Protein–RNA interactions for Protein: Q00403

GTF2B, Transcription initiation factor IIB, humanhuman

Predictions only

Length 316 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF2BQ00403 SLCO5A1-203ENST00000524945 3725 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
GTF2BQ00403 MRI1-202ENST00000319545 3027 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
GTF2BQ00403 HOGA1-202ENST00000370646 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
GTF2BQ00403 GPI-205ENST00000586425 1799 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
GTF2BQ00403 AC055811.4-201ENST00000624039 1754 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
GTF2BQ00403 NHEG1-202ENST00000432330 1357 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
GTF2BQ00403 AC018665.1-201ENST00000622927 1362 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
GTF2BQ00403 SRSF5-203ENST00000553521 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
GTF2BQ00403 PDZD3-212ENST00000531114 2996 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
GTF2BQ00403 PRR19-201ENST00000341747 1530 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
GTF2BQ00403 HIC2-201ENST00000407464 6798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
GTF2BQ00403 ELMOD1-201ENST00000265840 2852 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
GTF2BQ00403 MALT1-202ENST00000348428 9368 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
GTF2BQ00403 ARID1A-205ENST00000457599 6268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
GTF2BQ00403 RAB22A-201ENST00000244040 8670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
GTF2BQ00403 GABRB3-215ENST00000622697 5876 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
GTF2BQ00403 GPD2-201ENST00000310454 6041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
GTF2BQ00403 RAB41-201ENST00000276066 1071 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
GTF2BQ00403 C1QB-201ENST00000314933 1044 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
GTF2BQ00403 UBE2G2-201ENST00000330942 721 ntTSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
GTF2BQ00403 RAB41-202ENST00000374473 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
GTF2BQ00403 AC007319.1-202ENST00000412276 829 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
GTF2BQ00403 SEPT8-212ENST00000458488 1726 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
GTF2BQ00403 NUTM2A-AS1-212ENST00000458739 733 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
GTF2BQ00403 SEPT7P9-202ENST00000489259 743 ntTSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
GTF2BQ00403 AC026434.2-201ENST00000506094 1078 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
GTF2BQ00403 C5orf66-202ENST00000507641 547 ntTSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
GTF2BQ00403 AC125603.2-201ENST00000546835 876 ntTSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
GTF2BQ00403 AHSA2-202ENST00000394457 6574 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
GTF2BQ00403 TBC1D3G-201ENST00000569055 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
GTF2BQ00403 TBC1D3H-201ENST00000610350 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
GTF2BQ00403 PI16-203ENST00000611814 2083 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
GTF2BQ00403 TBC1D3L-202ENST00000617678 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
GTF2BQ00403 KITLG-202ENST00000347404 1948 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
GTF2BQ00403 MBD1-217ENST00000588937 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
GTF2BQ00403 AC104758.3-201ENST00000563349 1453 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
GTF2BQ00403 CNOT8-204ENST00000517876 2708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
GTF2BQ00403 ZNF252P-AS1-201ENST00000527067 3236 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
GTF2BQ00403 CTSD-201ENST00000236671 2123 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
GTF2BQ00403 NEK5-204ENST00000617045 2127 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
GTF2BQ00403 CCDC140-201ENST00000295226 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
GTF2BQ00403 AL031282.2-201ENST00000598846 5079 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
GTF2BQ00403 VSIG10-202ENST00000359236 4946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
GTF2BQ00403 ARHGEF4-205ENST00000409359 5489 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
GTF2BQ00403 PDE4C-202ENST00000355502 5979 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
GTF2BQ00403 TSPAN3-201ENST00000267970 6467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
GTF2BQ00403 MANSC1-202ENST00000535902 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
GTF2BQ00403 TNRC18P2-201ENST00000417666 2714 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
GTF2BQ00403 RASGEF1A-204ENST00000395810 3235 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
GTF2BQ00403 TXNDC2-206ENST00000611534 2066 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
GTF2BQ00403 AC004922.1-201ENST00000638617 2430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
GTF2BQ00403 MIF4GD-208ENST00000579297 1419 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
GTF2BQ00403 ACOT7-210ENST00000608083 1403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
GTF2BQ00403 CDH7-203ENST00000536984 3766 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
GTF2BQ00403 RAD23B-201ENST00000358015 4119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
GTF2BQ00403 CYP4F22-201ENST00000269703 2641 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
GTF2BQ00403 GABARAPL2-201ENST00000037243 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
GTF2BQ00403 VCX3B-202ENST00000381032 1171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
GTF2BQ00403 CDRT15-201ENST00000420162 766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
GTF2BQ00403 CDRT15-202ENST00000431716 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
GTF2BQ00403 U91328.1-201ENST00000437528 223 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
GTF2BQ00403 HEBP2-202ENST00000448741 661 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
GTF2BQ00403 AP000552.1-208ENST00000452952 576 ntTSL 4 BASIC16.65■□□□□ 0.26
GTF2BQ00403 AL110118.2-203ENST00000557574 554 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.65■□□□□ 0.26
GTF2BQ00403 HIRIP3-204ENST00000564026 988 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
GTF2BQ00403 AC025279.2-201ENST00000569730 653 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
GTF2BQ00403 ANAPC11-215ENST00000578550 599 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
GTF2BQ00403 RPS15-202ENST00000585665 467 ntTSL 3 BASIC16.65■□□□□ 0.26
GTF2BQ00403 SCGB1C2-201ENST00000595228 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
GTF2BQ00403 SLC2A10-201ENST00000359271 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
GTF2BQ00403 PDRG1-201ENST00000202017 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
GTF2BQ00403 DUS2-207ENST00000565263 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
GTF2BQ00403 REC8-209ENST00000611366 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
GTF2BQ00403 C6orf106-203ENST00000374026 4232 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
GTF2BQ00403 SLC25A4-201ENST00000281456 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
GTF2BQ00403 NTMT1-204ENST00000372486 1487 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
GTF2BQ00403 TRA2A-202ENST00000392502 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
GTF2BQ00403 ATF7-205ENST00000548446 1892 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
GTF2BQ00403 SELPLG-201ENST00000228463 1704 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
GTF2BQ00403 PDS5A-201ENST00000303538 7176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
GTF2BQ00403 RPTOR-203ENST00000570891 2286 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
GTF2BQ00403 MYB-201ENST00000316528 3571 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.26
GTF2BQ00403 STRA6-218ENST00000574278 2455 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.26
GTF2BQ00403 MYB-241ENST00000616088 3573 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.26
GTF2BQ00403 MIIP-201ENST00000235332 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
GTF2BQ00403 SREBF1-201ENST00000261646 4178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
GTF2BQ00403 ADAM15-205ENST00000360674 2732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
GTF2BQ00403 UROC1-202ENST00000383579 2735 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
GTF2BQ00403 CALD1-222ENST00000495522 2199 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
GTF2BQ00403 LTBP2-205ENST00000556690 5614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
GTF2BQ00403 CCHCR1-208ENST00000451521 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
GTF2BQ00403 MUC1-228ENST00000620103 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
GTF2BQ00403 KCNMA1-251ENST00000639090 4319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
GTF2BQ00403 AL354813.1-201ENST00000526566 2437 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
GTF2BQ00403 TAOK2-203ENST00000416441 4780 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
GTF2BQ00403 FBXL19-204ENST00000471231 3641 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
GTF2BQ00403 CMA1-202ENST00000250378 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
GTF2BQ00403 AP000317.2-201ENST00000362077 641 ntTSL 3 BASIC16.64■□□□□ 0.25
GTF2BQ00403 PNRC1-203ENST00000369472 816 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
GTF2BQ00403 CYB5R3-203ENST00000402438 1050 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.1 ms