Protein–RNA interactions for Protein: Q01118

SCN7A, Sodium channel protein type 7 subunit alpha, humanhuman

Predictions only

Length 1,682 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCN7AQ01118 FRMD5-209ENST00000484674 2319 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.57
SCN7AQ01118 ZNF331-217ENST00000512387 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
SCN7AQ01118 CDK11B-204ENST00000407249 2677 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
SCN7AQ01118 BX005266.2-201ENST00000450704 1549 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
SCN7AQ01118 LAT2-204ENST00000398475 2453 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
SCN7AQ01118 CERS3-202ENST00000394113 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
SCN7AQ01118 MBP-201ENST00000354542 575 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.57
SCN7AQ01118 PSMB10-201ENST00000358514 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
SCN7AQ01118 APOA1-202ENST00000359492 932 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.57
SCN7AQ01118 CRIP1-202ENST00000392531 485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.57
SCN7AQ01118 HSPB7-203ENST00000406363 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
SCN7AQ01118 LINC00466-203ENST00000436475 1059 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
SCN7AQ01118 AC114501.1-201ENST00000445949 172 ntBASIC18.58■□□□□ 0.57
SCN7AQ01118 MYL7-209ENST00000458240 791 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
SCN7AQ01118 MYLK-AS1-202ENST00000470449 760 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
SCN7AQ01118 AP002803.1-201ENST00000528836 498 ntBASIC18.58■□□□□ 0.57
SCN7AQ01118 EIF3K-202ENST00000538434 966 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.57
SCN7AQ01118 PLIN5-202ENST00000586133 907 ntTSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.57
SCN7AQ01118 CR589904.1-202ENST00000611154 660 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
SCN7AQ01118 FOS-201ENST00000303562 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
SCN7AQ01118 WAC-202ENST00000347934 2839 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
SCN7AQ01118 CD19-201ENST00000324662 1932 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
SCN7AQ01118 CYP2U1-202ENST00000508453 3125 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
SCN7AQ01118 AFDN-202ENST00000351017 5823 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
SCN7AQ01118 MSTO1-202ENST00000368341 2245 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
SCN7AQ01118 VAC14-201ENST00000261776 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
SCN7AQ01118 RAB3IP-204ENST00000378815 2386 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
SCN7AQ01118 SGCE-205ENST00000437425 1508 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
SCN7AQ01118 RNPS1-220ENST00000566458 2037 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
SCN7AQ01118 MAEA-207ENST00000505177 1340 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
SCN7AQ01118 MAPKAP1-202ENST00000350766 3256 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
SCN7AQ01118 GPANK1-203ENST00000375896 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
SCN7AQ01118 CRB3-201ENST00000308243 631 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
SCN7AQ01118 TNNT2-202ENST00000360372 969 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
SCN7AQ01118 TNNT2-204ENST00000367317 1050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
SCN7AQ01118 TNNT2-209ENST00000421663 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
SCN7AQ01118 AL137856.1-201ENST00000429398 773 ntTSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
SCN7AQ01118 SAP30L-203ENST00000440364 792 ntTSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
SCN7AQ01118 DUTP3-201ENST00000450025 415 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
SCN7AQ01118 AC006455.8-201ENST00000451381 351 ntTSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
SCN7AQ01118 FTH1P22-201ENST00000456305 520 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
SCN7AQ01118 SNHG14-209ENST00000456576 544 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
SCN7AQ01118 AC011773.1-201ENST00000520129 468 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
SCN7AQ01118 MSRB3-206ENST00000535664 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
SCN7AQ01118 TMEM231-206ENST00000565067 1078 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
SCN7AQ01118 AC024361.2-201ENST00000574471 898 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
SCN7AQ01118 LDLRAD4-208ENST00000586765 844 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
SCN7AQ01118 KRTAP10-4-203ENST00000622352 1244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
SCN7AQ01118 THUMPD3-210ENST00000515662 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
SCN7AQ01118 ADAMTS8-201ENST00000257359 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
SCN7AQ01118 AC126365.1-201ENST00000578585 1514 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
SCN7AQ01118 SPO11-203ENST00000371263 1834 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
SCN7AQ01118 STK26-204ENST00000481105 1835 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
SCN7AQ01118 THUMPD3-AS1-212ENST00000520447 1809 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
SCN7AQ01118 ABTB1-202ENST00000453791 1961 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
SCN7AQ01118 LMF2-202ENST00000474879 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
SCN7AQ01118 ACTL6A-203ENST00000450518 1750 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
SCN7AQ01118 B3GNTL1-211ENST00000576599 1787 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
SCN7AQ01118 AC020658.6-201ENST00000623564 1870 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
SCN7AQ01118 FAS-202ENST00000352159 1722 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
SCN7AQ01118 SLC9A6-201ENST00000370695 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
SCN7AQ01118 HDDC2-202ENST00000398153 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
SCN7AQ01118 RHBDD2-203ENST00000428119 1274 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
SCN7AQ01118 BX276092.5-201ENST00000439926 886 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
SCN7AQ01118 IL1R2-203ENST00000441002 1106 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
SCN7AQ01118 ZNF529-AS1-201ENST00000448373 1004 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
SCN7AQ01118 RN7SL81P-201ENST00000493781 261 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
SCN7AQ01118 AL031713.1-201ENST00000564813 661 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
SCN7AQ01118 MIR6756-201ENST00000616240 63 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
SCN7AQ01118 AC073911.3-201ENST00000624401 631 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
SCN7AQ01118 EGLN2-207ENST00000593726 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
SCN7AQ01118 MTURN-201ENST00000324453 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
SCN7AQ01118 FLAD1-205ENST00000368431 1803 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
SCN7AQ01118 CAMK2D-211ENST00000511664 2210 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
SCN7AQ01118 PLVAP-201ENST00000252590 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
SCN7AQ01118 RBM4B-206ENST00000531036 1646 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
SCN7AQ01118 FBXL22-202ENST00000534939 2443 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
SCN7AQ01118 SUPT4H1-201ENST00000225504 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
SCN7AQ01118 DVL1-202ENST00000378891 2926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
SCN7AQ01118 UPK3BL1-201ENST00000340457 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
SCN7AQ01118 OSER1-201ENST00000255174 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
SCN7AQ01118 STX3-201ENST00000337979 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
SCN7AQ01118 TCF25-201ENST00000263346 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
SCN7AQ01118 TP53BP2-201ENST00000343537 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
SCN7AQ01118 CCDC197-206ENST00000640978 1429 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
SCN7AQ01118 PLEKHG4-201ENST00000360461 6782 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
SCN7AQ01118 ARL6IP1-201ENST00000304414 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
SCN7AQ01118 KRTAP19-5-201ENST00000334151 461 ntAPPRIS P1 BASIC18.56■□□□□ 0.56
SCN7AQ01118 PPIE-202ENST00000356511 1079 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
SCN7AQ01118 CMTM5-203ENST00000359320 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
SCN7AQ01118 SMIM29-202ENST00000394990 792 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
SCN7AQ01118 AC068134.1-201ENST00000441266 481 ntTSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
SCN7AQ01118 KLHDC8A-203ENST00000460687 1022 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
SCN7AQ01118 PFN2-206ENST00000461930 606 ntTSL 4 BASIC18.56■□□□□ 0.56
SCN7AQ01118 LTBR-209ENST00000541102 1084 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
SCN7AQ01118 AC025154.2-201ENST00000550530 445 ntTSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
SCN7AQ01118 AC073573.1-201ENST00000550908 481 ntTSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
SCN7AQ01118 CRTC3-AS1-202ENST00000559531 657 ntTSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
SCN7AQ01118 NPLOC4-209ENST00000572760 946 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
SCN7AQ01118 PRMT5-AS1-206ENST00000599580 847 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.8 ms