Protein–RNA interactions for Protein: Q00587

CDC42EP1, Cdc42 effector protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 391 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDC42EP1Q00587 RASAL3-201ENST00000343625 3293 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CDC42EP1Q00587 ZNF750-202ENST00000572562 1513 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CDC42EP1Q00587 LYAR-201ENST00000343470 1569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CDC42EP1Q00587 MROH4P-201ENST00000431302 1578 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
CDC42EP1Q00587 CTSD-211ENST00000637387 1597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CDC42EP1Q00587 CD8A-201ENST00000283635 2873 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CDC42EP1Q00587 SLC16A3-211ENST00000581287 4830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CDC42EP1Q00587 MIEF1-202ENST00000402881 2269 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CDC42EP1Q00587 TTBK1-201ENST00000259750 6932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CDC42EP1Q00587 H1F0-201ENST00000340857 2344 ntAPPRIS P1 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CDC42EP1Q00587 SLC43A2-202ENST00000412517 1658 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CDC42EP1Q00587 AC131160.1-201ENST00000639401 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CDC42EP1Q00587 ARL6IP1-201ENST00000304414 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CDC42EP1Q00587 AC019205.2-202ENST00000441363 2403 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CDC42EP1Q00587 AXIN2-202ENST00000375702 2541 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CDC42EP1Q00587 ZBTB7C-201ENST00000535628 4818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CDC42EP1Q00587 FOLH1-202ENST00000340334 2697 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CDC42EP1Q00587 MUC20-201ENST00000320736 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CDC42EP1Q00587 APP-204ENST00000357903 3543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CDC42EP1Q00587 HNF1B-207ENST00000621123 1971 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CDC42EP1Q00587 AL157414.3-201ENST00000624276 1954 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
CDC42EP1Q00587 RPA3-201ENST00000223129 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CDC42EP1Q00587 COX6A2-201ENST00000287490 440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CDC42EP1Q00587 CSH1-201ENST00000316193 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CDC42EP1Q00587 HIST1H2AJ-201ENST00000333151 387 ntAPPRIS P1 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CDC42EP1Q00587 MIR663B-201ENST00000408361 115 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
CDC42EP1Q00587 PRKG1-AS1-201ENST00000420193 971 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CDC42EP1Q00587 AL450469.2-201ENST00000427132 499 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CDC42EP1Q00587 AL451065.1-201ENST00000428958 238 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CDC42EP1Q00587 LINC02158-201ENST00000432377 897 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CDC42EP1Q00587 CHMP1AP1-201ENST00000445563 662 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
CDC42EP1Q00587 AC082651.1-201ENST00000478468 832 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CDC42EP1Q00587 CHIA-209ENST00000483391 1188 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CDC42EP1Q00587 AC084859.1-201ENST00000533002 670 ntTSL 4 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CDC42EP1Q00587 AC104982.3-201ENST00000581995 514 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
CDC42EP1Q00587 AC073413.1-201ENST00000603927 732 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
CDC42EP1Q00587 SEMA4F-201ENST00000339773 2177 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CDC42EP1Q00587 ZNF398-205ENST00000491174 2232 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CDC42EP1Q00587 HYAL1-202ENST00000320295 2324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CDC42EP1Q00587 MRPS7-201ENST00000245539 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CDC42EP1Q00587 CANX-201ENST00000247461 4260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CDC42EP1Q00587 SNAP47-203ENST00000366760 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CDC42EP1Q00587 PDK2-201ENST00000007708 2384 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CDC42EP1Q00587 PLEKHG3-202ENST00000394691 4397 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CDC42EP1Q00587 MTHFD1L-211ENST00000611279 3475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CDC42EP1Q00587 ELFN1-202ENST00000561626 3742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CDC42EP1Q00587 ADCY1-204ENST00000621543 1647 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CDC42EP1Q00587 KCNG3-201ENST00000306078 3824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CDC42EP1Q00587 EGLN2-207ENST00000593726 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CDC42EP1Q00587 ZMYM3-203ENST00000373981 1841 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CDC42EP1Q00587 ZNF821-203ENST00000446827 1822 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CDC42EP1Q00587 TBL3-205ENST00000568546 6803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CDC42EP1Q00587 ZNF628-201ENST00000391718 3177 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CDC42EP1Q00587 PTPN20-206ENST00000395722 1995 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
CDC42EP1Q00587 TRIM9-202ENST00000338969 3312 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.25
CDC42EP1Q00587 KIF22-208ENST00000569382 2020 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
CDC42EP1Q00587 TCP10L2-202ENST00000366832 2185 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
CDC42EP1Q00587 MST1L-201ENST00000442552 2185 ntBASIC16.58■□□□□ 0.25
CDC42EP1Q00587 EFCAB14-201ENST00000371933 5767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
CDC42EP1Q00587 VPS37C-201ENST00000301765 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
CDC42EP1Q00587 SLC2A13-202ENST00000380858 3082 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CDC42EP1Q00587 TXNDC11-201ENST00000283033 3140 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CDC42EP1Q00587 TOMM40-207ENST00000592434 3415 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CDC42EP1Q00587 NAGK-201ENST00000244204 1154 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CDC42EP1Q00587 LSM10-201ENST00000315732 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CDC42EP1Q00587 AC007969.1-201ENST00000433675 447 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
CDC42EP1Q00587 IQCF3-203ENST00000444293 450 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CDC42EP1Q00587 AC008808.1-201ENST00000508923 432 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CDC42EP1Q00587 AC006487.1-201ENST00000514506 1221 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CDC42EP1Q00587 GNG2-209ENST00000555472 908 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CDC42EP1Q00587 NIP7-208ENST00000569637 1099 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CDC42EP1Q00587 AL118558.3-201ENST00000607414 1079 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
CDC42EP1Q00587 AC099795.1-202ENST00000640492 759 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CDC42EP1Q00587 SPIN2A-201ENST00000374906 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CDC42EP1Q00587 SUMO1-203ENST00000392246 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CDC42EP1Q00587 ZMYND10-202ENST00000360165 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CDC42EP1Q00587 TNXB-208ENST00000611016 6083 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CDC42EP1Q00587 DDOST-201ENST00000375048 2079 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CDC42EP1Q00587 PDGFA-203ENST00000402802 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CDC42EP1Q00587 SPATA20-202ENST00000356488 2634 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CDC42EP1Q00587 DIDO1-201ENST00000266070 8574 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CDC42EP1Q00587 GRIN2C-202ENST00000347612 2929 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CDC42EP1Q00587 VANGL2-201ENST00000368061 5340 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CDC42EP1Q00587 ADGRA1-AS1-201ENST00000366099 3236 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
CDC42EP1Q00587 FAM210B-201ENST00000371384 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CDC42EP1Q00587 KIFC3-206ENST00000541240 3047 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CDC42EP1Q00587 RASGRP2-206ENST00000377494 2983 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CDC42EP1Q00587 CACFD1-207ENST00000542192 2754 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CDC42EP1Q00587 MEG9-201ENST00000429368 2638 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CDC42EP1Q00587 FAM57B-202ENST00000380495 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CDC42EP1Q00587 ACSM2B-207ENST00000565232 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CDC42EP1Q00587 STAT6-225ENST00000640254 2037 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CDC42EP1Q00587 NAF1-201ENST00000274054 1907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CDC42EP1Q00587 CAMK2D-207ENST00000505990 1802 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CDC42EP1Q00587 PPM1F-202ENST00000397495 1778 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CDC42EP1Q00587 RREB1-204ENST00000379938 8778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CDC42EP1Q00587 CYB561D1-201ENST00000310611 5009 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CDC42EP1Q00587 MYCN-202ENST00000638417 1693 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CDC42EP1Q00587 ARFIP1-204ENST00000429148 1599 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CDC42EP1Q00587 PGA5-201ENST00000312403 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 63.1 ms