Protein–RNA interactions for Protein: Q03468

ERCC6, DNA excision repair protein ERCC-6, humanhuman

Predictions only

Length 1,493 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERCC6Q03468 RN7SL277P-201ENST00000481521 288 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
ERCC6Q03468 TGFBI-207ENST00000508076 1034 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
ERCC6Q03468 AC015795.2-201ENST00000512720 575 ntTSL 3 BASIC25.25■■□□□ 1.63
ERCC6Q03468 AC093510.1-202ENST00000546238 442 ntTSL 3 BASIC25.25■■□□□ 1.63
ERCC6Q03468 FOXN3-AS2-201ENST00000554071 1262 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
ERCC6Q03468 EAF1-AS1-208ENST00000608408 770 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
ERCC6Q03468 LINC01588-216ENST00000623502 975 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
ERCC6Q03468 CCDC51-201ENST00000395694 1560 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
ERCC6Q03468 LDB3-208ENST00000623007 1664 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
ERCC6Q03468 AC006063.2-201ENST00000640161 1696 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
ERCC6Q03468 EIF4A1-201ENST00000293831 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
ERCC6Q03468 MARK1-202ENST00000366918 5169 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
ERCC6Q03468 TKT-202ENST00000423516 2075 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
ERCC6Q03468 LINC00339-208ENST00000634934 1518 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
ERCC6Q03468 PIF1-201ENST00000268043 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
ERCC6Q03468 SPO11-203ENST00000371263 1834 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
ERCC6Q03468 ZBED1P1-201ENST00000502364 1930 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
ERCC6Q03468 PES1-204ENST00000402284 2144 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
ERCC6Q03468 WBP2-215ENST00000591399 2225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
ERCC6Q03468 TRIM11-202ENST00000366699 2511 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
ERCC6Q03468 RNVU1-8-201ENST00000364272 125 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
ERCC6Q03468 SNX3-204ENST00000426155 1072 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
ERCC6Q03468 AC103923.1-201ENST00000453229 1228 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
ERCC6Q03468 RPL18-205ENST00000549273 1036 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
ERCC6Q03468 AC003686.1-201ENST00000550956 1034 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
ERCC6Q03468 MT1G-203ENST00000568675 628 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
ERCC6Q03468 LINC00969-294ENST00000627609 992 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
ERCC6Q03468 PRKAG1-217ENST00000552212 1497 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
ERCC6Q03468 UBXN11-202ENST00000357089 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
ERCC6Q03468 PPM1F-202ENST00000397495 1778 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
ERCC6Q03468 PRPF39-201ENST00000355765 2868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
ERCC6Q03468 COQ8A-201ENST00000366777 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
ERCC6Q03468 CCDC3-201ENST00000378825 2731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
ERCC6Q03468 YARS2-201ENST00000324868 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
ERCC6Q03468 SIGLEC10-205ENST00000439889 2126 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
ERCC6Q03468 OSGEP-201ENST00000206542 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
ERCC6Q03468 MYO9A-214ENST00000566885 5111 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
ERCC6Q03468 RNF146-203ENST00000368314 2369 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
ERCC6Q03468 ELP5-202ENST00000356683 2197 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
ERCC6Q03468 NNMT-203ENST00000535401 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
ERCC6Q03468 KCNN3-202ENST00000358505 1658 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
ERCC6Q03468 CCDC88B-202ENST00000356786 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
ERCC6Q03468 AC008536.3-201ENST00000623282 1599 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
ERCC6Q03468 WASH3P-207ENST00000560956 1394 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
ERCC6Q03468 CPNE6-201ENST00000397016 2235 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
ERCC6Q03468 CPNE6-203ENST00000537691 2233 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
ERCC6Q03468 ASAH1-254ENST00000637636 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
ERCC6Q03468 ALDH4A1-201ENST00000290597 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
ERCC6Q03468 MRPL33-201ENST00000296102 518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
ERCC6Q03468 MRPL33-202ENST00000379666 404 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
ERCC6Q03468 BX248123.1-201ENST00000429070 606 ntTSL 3 BASIC25.23■■□□□ 1.63
ERCC6Q03468 RPS23-207ENST00000511844 530 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
ERCC6Q03468 AP003351.1-201ENST00000522743 668 ntTSL 3 BASIC25.23■■□□□ 1.63
ERCC6Q03468 LINC01082-201ENST00000601250 441 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
ERCC6Q03468 BANP-227ENST00000626016 2144 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
ERCC6Q03468 SH2B3-202ENST00000538307 2062 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
ERCC6Q03468 ERP29-203ENST00000546477 1698 ntTSL 3 BASIC25.23■■□□□ 1.63
ERCC6Q03468 ARHGAP22-205ENST00000417912 2352 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
ERCC6Q03468 LHCGR-202ENST00000401907 1477 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
ERCC6Q03468 AL157823.1-201ENST00000403727 628 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
ERCC6Q03468 AC018814.1-201ENST00000418972 357 ntTSL 3 BASIC25.22■■□□□ 1.63
ERCC6Q03468 CDCA4P4-201ENST00000435216 680 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
ERCC6Q03468 PGAP2-207ENST00000463452 931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
ERCC6Q03468 IGHV1-12-201ENST00000518307 205 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
ERCC6Q03468 AP001043.1-206ENST00000613045 730 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
ERCC6Q03468 MPP1-205ENST00000413259 2195 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
ERCC6Q03468 LDB3-204ENST00000372066 1598 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
ERCC6Q03468 POLR3E-202ENST00000359210 2469 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
ERCC6Q03468 LSM12-204ENST00000591247 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
ERCC6Q03468 ZNF131-206ENST00000505606 3209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
ERCC6Q03468 MAP7D1-201ENST00000316156 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
ERCC6Q03468 NECTIN1-203ENST00000341398 1377 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
ERCC6Q03468 ZNF165-201ENST00000377325 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
ERCC6Q03468 OSBPL1A-203ENST00000399441 1887 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
ERCC6Q03468 PAX1-205ENST00000613128 5352 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
ERCC6Q03468 ZSCAN18-201ENST00000240727 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
ERCC6Q03468 WT1-205ENST00000452863 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
ERCC6Q03468 PRR23A-201ENST00000383163 801 ntAPPRIS P1 BASIC25.21■■□□□ 1.63
ERCC6Q03468 ACTG2-204ENST00000409918 927 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
ERCC6Q03468 PTPA-215ENST00000432124 567 ntTSL 4 BASIC25.21■■□□□ 1.63
ERCC6Q03468 AL121987.1-201ENST00000435580 645 ntTSL 3 BASIC25.21■■□□□ 1.63
ERCC6Q03468 AC098934.1-203ENST00000442868 1262 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
ERCC6Q03468 RN7SL147P-201ENST00000487345 298 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
ERCC6Q03468 DIO3OS-211ENST00000557532 712 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
ERCC6Q03468 LINC02252-201ENST00000565706 487 ntTSL 3 BASIC25.21■■□□□ 1.63
ERCC6Q03468 AC008906.2-201ENST00000606656 474 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
ERCC6Q03468 ABHD3-201ENST00000289119 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
ERCC6Q03468 GPR61-206ENST00000616874 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
ERCC6Q03468 GALNT10-203ENST00000425427 4344 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
ERCC6Q03468 TTC8-216ENST00000614125 2377 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
ERCC6Q03468 UQCC2-204ENST00000607484 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
ERCC6Q03468 TRMT10B-207ENST00000537911 2108 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
ERCC6Q03468 AC020922.1-201ENST00000591954 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
ERCC6Q03468 RANBP1-208ENST00000430524 1389 ntTSL 3 BASIC25.21■■□□□ 1.63
ERCC6Q03468 VIPR1-201ENST00000325123 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
ERCC6Q03468 RPS9-202ENST00000391751 510 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
ERCC6Q03468 AC104961.1-201ENST00000427605 771 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
ERCC6Q03468 RPL15-208ENST00000435882 1063 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
ERCC6Q03468 C11orf58-207ENST00000525684 575 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
ERCC6Q03468 C11orf58-209ENST00000528634 776 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.1 ms