Protein–RNA interactions for Protein: Q01524

DEFA6, Defensin-6, humanhuman

Predictions only

Length 100 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DEFA6Q01524 LINC02012-201ENST00000608206 1725 ntBASIC12.79□□□□□ -0.36
DEFA6Q01524 PTK7-210ENST00000471863 2412 ntTSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
DEFA6Q01524 RMDN3-201ENST00000260385 3138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
DEFA6Q01524 PARP10-201ENST00000313028 3497 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
DEFA6Q01524 WT1-203ENST00000379079 2466 ntTSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
DEFA6Q01524 TMEM145-201ENST00000301204 1768 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC12.79□□□□□ -0.36
DEFA6Q01524 POLR2J4-203ENST00000326391 1422 ntTSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
DEFA6Q01524 GAB2-202ENST00000361507 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
DEFA6Q01524 STAM2-201ENST00000263904 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
DEFA6Q01524 PRKN-204ENST00000366896 2514 ntTSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
DEFA6Q01524 ERVK13-1-207ENST00000569465 3321 ntTSL 2 BASIC12.78□□□□□ -0.36
DEFA6Q01524 HMGA2-204ENST00000403681 4473 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
DEFA6Q01524 LINC01101-201ENST00000622953 1884 ntBASIC12.78□□□□□ -0.36
DEFA6Q01524 SEPT8-204ENST00000378699 2289 ntTSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
DEFA6Q01524 PCDHB5-201ENST00000231134 3408 ntAPPRIS P1 BASIC12.78□□□□□ -0.36
DEFA6Q01524 WDR45-234ENST00000634838 1545 ntTSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
DEFA6Q01524 WBP2-201ENST00000254806 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
DEFA6Q01524 MAPK14-202ENST00000229795 4319 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
DEFA6Q01524 MRM2-203ENST00000440306 1570 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
DEFA6Q01524 COL6A3-206ENST00000409809 8916 ntTSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
DEFA6Q01524 MEG3-213ENST00000455531 4867 ntTSL 2 BASIC12.78□□□□□ -0.36
DEFA6Q01524 HOXA-AS3-205ENST00000524304 2063 ntTSL 2 BASIC12.78□□□□□ -0.36
DEFA6Q01524 GAP43-201ENST00000305124 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
DEFA6Q01524 HYAL3-207ENST00000621157 1696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
DEFA6Q01524 AC132938.6-201ENST00000623828 1655 ntBASIC12.78□□□□□ -0.36
DEFA6Q01524 LAT2-205ENST00000460943 2527 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
DEFA6Q01524 NDUFA2-201ENST00000252102 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
DEFA6Q01524 TRMT112-201ENST00000308774 561 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC12.78□□□□□ -0.36
DEFA6Q01524 MB-201ENST00000359787 1170 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.78□□□□□ -0.36
DEFA6Q01524 GSTO1-201ENST00000369710 900 ntTSL 2 BASIC12.78□□□□□ -0.36
DEFA6Q01524 WDR38-201ENST00000373574 1252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
DEFA6Q01524 SDHB-201ENST00000375499 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
DEFA6Q01524 TFPT-203ENST00000391759 1205 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
DEFA6Q01524 MB-202ENST00000397326 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
DEFA6Q01524 MB-203ENST00000397328 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
DEFA6Q01524 DGCR5-201ENST00000399539 862 ntBASIC12.78□□□□□ -0.36
DEFA6Q01524 HCG4-201ENST00000418983 998 ntBASIC12.78□□□□□ -0.36
DEFA6Q01524 COMT-209ENST00000449653 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
DEFA6Q01524 AL359815.1-201ENST00000457706 821 ntTSL 2 BASIC12.78□□□□□ -0.36
DEFA6Q01524 NUTM2A-AS1-212ENST00000458739 733 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
DEFA6Q01524 FAM162A-202ENST00000469967 1015 ntTSL 2 BASIC12.78□□□□□ -0.36
DEFA6Q01524 AP002748.3-201ENST00000527092 828 ntTSL 3 BASIC12.78□□□□□ -0.36
DEFA6Q01524 PPHLN1-221ENST00000552761 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
DEFA6Q01524 MRPL52-208ENST00000553711 586 ntTSL 3 BASIC12.78□□□□□ -0.36
DEFA6Q01524 AC009093.8-202ENST00000562902 677 ntTSL 2 BASIC12.78□□□□□ -0.36
DEFA6Q01524 LINC01225-203ENST00000563550 1244 ntBASIC12.78□□□□□ -0.36
DEFA6Q01524 AC106886.1-201ENST00000568660 600 ntBASIC12.78□□□□□ -0.36
DEFA6Q01524 AC129507.3-201ENST00000571512 913 ntTSL 2 BASIC12.78□□□□□ -0.36
DEFA6Q01524 CD7-202ENST00000578509 925 ntTSL 3 BASIC12.78□□□□□ -0.36
DEFA6Q01524 MIR4538-201ENST00000581377 78 ntBASIC12.78□□□□□ -0.36
DEFA6Q01524 AC243964.2-202ENST00000591312 752 ntTSL 2 BASIC12.78□□□□□ -0.36
DEFA6Q01524 FOSB-211ENST00000592436 1057 ntTSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
DEFA6Q01524 BARD1-209ENST00000613192 703 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
DEFA6Q01524 MIR6787-201ENST00000616675 61 ntBASIC12.78□□□□□ -0.36
DEFA6Q01524 AC244517.11-204ENST00000624424 760 ntTSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
DEFA6Q01524 PFAS-212ENST00000625942 396 ntTSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
DEFA6Q01524 AL391650.2-201ENST00000640097 941 ntTSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
DEFA6Q01524 TRMT1-217ENST00000592062 2579 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
DEFA6Q01524 PRKRIP1-201ENST00000397912 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
DEFA6Q01524 LAMB2-202ENST00000418109 5674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
DEFA6Q01524 SFXN3-201ENST00000224807 3089 ntTSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
DEFA6Q01524 ITPR2-202ENST00000381340 11405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
DEFA6Q01524 MBOAT1-201ENST00000324607 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
DEFA6Q01524 HARS-204ENST00000438307 1789 ntTSL 2 BASIC12.78□□□□□ -0.36
DEFA6Q01524 TNS2-202ENST00000314276 4944 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
DEFA6Q01524 ZNF536-201ENST00000355537 4945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
DEFA6Q01524 C17orf107-201ENST00000381365 3199 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC12.78□□□□□ -0.36
DEFA6Q01524 HGNC:18790-202ENST00000421177 4172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
DEFA6Q01524 EDEM3-202ENST00000367512 6678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
DEFA6Q01524 CGB7-202ENST00000596965 1949 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.78□□□□□ -0.36
DEFA6Q01524 SRGAP2C-201ENST00000304465 1477 ntTSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
DEFA6Q01524 SRGAP2-201ENST00000419187 1477 ntTSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
DEFA6Q01524 SRGAP2B-205ENST00000619678 1477 ntTSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
DEFA6Q01524 FAM149A-202ENST00000356371 2997 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
DEFA6Q01524 MANBA-202ENST00000505239 2577 ntTSL 2 BASIC12.77□□□□□ -0.36
DEFA6Q01524 ROPN1-206ENST00000479867 2056 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
DEFA6Q01524 NRDC-201ENST00000352171 3691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
DEFA6Q01524 SLC43A3-203ENST00000395124 2617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
DEFA6Q01524 STYXL1-208ENST00000451157 1570 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
DEFA6Q01524 GAK-214ENST00000511163 4280 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
DEFA6Q01524 MPP3-201ENST00000398389 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
DEFA6Q01524 LRRC14-205ENST00000529022 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
DEFA6Q01524 ATG5-210ENST00000636437 2261 ntTSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.36
DEFA6Q01524 LRRC42-201ENST00000319223 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
DEFA6Q01524 MEFV-201ENST00000219596 3499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
DEFA6Q01524 GDPD5-201ENST00000336898 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
DEFA6Q01524 TBX3-202ENST00000349155 4723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
DEFA6Q01524 SCHIP1-205ENST00000482804 1799 ntTSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.36
DEFA6Q01524 APLNR-203ENST00000611099 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
DEFA6Q01524 SELENON-203ENST00000374315 4212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.36
DEFA6Q01524 MUL1-201ENST00000264198 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
DEFA6Q01524 C11orf80-201ENST00000360962 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.37
DEFA6Q01524 FLAD1-205ENST00000368431 1803 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
DEFA6Q01524 C11orf71-201ENST00000325636 652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
DEFA6Q01524 CAPG-205ENST00000409921 1195 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
DEFA6Q01524 RNF212-203ENST00000433731 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
DEFA6Q01524 SPSB2-204ENST00000523102 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
DEFA6Q01524 SPSB2-205ENST00000524270 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
DEFA6Q01524 API5-211ENST00000534695 560 ntTSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.37
DEFA6Q01524 DPF3-210ENST00000556509 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.8 ms