Protein–RNA interactions for Protein: Q01860

POU5F1, POU domain, class 5, transcription factor 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 360 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POU5F1Q01860 RER1-203ENST00000378513 3000 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
POU5F1Q01860 CPT2-201ENST00000371486 3094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
POU5F1Q01860 NEO1-201ENST00000261908 7088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
POU5F1Q01860 BCS1L-205ENST00000412366 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
POU5F1Q01860 GPER1-201ENST00000297469 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
POU5F1Q01860 LRRC3-201ENST00000291592 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
POU5F1Q01860 OIT3-202ENST00000622652 1602 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
POU5F1Q01860 SLC26A10-201ENST00000320442 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
POU5F1Q01860 MEGF10-206ENST00000508365 2365 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
POU5F1Q01860 TBP-206ENST00000540980 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
POU5F1Q01860 RECQL4-209ENST00000617875 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
POU5F1Q01860 MUC1-228ENST00000620103 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
POU5F1Q01860 KREMEN1-201ENST00000327813 2719 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
POU5F1Q01860 ST14-201ENST00000278742 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
POU5F1Q01860 FAM83G-202ENST00000388995 5266 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
POU5F1Q01860 AHNAK-201ENST00000257247 1024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
POU5F1Q01860 KIAA1191-201ENST00000298569 2991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
POU5F1Q01860 AP000317.2-201ENST00000362077 641 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
POU5F1Q01860 LENEP-202ENST00000392487 555 ntAPPRIS P1 BASIC16.59■□□□□ 0.25
POU5F1Q01860 CRYAA-202ENST00000398132 826 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
POU5F1Q01860 AC018467.1-201ENST00000421581 717 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
POU5F1Q01860 KRT43P-201ENST00000434019 910 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
POU5F1Q01860 AL355864.2-201ENST00000447420 863 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
POU5F1Q01860 AP000552.1-208ENST00000452952 576 ntTSL 4 BASIC16.59■□□□□ 0.25
POU5F1Q01860 AC004522.2-201ENST00000456499 680 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
POU5F1Q01860 C19orf24-202ENST00000469144 668 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
POU5F1Q01860 LSM1-203ENST00000520755 975 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
POU5F1Q01860 AC068228.2-201ENST00000522383 777 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
POU5F1Q01860 GCHFR-206ENST00000561160 572 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
POU5F1Q01860 APRT-204ENST00000563655 709 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
POU5F1Q01860 DUX4L47-201ENST00000566374 394 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
POU5F1Q01860 AC016727.1-204ENST00000578974 420 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
POU5F1Q01860 FLT3LG-205ENST00000596435 1034 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
POU5F1Q01860 NEK5-204ENST00000617045 2127 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
POU5F1Q01860 AC132938.4-201ENST00000623835 848 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
POU5F1Q01860 FP236240.1-204ENST00000624932 712 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
POU5F1Q01860 PFAS-212ENST00000625942 396 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
POU5F1Q01860 SLC25A36-201ENST00000324194 1301 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
POU5F1Q01860 ARNTL2-208ENST00000544915 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
POU5F1Q01860 ADAMTS18-201ENST00000282849 5913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
POU5F1Q01860 FBLN7-203ENST00000409450 1394 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
POU5F1Q01860 TBCEL-205ENST00000529397 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
POU5F1Q01860 PNMA3-202ENST00000593810 1432 ntAPPRIS P1 BASIC16.59■□□□□ 0.25
POU5F1Q01860 PCK2-203ENST00000545054 2505 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
POU5F1Q01860 SPG21-203ENST00000433215 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
POU5F1Q01860 GEMIN7-201ENST00000270257 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
POU5F1Q01860 ABCC9-203ENST00000326684 1693 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
POU5F1Q01860 MAGEA2B-202ENST00000370293 1714 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
POU5F1Q01860 GHRLOS-201ENST00000439539 1708 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
POU5F1Q01860 MZF1-201ENST00000215057 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
POU5F1Q01860 PAK4-205ENST00000593690 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
POU5F1Q01860 MAEL-201ENST00000367870 1831 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
POU5F1Q01860 AC007292.2-201ENST00000593524 1812 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
POU5F1Q01860 FAM118B-210ENST00000627851 1862 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
POU5F1Q01860 AC093525.2-201ENST00000564543 1944 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.25
POU5F1Q01860 LYNX1-206ENST00000621401 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
POU5F1Q01860 AFAP1L2-202ENST00000369271 3964 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
POU5F1Q01860 EPS8-201ENST00000281172 4061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
POU5F1Q01860 SYT6-205ENST00000609117 4424 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
POU5F1Q01860 KANK2-207ENST00000589894 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
POU5F1Q01860 EP400-203ENST00000333577 3092 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
POU5F1Q01860 CACNA1A-202ENST00000573710 7569 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
POU5F1Q01860 HID1-202ENST00000425042 3271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
POU5F1Q01860 POM121-203ENST00000434423 3750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
POU5F1Q01860 TMEM14B-212ENST00000475942 992 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
POU5F1Q01860 BX927359.1-201ENST00000556073 543 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
POU5F1Q01860 AC009133.2-201ENST00000566537 547 ntTSL 4 BASIC16.58■□□□□ 0.24
POU5F1Q01860 RAMP2-202ENST00000587142 549 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
POU5F1Q01860 RAMP2-203ENST00000588576 573 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
POU5F1Q01860 EGLN2-209ENST00000594140 991 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
POU5F1Q01860 SPIN2A-203ENST00000614076 966 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
POU5F1Q01860 KRT8P35-201ENST00000483942 1338 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
POU5F1Q01860 SLC25A2-201ENST00000239451 1417 ntAPPRIS P1 BASIC16.58■□□□□ 0.24
POU5F1Q01860 TCF7-218ENST00000520958 1408 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
POU5F1Q01860 ZFYVE28-210ENST00000515169 1590 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
POU5F1Q01860 PPM1D-201ENST00000305921 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
POU5F1Q01860 PAAF1-207ENST00000536003 1639 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
POU5F1Q01860 TCP11-206ENST00000412155 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
POU5F1Q01860 OGDH-204ENST00000443864 1744 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
POU5F1Q01860 AC148477.4-201ENST00000613430 1793 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
POU5F1Q01860 GLMP-214ENST00000614643 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
POU5F1Q01860 ACTL6A-202ENST00000429709 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
POU5F1Q01860 CEP63-212ENST00000513612 2903 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
POU5F1Q01860 STAT5A-201ENST00000345506 4301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
POU5F1Q01860 N4BP1-201ENST00000262384 7106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
POU5F1Q01860 TSC2-222ENST00000568454 5434 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
POU5F1Q01860 SYT1-201ENST00000261205 4808 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
POU5F1Q01860 SESN1-202ENST00000356644 2676 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
POU5F1Q01860 FECH-202ENST00000382873 2526 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
POU5F1Q01860 NEDD1-213ENST00000557644 2367 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
POU5F1Q01860 RBM46-204ENST00000514866 2315 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
POU5F1Q01860 AGT-201ENST00000366667 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
POU5F1Q01860 AC013726.1-201ENST00000563747 2285 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
POU5F1Q01860 CLEC18A-201ENST00000288040 2155 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
POU5F1Q01860 TSC2-201ENST00000219476 6156 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
POU5F1Q01860 ACRBP-201ENST00000229243 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
POU5F1Q01860 CFAP53-201ENST00000398545 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
POU5F1Q01860 GPI-205ENST00000586425 1799 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
POU5F1Q01860 KNSTRN-201ENST00000249776 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
POU5F1Q01860 TBX10-201ENST00000335385 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.4 ms