Protein–RNA interactions for Protein: Q01954

BNC1, Zinc finger protein basonuclin-1, humanhuman

Predictions only

Length 994 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BNC1Q01954 LINC01694-201ENST00000424569 821 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
BNC1Q01954 CALR4P-201ENST00000431943 946 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
BNC1Q01954 AP000350.4-201ENST00000433835 788 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
BNC1Q01954 AL162742.1-201ENST00000434792 954 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
BNC1Q01954 AL160290.2-201ENST00000448347 831 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
BNC1Q01954 CENPM-208ENST00000472374 541 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
BNC1Q01954 OARD1-212ENST00000482515 832 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
BNC1Q01954 ZNF527-203ENST00000483919 1142 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
BNC1Q01954 HYAL3-206ENST00000513170 636 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
BNC1Q01954 AC006487.1-201ENST00000514506 1221 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
BNC1Q01954 COX14-203ENST00000550487 739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
BNC1Q01954 NFATC3-222ENST00000575270 3824 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
BNC1Q01954 THAP4-206ENST00000612200 969 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
BNC1Q01954 FP565260.5-201ENST00000623188 479 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
BNC1Q01954 AC132938.4-201ENST00000623835 848 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
BNC1Q01954 PPA1-206ENST00000625364 644 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
BNC1Q01954 LINC02228-204ENST00000642115 2962 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
BNC1Q01954 HSPA1B-201ENST00000375650 2521 ntAPPRIS P1 BASIC15.27■□□□□ 0.03
BNC1Q01954 AL138799.1-201ENST00000448213 1675 ntBASIC15.27■□□□□ 0.03
BNC1Q01954 MUTYH-211ENST00000456914 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
BNC1Q01954 CANT1-211ENST00000591773 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
BNC1Q01954 ZNF711-201ENST00000276123 2887 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
BNC1Q01954 CDH15-201ENST00000289746 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
BNC1Q01954 CMTM3-202ENST00000424011 2330 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
BNC1Q01954 MGME1-202ENST00000377709 1936 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
BNC1Q01954 PPAN-P2RY11-202ENST00000428358 2661 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
BNC1Q01954 TMTC2-203ENST00000548305 2682 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
BNC1Q01954 IQCC-202ENST00000537469 2252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
BNC1Q01954 ELOA-204ENST00000613537 4924 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
BNC1Q01954 EML1-201ENST00000262233 4535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
BNC1Q01954 TOR4A-201ENST00000357503 4148 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
BNC1Q01954 ATP6AP2-226ENST00000637526 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
BNC1Q01954 GUCA1A-203ENST00000394237 2233 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
BNC1Q01954 SERPINF2-203ENST00000450523 1462 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
BNC1Q01954 ADAM6-201ENST00000606026 1843 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
BNC1Q01954 CASR-202ENST00000498619 5009 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
BNC1Q01954 TIMM44-201ENST00000270538 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
BNC1Q01954 TVP23B-201ENST00000307767 2064 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
BNC1Q01954 MAP1LC3B-201ENST00000268607 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
BNC1Q01954 LINC00884-202ENST00000448892 2680 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
BNC1Q01954 HILPDA-201ENST00000257696 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
BNC1Q01954 OSBPL10-201ENST00000396556 6600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
BNC1Q01954 KRT8P35-201ENST00000483942 1338 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
BNC1Q01954 FGFR1OP2-201ENST00000229395 2924 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
BNC1Q01954 GABARAP-201ENST00000302386 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
BNC1Q01954 AC006449.6-201ENST00000612330 2296 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
BNC1Q01954 HSPH1-201ENST00000320027 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
BNC1Q01954 UIMC1-201ENST00000377227 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
BNC1Q01954 EVA1A-203ENST00000410010 696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
BNC1Q01954 BTBD6P1-201ENST00000412176 1267 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
BNC1Q01954 AC128709.1-201ENST00000445908 600 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
BNC1Q01954 LAMA5-AS1-203ENST00000478167 690 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
BNC1Q01954 FHIT-208ENST00000492590 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
BNC1Q01954 AC093904.2-201ENST00000495580 418 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
BNC1Q01954 PARP8-218ENST00000513738 596 ntTSL 4 BASIC15.26■□□□□ 0.03
BNC1Q01954 RNA5SP423-201ENST00000517127 109 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
BNC1Q01954 GTF2H2-204ENST00000517900 659 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
BNC1Q01954 AC009133.1-202ENST00000563806 494 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
BNC1Q01954 AP005329.1-201ENST00000578800 1035 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
BNC1Q01954 MIR4313-201ENST00000580760 101 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
BNC1Q01954 YIF1B-215ENST00000592246 936 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
BNC1Q01954 AC011510.1-201ENST00000598541 286 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
BNC1Q01954 RPS5-209ENST00000601521 1203 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
BNC1Q01954 LINC01233-203ENST00000601708 494 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
BNC1Q01954 MPP1-205ENST00000413259 2195 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
BNC1Q01954 CHL1-202ENST00000397491 5235 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
BNC1Q01954 PCDH17-201ENST00000377918 8232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
BNC1Q01954 ELF2-201ENST00000358635 3036 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
BNC1Q01954 HPN-201ENST00000262626 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
BNC1Q01954 SLC43A1-204ENST00000528450 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
BNC1Q01954 AC067930.6-201ENST00000623257 4947 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
BNC1Q01954 AL365199.1-201ENST00000421320 1714 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
BNC1Q01954 SALL3-201ENST00000536229 3997 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
BNC1Q01954 FAM153B-220ENST00000515817 1966 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
BNC1Q01954 NCK1-201ENST00000288986 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
BNC1Q01954 SEC13-201ENST00000337354 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
BNC1Q01954 OPA1-208ENST00000392438 6340 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
BNC1Q01954 CRY1-201ENST00000008527 3267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
BNC1Q01954 ELOF1-203ENST00000586683 2154 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
BNC1Q01954 CHN1-205ENST00000409900 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
BNC1Q01954 TOM1L1-201ENST00000348161 1895 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
BNC1Q01954 CELF4-202ENST00000361795 1853 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
BNC1Q01954 TAF1B-201ENST00000263663 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
BNC1Q01954 SEPT11-203ENST00000502584 2615 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
BNC1Q01954 PPP1R21-201ENST00000281394 3137 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
BNC1Q01954 AL365209.1-201ENST00000624418 6473 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
BNC1Q01954 ASCC3-207ENST00000522650 2828 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
BNC1Q01954 RPS3-201ENST00000278572 907 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
BNC1Q01954 UBXN1-202ENST00000301935 1153 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
BNC1Q01954 CSH1-201ENST00000316193 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
BNC1Q01954 BLCAP-204ENST00000397135 685 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.25■□□□□ 0.03
BNC1Q01954 AL445430.1-201ENST00000419796 699 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
BNC1Q01954 HLA-DPB2-205ENST00000435074 1188 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
BNC1Q01954 IGHJ2P-201ENST00000454480 60 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
BNC1Q01954 MLF1-206ENST00000471745 1266 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
BNC1Q01954 RPSAP36-202ENST00000494591 1261 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
BNC1Q01954 KRT18P25-201ENST00000508931 1278 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
BNC1Q01954 SLC45A2-204ENST00000509381 1040 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
BNC1Q01954 IL32-222ENST00000533097 814 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
BNC1Q01954 C1RL-212ENST00000545337 813 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.2 ms