Protein–RNA interactions for Protein: P80075

CCL8, C-C motif chemokine 8, humanhuman

Predictions only

Length 99 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCL8P80075 IQCF3-202ENST00000440739 505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.02□□□□□ -0.33
CCL8P80075 AC115284.1-201ENST00000488257 547 ntTSL 4 BASIC13.02□□□□□ -0.33
CCL8P80075 AC106760.1-201ENST00000508690 800 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
CCL8P80075 AC136475.3-203ENST00000525217 617 ntTSL 2 BASIC13.02□□□□□ -0.33
CCL8P80075 OMP-201ENST00000529803 492 ntAPPRIS P1 BASIC13.02□□□□□ -0.33
CCL8P80075 AC021054.1-202ENST00000543884 599 ntTSL 3 BASIC13.02□□□□□ -0.33
CCL8P80075 GCHFR-204ENST00000559445 626 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
CCL8P80075 RORA-AS1-205ENST00000559824 761 ntTSL 3 BASIC13.02□□□□□ -0.33
CCL8P80075 AIPL1-204ENST00000570466 1196 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
CCL8P80075 AL359881.2-201ENST00000602973 570 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
CCL8P80075 MIR6805-201ENST00000615055 62 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
CCL8P80075 HADH-212ENST00000638621 741 ntTSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
CCL8P80075 KIAA1468-201ENST00000256858 5579 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
CCL8P80075 ROBO1-209ENST00000495273 5600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
CCL8P80075 MAPK7-204ENST00000395604 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
CCL8P80075 CTSW-201ENST00000307886 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
CCL8P80075 ENO3-206ENST00000519584 1322 ntTSL 2 BASIC13.02□□□□□ -0.33
CCL8P80075 TOB1-202ENST00000499247 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
CCL8P80075 DHPS-201ENST00000210060 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
CCL8P80075 AFG3L2-201ENST00000269143 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
CCL8P80075 ALG9-201ENST00000398006 2345 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
CCL8P80075 AIFM3-203ENST00000405089 2333 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.02□□□□□ -0.33
CCL8P80075 GDF5-201ENST00000374369 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
CCL8P80075 COL11A2-203ENST00000374708 6209 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
CCL8P80075 TMED7-TICAM2-202ENST00000333314 3453 ntTSL 2 BASIC13.02□□□□□ -0.33
CCL8P80075 PTPRU-201ENST00000345512 4470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
CCL8P80075 ANKK1-201ENST00000303941 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
CCL8P80075 PLIN3-202ENST00000585479 1535 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
CCL8P80075 RPS9-205ENST00000402367 1617 ntTSL 3 BASIC13.02□□□□□ -0.33
CCL8P80075 AL158070.2-201ENST00000623713 1621 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
CCL8P80075 RPTOR-201ENST00000306801 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
CCL8P80075 MAGEA9-201ENST00000243314 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
CCL8P80075 MUC1-228ENST00000620103 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
CCL8P80075 KDM5C-205ENST00000404049 5677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
CCL8P80075 SHMT2-232ENST00000557487 1918 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
CCL8P80075 TMA16-201ENST00000358572 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
CCL8P80075 CEACAM19-202ENST00000403660 1982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
CCL8P80075 TBC1D17-202ENST00000535102 2025 ntTSL 2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
CCL8P80075 LCK-206ENST00000373564 2137 ntTSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
CCL8P80075 CNOT8-202ENST00000403027 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
CCL8P80075 SPRY1-207ENST00000610581 2608 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.01□□□□□ -0.33
CCL8P80075 ST7L-202ENST00000358039 4528 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
CCL8P80075 ZNF70-201ENST00000341976 6924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
CCL8P80075 COL17A1-201ENST00000353479 5734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
CCL8P80075 RAB41-201ENST00000276066 1071 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
CCL8P80075 CACNG5-201ENST00000307139 926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
CCL8P80075 RNU1-114P-201ENST00000365297 166 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
CCL8P80075 RAB41-202ENST00000374473 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
CCL8P80075 PFDN6-202ENST00000374607 598 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
CCL8P80075 PFDN6-203ENST00000374610 521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
CCL8P80075 PGGT1BP2-201ENST00000398621 1028 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
CCL8P80075 BOLA2P3-201ENST00000404566 256 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
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CCL8P80075 TPD52L1-214ENST00000534199 811 ntTSL 2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
CCL8P80075 SAMD11P1-201ENST00000571429 661 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
CCL8P80075 AC092506.1-204ENST00000634888 1066 ntTSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
CCL8P80075 GLI2-210ENST00000452319 6799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
CCL8P80075 FBLN7-203ENST00000409450 1394 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
CCL8P80075 CYB561D2-202ENST00000418577 1533 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
CCL8P80075 PDIA3P1-201ENST00000471856 1510 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
CCL8P80075 CPEB3-201ENST00000265997 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
CCL8P80075 TMEM169-204ENST00000437356 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
CCL8P80075 SNPH-202ENST00000381873 4995 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
CCL8P80075 SLCO4C1-201ENST00000310954 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
CCL8P80075 AC007182.1-201ENST00000455232 2159 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
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CCL8P80075 C7orf31-201ENST00000283905 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
CCL8P80075 TLE3-202ENST00000440567 2657 ntTSL 2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
CCL8P80075 TLE4-204ENST00000376537 2793 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
CCL8P80075 STBD1-201ENST00000237642 3420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
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CCL8P80075 TMEM119-201ENST00000392806 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
CCL8P80075 TSKU-205ENST00000612930 2666 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC13□□□□□ -0.33
CCL8P80075 NEDD1-213ENST00000557644 2367 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
CCL8P80075 ABR-203ENST00000536794 2213 ntTSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
CCL8P80075 HNRNPF-201ENST00000337970 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
CCL8P80075 ABHD18-202ENST00000398965 2177 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
CCL8P80075 ADAM15-208ENST00000447332 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
CCL8P80075 CRY2-201ENST00000417225 2053 ntTSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
CCL8P80075 CHRFAM7A-203ENST00000401522 1913 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
CCL8P80075 AP001122.1-202ENST00000501648 1916 ntTSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
CCL8P80075 MUTYH-206ENST00000372115 1888 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
CCL8P80075 TSSK2-201ENST00000399635 1816 ntAPPRIS P1 BASIC13□□□□□ -0.33
CCL8P80075 GTF3C4-201ENST00000372146 9043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
CCL8P80075 NKIRAS1-203ENST00000415901 1644 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
CCL8P80075 CNPY4-201ENST00000262932 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
CCL8P80075 KLHDC3-203ENST00000332245 1494 ntTSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
CCL8P80075 GOLGA6L2-201ENST00000312015 1379 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
CCL8P80075 RNASE1-202ENST00000397967 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
CCL8P80075 KRT8P35-201ENST00000483942 1338 ntBASIC13□□□□□ -0.33
CCL8P80075 AC093525.8-201ENST00000624099 1342 ntBASIC13□□□□□ -0.33
CCL8P80075 TSPO-202ENST00000337554 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
CCL8P80075 NAA10-201ENST00000370009 837 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
CCL8P80075 NAA10-203ENST00000370015 1002 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
CCL8P80075 MIR1909-201ENST00000411312 80 ntBASIC13□□□□□ -0.33
CCL8P80075 KIF9-205ENST00000432493 633 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
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