Protein–RNA interactions for Protein: P58499

FAM3B, Protein FAM3B, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 235 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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FAM3BP58499 PAPSS2-202ENST00000456849 3856 ntTSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
FAM3BP58499 AP4B1-201ENST00000256658 2742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
FAM3BP58499 RHCE-201ENST00000294413 1591 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
FAM3BP58499 DMAP1-201ENST00000315913 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
FAM3BP58499 HPSE-206ENST00000512196 1571 ntTSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
FAM3BP58499 AC073957.2-201ENST00000549241 1562 ntTSL 4 BASIC12.06□□□□□ -0.48
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FAM3BP58499 RAB6C-201ENST00000410061 3075 ntAPPRIS P1 BASIC12.06□□□□□ -0.48
FAM3BP58499 GRIN1-206ENST00000371559 3577 ntTSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
FAM3BP58499 CYBA-210ENST00000569359 1415 ntTSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
FAM3BP58499 STK26-202ENST00000394334 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
FAM3BP58499 MKNK1-203ENST00000371945 2618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
FAM3BP58499 YBEY-201ENST00000329319 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
FAM3BP58499 S100A16-204ENST00000368706 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
FAM3BP58499 YBEY-206ENST00000397701 744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.06□□□□□ -0.48
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FAM3BP58499 SNHG11-206ENST00000432153 1181 ntTSL 3 BASIC12.06□□□□□ -0.48
FAM3BP58499 AC134772.1-202ENST00000435578 549 ntTSL 4 BASIC12.06□□□□□ -0.48
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FAM3BP58499 LMX1B-203ENST00000526117 1195 ntTSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
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FAM3BP58499 RPL18-208ENST00000549920 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
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FAM3BP58499 RPL18-209ENST00000550645 463 ntTSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
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FAM3BP58499 L2HGDH-205ENST00000555423 841 ntTSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
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FAM3BP58499 WASHC5-202ENST00000517845 3667 ntTSL 2 BASIC12.06□□□□□ -0.48
FAM3BP58499 TMEM86B-201ENST00000327042 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
FAM3BP58499 CCDC180-210ENST00000529487 5242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
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FAM3BP58499 EHMT2-204ENST00000395728 4129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
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FAM3BP58499 GRM1-204ENST00000492807 6836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
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FAM3BP58499 LINC00691-201ENST00000432505 2232 ntTSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
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FAM3BP58499 HDAC8-209ENST00000373589 1740 ntTSL 2 BASIC12.06□□□□□ -0.48
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FAM3BP58499 COL22A1-201ENST00000303045 6346 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
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FAM3BP58499 TRIM13-202ENST00000378182 7249 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
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FAM3BP58499 DHTKD1-201ENST00000263035 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
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FAM3BP58499 LAMTOR5-206ENST00000602318 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
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FAM3BP58499 RAP1GAP-211ENST00000495204 2489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
FAM3BP58499 AJUBA-201ENST00000262713 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
FAM3BP58499 MLX-202ENST00000346833 2334 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
FAM3BP58499 RPN2-202ENST00000373622 2348 ntTSL 2 BASIC12.05□□□□□ -0.48
FAM3BP58499 AC113367.3-201ENST00000508316 1912 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
FAM3BP58499 OSR2-209ENST00000522510 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.05□□□□□ -0.48
FAM3BP58499 C11orf68-203ENST00000530188 1528 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.05□□□□□ -0.48
FAM3BP58499 CLCN7-203ENST00000448525 4151 ntTSL 2 BASIC12.05□□□□□ -0.48
FAM3BP58499 ISCU-205ENST00000535729 1330 ntTSL 2 BASIC12.05□□□□□ -0.48
FAM3BP58499 REV3L-207ENST00000435970 10943 ntTSL 2 BASIC12.05□□□□□ -0.48
FAM3BP58499 CBX6-201ENST00000216083 3191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.05□□□□□ -0.48
FAM3BP58499 GDAP1L1-207ENST00000612599 2585 ntTSL 3 BASIC12.05□□□□□ -0.48
FAM3BP58499 SMARCA2-208ENST00000382194 5679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
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