Protein–RNA interactions for Protein: P57739

CLDN2, Claudin-2, humanhuman

Predictions only

Length 230 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLDN2P57739 PLIN3-202ENST00000585479 1535 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CLDN2P57739 PRKD2-214ENST00000600194 2923 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CLDN2P57739 SERTAD4-201ENST00000367012 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CLDN2P57739 COX6A2-201ENST00000287490 440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CLDN2P57739 CCDC88B-201ENST00000301897 870 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CLDN2P57739 LONRF3-201ENST00000304778 2989 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CLDN2P57739 NOL4L-202ENST00000326071 701 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CLDN2P57739 C1orf43-205ENST00000368519 1163 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CLDN2P57739 RHOC-206ENST00000369637 888 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CLDN2P57739 C10orf62-201ENST00000370640 1208 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CLDN2P57739 PRTFDC1-203ENST00000376378 747 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CLDN2P57739 BTBD6P1-201ENST00000412176 1267 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
CLDN2P57739 DYNC1I1-203ENST00000413338 958 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CLDN2P57739 AC007969.1-201ENST00000433675 447 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
CLDN2P57739 ZNF767P-206ENST00000513792 565 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
CLDN2P57739 GTF2H2C-215ENST00000514162 610 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CLDN2P57739 AC022616.1-201ENST00000518688 554 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
CLDN2P57739 AF111167.2-202ENST00000558267 599 ntTSL 4 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CLDN2P57739 IGHV3OR16-9-202ENST00000558425 288 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CLDN2P57739 C2orf69P2-201ENST00000562032 1123 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
CLDN2P57739 CRISPLD2-210ENST00000569090 808 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CLDN2P57739 IFT20-214ENST00000585089 1071 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CLDN2P57739 KLK3-211ENST00000597483 810 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CLDN2P57739 PRKN-211ENST00000615065 261 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CLDN2P57739 PUF60-208ENST00000526683 2412 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CLDN2P57739 PGAP2-205ENST00000396993 1566 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CLDN2P57739 MASTL-203ENST00000375946 3623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CLDN2P57739 SALL4-203ENST00000395997 1918 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CLDN2P57739 COX10-AS1-202ENST00000449363 1944 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CLDN2P57739 POLR1D-212ENST00000630983 1931 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CLDN2P57739 ZC2HC1C-201ENST00000238686 2249 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CLDN2P57739 CAMLG-201ENST00000297156 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CLDN2P57739 ZNF786-202ENST00000491431 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CLDN2P57739 AL157414.3-201ENST00000624276 1954 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
CLDN2P57739 DUOX1-202ENST00000389037 5483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CLDN2P57739 GLG1-202ENST00000422840 4748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
CLDN2P57739 PRSS54-201ENST00000219301 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
CLDN2P57739 MAEL-201ENST00000367870 1831 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
CLDN2P57739 LINC00391-201ENST00000433569 1844 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
CLDN2P57739 SUCLA2-201ENST00000378654 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
CLDN2P57739 SNRPN-202ENST00000390687 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
CLDN2P57739 C19orf68-203ENST00000614654 3588 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
CLDN2P57739 STK33-217ENST00000534493 1895 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
CLDN2P57739 FUT7-201ENST00000314412 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CLDN2P57739 LMF2-202ENST00000474879 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CLDN2P57739 TVP23C-203ENST00000428082 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CLDN2P57739 PIK3R6-203ENST00000614407 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CLDN2P57739 CNKSR1-214ENST00000531191 2673 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
CLDN2P57739 KRT23-201ENST00000209718 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CLDN2P57739 ZC3H7B-201ENST00000352645 5909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CLDN2P57739 RUSC1-203ENST00000368349 1968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CLDN2P57739 NOMO2-203ENST00000543392 3765 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CLDN2P57739 AMZ2P1-202ENST00000430983 3425 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
CLDN2P57739 TPCN1-201ENST00000335509 5274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CLDN2P57739 CBY1-201ENST00000216029 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CLDN2P57739 B9D1-201ENST00000261499 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CLDN2P57739 GTSF1-201ENST00000305879 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CLDN2P57739 RAB4B-201ENST00000357052 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CLDN2P57739 UROS-203ENST00000368786 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CLDN2P57739 CSAG1-202ENST00000370287 875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CLDN2P57739 IGHV3-53-201ENST00000390627 571 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
CLDN2P57739 B9D1-203ENST00000395615 805 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
CLDN2P57739 SAP30L-202ENST00000426761 777 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
CLDN2P57739 AC104306.2-201ENST00000451877 341 ntBASIC15.08■□□□□ 0
CLDN2P57739 MIR3615-201ENST00000581999 87 ntBASIC15.08■□□□□ 0
CLDN2P57739 TUBB6-210ENST00000590967 430 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
CLDN2P57739 SCN1B-204ENST00000596348 1176 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
CLDN2P57739 AL162727.3-201ENST00000635661 2787 ntBASIC15.08■□□□□ 0
CLDN2P57739 GEMIN7-201ENST00000270257 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CLDN2P57739 NRXN1-229ENST00000628515 3243 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
CLDN2P57739 IMPDH1-202ENST00000348127 2479 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CLDN2P57739 LGR6-205ENST00000439764 2487 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CLDN2P57739 GHRLOS-201ENST00000439539 1708 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CLDN2P57739 GTF3C5-204ENST00000372108 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CLDN2P57739 AL512625.1-201ENST00000305709 2541 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CLDN2P57739 KRT32-201ENST00000225899 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CLDN2P57739 SUMO3-203ENST00000397898 1779 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
CLDN2P57739 KLHL36-204ENST00000564996 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CLDN2P57739 TDRKH-204ENST00000368825 2651 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
CLDN2P57739 USP42-201ENST00000306177 5155 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
CLDN2P57739 SLC2A9-201ENST00000264784 1850 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CLDN2P57739 MYB-201ENST00000316528 3571 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
CLDN2P57739 MYB-241ENST00000616088 3573 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
CLDN2P57739 GPSM3-207ENST00000375043 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CLDN2P57739 CATSPER2P1-203ENST00000429276 1466 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
CLDN2P57739 KIAA1217-206ENST00000376462 6123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CLDN2P57739 ALG9-201ENST00000398006 2345 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CLDN2P57739 HSPA12B-201ENST00000254963 3151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CLDN2P57739 CBX7-201ENST00000216133 4081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CLDN2P57739 FRS2-206ENST00000549921 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CLDN2P57739 COL2A1-202ENST00000380518 5071 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CLDN2P57739 TUBA8-202ENST00000330423 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CLDN2P57739 LINC02273-201ENST00000499452 1592 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CLDN2P57739 ZNF764-202ENST00000395091 2970 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
CLDN2P57739 ASPH-202ENST00000379449 1603 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CLDN2P57739 SLK-201ENST00000335753 7673 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CLDN2P57739 MST1L-201ENST00000442552 2185 ntBASIC15.07■□□□□ 0
CLDN2P57739 USP37-202ENST00000338465 1771 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CLDN2P57739 ATG10-203ENST00000458350 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CLDN2P57739 AC055811.4-201ENST00000624039 1754 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.9 ms