Protein–RNA interactions for Protein: P61247

RPS3A, 40S ribosomal protein S3a, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 264 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPS3AP61247 CD1E-212ENST00000368167 1458 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
RPS3AP61247 ANKRD2-203ENST00000370655 1451 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
RPS3AP61247 PROZ-202ENST00000375547 1488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
RPS3AP61247 AL023775.1-201ENST00000454907 1746 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
RPS3AP61247 ZNF324-201ENST00000196482 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
RPS3AP61247 CD6-201ENST00000313421 3252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
RPS3AP61247 TCAF1P1-201ENST00000414990 2232 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
RPS3AP61247 FAM84A-201ENST00000295092 6355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
RPS3AP61247 DBN1-203ENST00000393565 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
RPS3AP61247 DTD2-202ENST00000356180 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
RPS3AP61247 INPP5B-204ENST00000373026 3230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
RPS3AP61247 APBB2-204ENST00000502841 1681 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
RPS3AP61247 AC092127.1-201ENST00000567093 3455 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
RPS3AP61247 ITGAV-201ENST00000261023 7030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
RPS3AP61247 C9orf139-202ENST00000623196 4990 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
RPS3AP61247 PTPA-205ENST00000357197 2653 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
RPS3AP61247 CEP131-208ENST00000575907 3444 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
RPS3AP61247 MPL-202ENST00000413998 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
RPS3AP61247 HTR3E-202ENST00000415389 2139 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
RPS3AP61247 DSN1-207ENST00000448110 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
RPS3AP61247 PUS1-202ENST00000376649 4094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
RPS3AP61247 KIF26B-202ENST00000407071 7287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
RPS3AP61247 XG-201ENST00000381174 2315 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
RPS3AP61247 HARS2-206ENST00000508522 1562 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
RPS3AP61247 USP19-205ENST00000398898 4474 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
RPS3AP61247 RAD51C-215ENST00000583539 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
RPS3AP61247 CPEB3-201ENST00000265997 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
RPS3AP61247 RNPS1-223ENST00000568631 1792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
RPS3AP61247 GPI-205ENST00000586425 1799 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
RPS3AP61247 ASAH1-240ENST00000636997 1774 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
RPS3AP61247 RUNX3-201ENST00000308873 3861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
RPS3AP61247 CNDP1-201ENST00000358821 2215 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
RPS3AP61247 AC099521.3-201ENST00000624251 2938 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
RPS3AP61247 CLEC1B-201ENST00000298527 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
RPS3AP61247 NUDT4P1-201ENST00000322209 1206 ntAPPRIS P1 BASIC14.48□□□□□ -0.09
RPS3AP61247 ZUFSP-201ENST00000368573 1225 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
RPS3AP61247 HNRNPA3P1-201ENST00000401429 1139 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
RPS3AP61247 C2orf76-202ENST00000409466 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
RPS3AP61247 RCAN3-204ENST00000425530 997 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
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RPS3AP61247 AC002310.2-201ENST00000486926 950 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
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RPS3AP61247 TMSB15B-204ENST00000540220 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
RPS3AP61247 TOMM5-205ENST00000544379 635 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
RPS3AP61247 AL079307.3-201ENST00000556114 283 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
RPS3AP61247 AL162231.3-201ENST00000556278 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
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RPS3AP61247 RAB3D-202ENST00000589655 924 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
RPS3AP61247 RCAN3-211ENST00000630217 658 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
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RPS3AP61247 OPRL1-201ENST00000336866 3321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
RPS3AP61247 ALDH3B2-201ENST00000349015 2649 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
RPS3AP61247 IRF4-201ENST00000380956 5331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
RPS3AP61247 COX10-AS1-202ENST00000449363 1944 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
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RPS3AP61247 C15orf52-206ENST00000559313 3022 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
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RPS3AP61247 UCP2-201ENST00000310473 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
RPS3AP61247 MLX-202ENST00000346833 2334 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
RPS3AP61247 ACSM2B-207ENST00000565232 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
RPS3AP61247 PLA2G2D-202ENST00000617227 1856 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
RPS3AP61247 KMT2E-201ENST00000257745 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
RPS3AP61247 AC100757.3-201ENST00000622361 1406 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
RPS3AP61247 CGB7-203ENST00000597853 3386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
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RPS3AP61247 BTN1A1-201ENST00000244513 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
RPS3AP61247 FUNDC2-201ENST00000369498 6455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
RPS3AP61247 CCNY-201ENST00000265375 4768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
RPS3AP61247 HNRNPH1-204ENST00000442819 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
RPS3AP61247 PHTF1-204ENST00000369604 3273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
RPS3AP61247 PRRT2-207ENST00000572820 2403 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
RPS3AP61247 APBB1-202ENST00000311051 2619 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
RPS3AP61247 HMOX2-205ENST00000458134 1797 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
RPS3AP61247 IQCE-201ENST00000325979 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
RPS3AP61247 CCNL1-202ENST00000295926 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
RPS3AP61247 WDR77-201ENST00000235090 2576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
RPS3AP61247 XRCC3-211ENST00000555055 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
RPS3AP61247 WDR24-201ENST00000248142 2763 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
RPS3AP61247 AC022400.6-201ENST00000603027 5818 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
RPS3AP61247 IL1RN-202ENST00000354115 1747 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
RPS3AP61247 GPS1-227ENST00000623761 1943 ntTSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
RPS3AP61247 CDK5RAP2-202ENST00000360190 5985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
RPS3AP61247 AL354714.1-201ENST00000356006 2136 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
RPS3AP61247 OPA1-203ENST00000361715 6384 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
RPS3AP61247 LETMD1-203ENST00000418425 2123 ntTSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
RPS3AP61247 KCNH6-202ENST00000456941 2928 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
RPS3AP61247 UBQLN1-202ENST00000376395 4118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
RPS3AP61247 RBM26-203ENST00000438737 4132 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
RPS3AP61247 BNIP3-201ENST00000368636 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
RPS3AP61247 AC105250.1-201ENST00000509378 2057 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
RPS3AP61247 PIGT-201ENST00000279035 1880 ntTSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
RPS3AP61247 GMNN-201ENST00000230056 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
RPS3AP61247 USE1-201ENST00000263897 843 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
RPS3AP61247 NBL1-201ENST00000289749 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
RPS3AP61247 EIF5A-201ENST00000336452 1256 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
RPS3AP61247 CHIA-203ENST00000353665 1214 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
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