Protein–RNA interactions for Protein: Q03923

ZNF85, Zinc finger protein 85, humanhuman

Predictions only

Length 595 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF85Q03923 SLC35G3-201ENST00000297307 2004 ntAPPRIS P1 BASIC13.63□□□□□ -0.23
ZNF85Q03923 TRAK1-208ENST00000484786 2008 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
ZNF85Q03923 AGTPBP1-208ENST00000628899 4222 ntTSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
ZNF85Q03923 ARHGEF26-203ENST00000465817 2353 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
ZNF85Q03923 CUL7-203ENST00000535468 5504 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
ZNF85Q03923 E2F6-201ENST00000307236 3317 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
ZNF85Q03923 ABHD16A-202ENST00000440843 1906 ntTSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
ZNF85Q03923 SLC25A21-AS1-201ENST00000556667 1924 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
ZNF85Q03923 TAF4B-203ENST00000578121 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
ZNF85Q03923 ENO2-211ENST00000541477 2549 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
ZNF85Q03923 AL121757.1-201ENST00000430097 1836 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
ZNF85Q03923 ANKRD2-203ENST00000370655 1451 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
ZNF85Q03923 SPATS2L-209ENST00000409988 2698 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
ZNF85Q03923 UHRF1-204ENST00000616255 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
ZNF85Q03923 PER2-201ENST00000254657 6385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
ZNF85Q03923 RPTOR-201ENST00000306801 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
ZNF85Q03923 SHISA9-201ENST00000423335 4043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
ZNF85Q03923 ZEB2-225ENST00000558170 4012 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
ZNF85Q03923 PIGS-203ENST00000395346 2815 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
ZNF85Q03923 ACER2-201ENST00000340967 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
ZNF85Q03923 ZNF398-205ENST00000491174 2232 ntTSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
ZNF85Q03923 CCNF-202ENST00000397066 4283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
ZNF85Q03923 KCTD10-208ENST00000540089 3096 ntTSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
ZNF85Q03923 GAD2-201ENST00000259271 2462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
ZNF85Q03923 HENMT1-202ENST00000370032 1874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
ZNF85Q03923 FAM120A-202ENST00000375389 3585 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
ZNF85Q03923 NMRK2-201ENST00000168977 1126 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
ZNF85Q03923 TCEAL2-201ENST00000329035 1080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
ZNF85Q03923 MOB1B-202ENST00000396051 1107 ntTSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
ZNF85Q03923 C22orf39-203ENST00000399568 1005 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
ZNF85Q03923 AC004832.2-201ENST00000426397 482 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
ZNF85Q03923 C21orf33-205ENST00000427803 1077 ntTSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
ZNF85Q03923 SPDYE14P-201ENST00000442619 822 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
ZNF85Q03923 AC139887.2-202ENST00000507446 534 ntTSL 4 BASIC13.62□□□□□ -0.23
ZNF85Q03923 AC009720.1-201ENST00000511867 586 ntTSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
ZNF85Q03923 PUS1-205ENST00000535067 838 ntTSL 3 BASIC13.62□□□□□ -0.23
ZNF85Q03923 COQ7-202ENST00000544894 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
ZNF85Q03923 AL928654.4-206ENST00000551180 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
ZNF85Q03923 AL079307.3-201ENST00000556114 283 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
ZNF85Q03923 CARHSP1-203ENST00000561530 729 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.62□□□□□ -0.23
ZNF85Q03923 AC093520.2-201ENST00000561830 333 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
ZNF85Q03923 DCTPP1-203ENST00000567983 801 ntTSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
ZNF85Q03923 ELOF1-204ENST00000587806 1172 ntTSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
ZNF85Q03923 RAMP2-205ENST00000589683 858 ntTSL 3 BASIC13.62□□□□□ -0.23
ZNF85Q03923 TEX264-216ENST00000614067 1174 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.62□□□□□ -0.23
ZNF85Q03923 NMRK2-205ENST00000616156 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
ZNF85Q03923 AQP12B-206ENST00000621682 1080 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
ZNF85Q03923 MAST1-201ENST00000251472 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
ZNF85Q03923 NAPA-AS1-201ENST00000593284 1753 ntTSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
ZNF85Q03923 SEC16A-202ENST00000290037 8982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
ZNF85Q03923 TPGS2-220ENST00000610723 1426 ntTSL 3 BASIC13.62□□□□□ -0.23
ZNF85Q03923 UPB1-202ENST00000382760 1928 ntTSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
ZNF85Q03923 SUCO-204ENST00000608151 5790 ntTSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
ZNF85Q03923 TMPRSS3-204ENST00000433957 2403 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
ZNF85Q03923 DTX3-202ENST00000548198 3199 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
ZNF85Q03923 TOB2-201ENST00000327492 4561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
ZNF85Q03923 SLC38A10-202ENST00000374759 4300 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
ZNF85Q03923 TMEM209-202ENST00000462753 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
ZNF85Q03923 ARFIP1-204ENST00000429148 1599 ntTSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
ZNF85Q03923 DMTN-209ENST00000517600 1569 ntTSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
ZNF85Q03923 SYT13-201ENST00000020926 5144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
ZNF85Q03923 RTP1-201ENST00000312295 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
ZNF85Q03923 SCN3B-201ENST00000299333 5665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
ZNF85Q03923 B4GALNT3-201ENST00000266383 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
ZNF85Q03923 TRIM71-201ENST00000383763 8685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
ZNF85Q03923 OSBPL5-202ENST00000348039 2798 ntTSL 2 BASIC13.61□□□□□ -0.23
ZNF85Q03923 NEURL1-201ENST00000369780 4314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
ZNF85Q03923 NAP1L1-202ENST00000393263 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
ZNF85Q03923 CPEB3-201ENST00000265997 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
ZNF85Q03923 TNFAIP8L3-201ENST00000327536 2262 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
ZNF85Q03923 NME7-201ENST00000367811 1642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
ZNF85Q03923 TMEM147-AS1-203ENST00000589137 1627 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
ZNF85Q03923 PRKD2-202ENST00000433867 3321 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
ZNF85Q03923 PIANP-202ENST00000534837 2695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
ZNF85Q03923 AL035456.1-201ENST00000456064 1369 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
ZNF85Q03923 IRF9-203ENST00000557894 1391 ntTSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
ZNF85Q03923 CHST5-201ENST00000336257 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
ZNF85Q03923 DMTN-201ENST00000265800 2554 ntTSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
ZNF85Q03923 DMTN-207ENST00000517305 2551 ntTSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
ZNF85Q03923 SOGA3-201ENST00000465909 3756 ntTSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
ZNF85Q03923 ACRBP-201ENST00000229243 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
ZNF85Q03923 ELL2P1-201ENST00000413990 1906 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
ZNF85Q03923 MAPT-206ENST00000415613 2331 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
ZNF85Q03923 BTN1A1-201ENST00000244513 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
ZNF85Q03923 TP73-209ENST00000603362 1668 ntTSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
ZNF85Q03923 WIZ-207ENST00000599910 4609 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
ZNF85Q03923 NAGK-201ENST00000244204 1154 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
ZNF85Q03923 FIGLA-201ENST00000332372 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
ZNF85Q03923 ASB12-201ENST00000362002 1289 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.61□□□□□ -0.23
ZNF85Q03923 LRCOL1-201ENST00000376608 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
ZNF85Q03923 ATP5G3-202ENST00000392541 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
ZNF85Q03923 PMP22-202ENST00000395936 816 ntTSL 3 BASIC13.61□□□□□ -0.23
ZNF85Q03923 MIR940-201ENST00000401276 94 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
ZNF85Q03923 RBPMS2P1-201ENST00000437762 623 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
ZNF85Q03923 HYPK-202ENST00000442995 1051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
ZNF85Q03923 PGAM5P1-201ENST00000518923 814 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
ZNF85Q03923 SNHG15-206ENST00000580528 1073 ntTSL 2 BASIC13.61□□□□□ -0.23
ZNF85Q03923 PRR29-209ENST00000582540 967 ntTSL 2 BASIC13.61□□□□□ -0.23
ZNF85Q03923 MRPL34-202ENST00000594999 555 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.61□□□□□ -0.23
ZNF85Q03923 NNAT-201ENST00000062104 1297 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 69.2 ms