Protein–RNA interactions for Protein: Q05D32

CTDSPL2, CTD small phosphatase-like protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 466 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTDSPL2Q05D32 CDCP2-201ENST00000371330 2723 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CTDSPL2Q05D32 CCDC85A-201ENST00000407595 3982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CTDSPL2Q05D32 GOLGA8M-201ENST00000563027 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CTDSPL2Q05D32 MAPT-213ENST00000571987 2277 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CTDSPL2Q05D32 KRT32-201ENST00000225899 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CTDSPL2Q05D32 HOXA3-202ENST00000396352 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CTDSPL2Q05D32 MAGI1-216ENST00000497477 3555 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CTDSPL2Q05D32 LIPE-AS1-205ENST00000594688 2383 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CTDSPL2Q05D32 LBX2-201ENST00000341396 886 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CTDSPL2Q05D32 LSM5-207ENST00000410044 687 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CTDSPL2Q05D32 USB1-202ENST00000423271 1217 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CTDSPL2Q05D32 HCST-202ENST00000437550 445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CTDSPL2Q05D32 AC234783.1-201ENST00000441761 496 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
CTDSPL2Q05D32 IP6K1-203ENST00000460540 1260 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CTDSPL2Q05D32 AC119751.2-201ENST00000504529 210 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
CTDSPL2Q05D32 SCGB1C2-201ENST00000595228 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CTDSPL2Q05D32 MTFMT-201ENST00000220058 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CTDSPL2Q05D32 BICDL1-201ENST00000397558 3055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CTDSPL2Q05D32 STBD1-201ENST00000237642 3420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CTDSPL2Q05D32 PIMREG-205ENST00000572447 1948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CTDSPL2Q05D32 KRTAP10-7-201ENST00000609664 1578 ntAPPRIS P1 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CTDSPL2Q05D32 PITPNB-202ENST00000335272 2926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CTDSPL2Q05D32 AL137783.1-201ENST00000623494 1896 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
CTDSPL2Q05D32 ANKRD17-201ENST00000330838 7734 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CTDSPL2Q05D32 CATSPER2P1-203ENST00000429276 1466 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CTDSPL2Q05D32 MECR-202ENST00000373791 2416 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CTDSPL2Q05D32 SCNN1D-205ENST00000379116 3044 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CTDSPL2Q05D32 NEDD4L-202ENST00000356462 3335 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CTDSPL2Q05D32 PIP5K1C-202ENST00000537021 3326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CTDSPL2Q05D32 SLC35A3-221ENST00000640600 3341 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CTDSPL2Q05D32 LMF2-201ENST00000216080 2658 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CTDSPL2Q05D32 SEMA7A-201ENST00000261918 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CTDSPL2Q05D32 INPP5B-204ENST00000373026 3230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CTDSPL2Q05D32 TARBP2-203ENST00000456234 1368 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CTDSPL2Q05D32 TCP11-206ENST00000412155 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CTDSPL2Q05D32 SIK3-201ENST00000375300 6213 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CTDSPL2Q05D32 AL928654.2-201ENST00000551271 2279 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CTDSPL2Q05D32 SPG21-203ENST00000433215 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CTDSPL2Q05D32 OIT3-202ENST00000622652 1602 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CTDSPL2Q05D32 GPAT2-204ENST00000453542 2466 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CTDSPL2Q05D32 DAAM2-211ENST00000633794 3871 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CTDSPL2Q05D32 SLC12A9-201ENST00000354161 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CTDSPL2Q05D32 POLR2I-201ENST00000221859 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CTDSPL2Q05D32 RPS15-201ENST00000233609 534 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CTDSPL2Q05D32 RAB41-201ENST00000276066 1071 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CTDSPL2Q05D32 TEX12-201ENST00000280358 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CTDSPL2Q05D32 UBXN1-201ENST00000294119 1291 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CTDSPL2Q05D32 RAB41-202ENST00000374473 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CTDSPL2Q05D32 SELENOM-201ENST00000400299 694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CTDSPL2Q05D32 AL121983.1-201ENST00000424181 335 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CTDSPL2Q05D32 HIST2H2BA-202ENST00000430394 752 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CTDSPL2Q05D32 KRT43P-201ENST00000434019 910 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
CTDSPL2Q05D32 RALY-AS1-203ENST00000440595 660 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CTDSPL2Q05D32 ATP5G2P4-201ENST00000442175 420 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
CTDSPL2Q05D32 FDPS-203ENST00000447866 1256 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CTDSPL2Q05D32 AC022210.1-201ENST00000449856 793 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
CTDSPL2Q05D32 ZNF331-217ENST00000512387 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CTDSPL2Q05D32 AC090735.1-201ENST00000523881 488 ntTSL 4 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CTDSPL2Q05D32 AC018653.3-202ENST00000538062 735 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CTDSPL2Q05D32 CARHSP1-203ENST00000561530 729 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CTDSPL2Q05D32 AC025279.2-201ENST00000569730 653 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
CTDSPL2Q05D32 RPS15-205ENST00000586686 562 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CTDSPL2Q05D32 GADD45B-204ENST00000587345 765 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CTDSPL2Q05D32 RPS15-208ENST00000591804 711 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CTDSPL2Q05D32 RPS15-209ENST00000592588 510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CTDSPL2Q05D32 SPATA21-206ENST00000612240 603 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CTDSPL2Q05D32 FP565260.6-205ENST00000624120 898 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CTDSPL2Q05D32 RAB34-222ENST00000625712 994 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CTDSPL2Q05D32 SERF2-217ENST00000630046 862 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CTDSPL2Q05D32 PHF19-203ENST00000419155 3525 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CTDSPL2Q05D32 RTL6-201ENST00000341255 5495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CTDSPL2Q05D32 GRID2IP-201ENST00000435185 3215 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CTDSPL2Q05D32 SHROOM1-201ENST00000319854 3190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CTDSPL2Q05D32 PDE1B-201ENST00000243052 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CTDSPL2Q05D32 NTMT1-204ENST00000372486 1487 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CTDSPL2Q05D32 PKIG-204ENST00000372889 1489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CTDSPL2Q05D32 AC118344.1-201ENST00000378432 1462 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CTDSPL2Q05D32 LRCH3-202ENST00000414675 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CTDSPL2Q05D32 ABHD14B-201ENST00000315877 2236 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CTDSPL2Q05D32 CNTLN-202ENST00000380647 5576 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CTDSPL2Q05D32 PNMA3-202ENST00000593810 1432 ntAPPRIS P1 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CTDSPL2Q05D32 GATA3-201ENST00000346208 2654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CTDSPL2Q05D32 TSEN2-201ENST00000284995 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CTDSPL2Q05D32 EPS8L2-201ENST00000318562 3148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CTDSPL2Q05D32 KCNJ5-203ENST00000533599 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CTDSPL2Q05D32 ZBTB37-203ENST00000367704 2323 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CTDSPL2Q05D32 AC023157.3-201ENST00000619086 2088 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
CTDSPL2Q05D32 FOXRED1-213ENST00000532125 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CTDSPL2Q05D32 ARFIP1-204ENST00000429148 1599 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CTDSPL2Q05D32 PSMC5-209ENST00000580864 1552 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CTDSPL2Q05D32 KDM6A-212ENST00000543216 5655 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CTDSPL2Q05D32 AURKC-203ENST00000448930 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CTDSPL2Q05D32 PAK6-203ENST00000542403 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CTDSPL2Q05D32 PDZD3-212ENST00000531114 2996 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CTDSPL2Q05D32 PPM1F-202ENST00000397495 1778 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CTDSPL2Q05D32 SUMO3-203ENST00000397898 1779 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CTDSPL2Q05D32 FER1L4-210ENST00000615531 5998 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
CTDSPL2Q05D32 SYT5-207ENST00000590851 3619 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CTDSPL2Q05D32 AC016694.1-201ENST00000434179 700 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
CTDSPL2Q05D32 RPS24-203ENST00000435275 656 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 83.4 ms