00000437036 625 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CXCL9Q07325 UBXN7-AS1-201ENST00000442941 386 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CXCL9Q07325 GLYCTK-204ENST00000471180 992 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CXCL9Q07325 AC130709.1-201ENST00000484779 1212 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
CXCL9Q07325 AP000842.2-201ENST00000533033 517 ntTSL 4 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CXCL9Q07325 AC092139.2-201ENST00000563750 754 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CXCL9Q07325 RPL17P45-201ENST00000586289 509 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
CXCL9Q07325 SNRPD2-206ENST00000588301 702 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CXCL9Q07325 PAX4-207ENST00000611453 1235 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CXCL9Q07325 TRIM11-201ENST00000284551 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CXCL9Q07325 H1F0-201ENST00000340857 2344 ntAPPRIS P1 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CXCL9Q07325 REXO1L4P-201ENST00000605109 1937 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
CXCL9Q07325 OARD1-203ENST00000463088 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CXCL9Q07325 AC107871.1-202ENST00000562767 3389 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CXCL9Q07325 FBXW11-202ENST00000296933 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CXCL9Q07325 LINC00334-203ENST00000638500 1377 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CXCL9Q07325 HTR1B-201ENST00000369947 2021 ntAPPRIS P1 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CXCL9Q07325 HENMT1-202ENST00000370032 1874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CXCL9Q07325 CICP13-201ENST00000422015 2789 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
CXCL9Q07325 DRG2-201ENST00000225729 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CXCL9Q07325 AQP6-204ENST00000615425 2245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
CXCL9Q07325 PRDM5-202ENST00000394435 2492 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CXCL9Q07325 ZYG11A-202ENST00000371532 3942 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
CXCL9Q07325 RALYL-208ENST00000522455 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
CXCL9Q07325 PRRT2-214ENST00000637064 2153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
CXCL9Q07325 EIF2B3-201ENST00000360403 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CXCL9Q07325 DFNA5-202ENST00000409775 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CXCL9Q07325 EPN2-201ENST00000314728 4871 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CXCL9Q07325 CAAP1-201ENST00000333916 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CXCL9Q07325 LSM6-201ENST00000296581 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CXCL9Q07325 PRPF31-203ENST00000419967 2269 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
CXCL9Q07325 AC024909.3-201ENST00000611513 2257 ntBASIC18■□□□□ 0.47
CXCL9Q07325 DIMT1-201ENST00000199320 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CXCL9Q07325 CLIC5-202ENST00000339561 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CXCL9Q07325 FIS1-201ENST00000223136 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CXCL9Q07325 IL23A-201ENST00000228534 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CXCL9Q07325 RPP25L-202ENST00000378959 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CXCL9Q07325 SERF2-209ENST00000409646 559 ntTSL 4 BASIC18■□□□□ 0.47
CXCL9Q07325 AL592076.1-201ENST00000424448 303 ntBASIC18■□□□□ 0.47
CXCL9Q07325 AC079112.1-201ENST00000454972 939 ntBASIC18■□□□□ 0.47
CXCL9Q07325 IGHV3-37-201ENST00000518544 340 ntBASIC18■□□□□ 0.47
CXCL9Q07325 EIF1AD-211ENST00000533544 965 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
CXCL9Q07325 HPN-206ENST00000597419 1212 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
CXCL9Q07325 AC024941.2-201ENST00000625763 493 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
CXCL9Q07325 LIMS1-202ENST00000338045 1876 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CXCL9Q07325 VAC14-201ENST00000261776 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CXCL9Q07325 SMTNL1-202ENST00000527972 1649 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
CXCL9Q07325 ELN-221ENST00000445912 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
CXCL9Q07325 ALG9-201ENST00000398006 2345 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CXCL9Q07325 DIP2A-204ENST00000457905 3044 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.3 ms