Protein–RNA interactions for Protein: P55735

SEC13, Protein SEC13 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 322 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEC13P55735 MAP2K7-201ENST00000397979 3361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SEC13P55735 INA-201ENST00000369849 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SEC13P55735 PMS1-212ENST00000432292 3234 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SEC13P55735 PMS1-213ENST00000441310 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SEC13P55735 AL121845.3-201ENST00000490623 3119 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SEC13P55735 COL26A1-201ENST00000313669 3033 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SEC13P55735 AC084018.2-201ENST00000613093 2607 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
SEC13P55735 ORMDL3-204ENST00000579695 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SEC13P55735 PYROXD2-201ENST00000370575 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SEC13P55735 TVP23C-203ENST00000428082 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SEC13P55735 GPS1-227ENST00000623761 1943 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SEC13P55735 SEC14L4-204ENST00000381982 1603 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SEC13P55735 AC068831.1-204ENST00000501381 1621 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SEC13P55735 SLC44A1-203ENST00000374724 3088 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SEC13P55735 NEUROD1-201ENST00000295108 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SEC13P55735 TACC3-201ENST00000313288 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SEC13P55735 TDRKH-204ENST00000368825 2651 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SEC13P55735 POLR3H-202ENST00000355209 4416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SEC13P55735 CARNMT1-202ENST00000376834 4130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SEC13P55735 NSUN2-201ENST00000264670 3303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SEC13P55735 SH2D6-202ENST00000389938 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SEC13P55735 TMUB2-204ENST00000538716 1953 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SEC13P55735 EIF4G1-202ENST00000346169 5516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SEC13P55735 GJB6-202ENST00000356192 2131 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SEC13P55735 CPLX2-202ENST00000393745 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SEC13P55735 C9orf116-205ENST00000429260 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SEC13P55735 RPL23A-206ENST00000496182 636 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SEC13P55735 AC129492.3-201ENST00000498285 460 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SEC13P55735 MAX-211ENST00000555667 574 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SEC13P55735 AC106820.3-201ENST00000561653 397 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
SEC13P55735 STPG3-204ENST00000611378 1015 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SEC13P55735 HPSE2-205ENST00000614306 447 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SEC13P55735 AC044839.1-204ENST00000634777 1058 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SEC13P55735 PRRC2B-210ENST00000638390 1084 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SEC13P55735 ZNF711-201ENST00000276123 2887 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SEC13P55735 ACSL1-208ENST00000507295 2490 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SEC13P55735 PTPN5-204ENST00000396170 3871 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SEC13P55735 POLD3-208ENST00000532497 1700 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SEC13P55735 TSPAN17-209ENST00000515708 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SEC13P55735 ARL8B-201ENST00000256496 3005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SEC13P55735 SIGLEC8-203ENST00000430817 1528 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SEC13P55735 PDHB-206ENST00000474765 1503 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SEC13P55735 TRIM14-201ENST00000341469 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SEC13P55735 NKX3-1-201ENST00000380871 3271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SEC13P55735 AL157414.3-201ENST00000624276 1954 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
SEC13P55735 FBXO18-203ENST00000397269 3640 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SEC13P55735 IRF2BP2-202ENST00000366610 4615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SEC13P55735 ZNF672-201ENST00000306562 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SEC13P55735 RFPL2-203ENST00000400237 2407 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SEC13P55735 RAB1A-203ENST00000409784 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SEC13P55735 CELF4-202ENST00000361795 1853 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SEC13P55735 DOK3-203ENST00000377112 1884 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SEC13P55735 INTS11-203ENST00000419704 1798 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SEC13P55735 CMTM3-203ENST00000460097 1797 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SEC13P55735 ZNF514-202ENST00000411425 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SEC13P55735 SLITRK2-202ENST00000370490 7672 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SEC13P55735 PER1-201ENST00000317276 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SEC13P55735 BCAT2-202ENST00000402551 2041 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SEC13P55735 PIK3IP1-203ENST00000441972 2374 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SEC13P55735 PLD3-201ENST00000356508 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SEC13P55735 AL136309.2-201ENST00000427049 2277 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SEC13P55735 CARMIL3-201ENST00000342740 4597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SEC13P55735 CCDC144B-202ENST00000445752 2197 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SEC13P55735 GHRLOS-201ENST00000439539 1708 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SEC13P55735 TC2N-201ENST00000340892 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SEC13P55735 LINC00200-201ENST00000425630 2434 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SEC13P55735 GSTT2B-201ENST00000290765 1099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SEC13P55735 BOLA3-201ENST00000295326 444 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SEC13P55735 AKIP1-201ENST00000299576 1247 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SEC13P55735 CLRN1-203ENST00000328863 738 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SEC13P55735 AL662890.1-201ENST00000396818 632 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
SEC13P55735 DSCR3-204ENST00000399001 821 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SEC13P55735 AC092506.1-202ENST00000401022 528 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
SEC13P55735 AC106786.1-201ENST00000442777 792 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SEC13P55735 RPL35A-205ENST00000448864 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SEC13P55735 YIF1A-210ENST00000496746 667 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SEC13P55735 AC100850.1-201ENST00000506768 649 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
SEC13P55735 PAX5-211ENST00000522003 1019 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SEC13P55735 NCK2-206ENST00000522586 490 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SEC13P55735 AC110285.3-201ENST00000574472 665 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SEC13P55735 C17orf50-202ENST00000604830 477 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SEC13P55735 AL137026.1-201ENST00000624407 503 ntTSL 4 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SEC13P55735 LINC02536-201ENST00000625799 625 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SEC13P55735 CNBP-208ENST00000504813 1549 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SEC13P55735 P2RX5-208ENST00000552050 1536 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SEC13P55735 MAP4K5-201ENST00000013125 4354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SEC13P55735 TGFB1I1-214ENST00000567607 1770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SEC13P55735 FGR-202ENST00000374004 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SEC13P55735 FKBP6-204ENST00000431982 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SEC13P55735 ESRRB-207ENST00000556177 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SEC13P55735 PCDHB19P-201ENST00000570871 2371 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
SEC13P55735 COL26A1-203ENST00000613501 2970 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SEC13P55735 TSHZ1-204ENST00000580243 3582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SEC13P55735 RAPSN-201ENST00000298854 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SEC13P55735 ACRBP-201ENST00000229243 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SEC13P55735 CLUHP2-201ENST00000426660 1303 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
SEC13P55735 NPNT-201ENST00000305572 3003 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SEC13P55735 CHSY3-201ENST00000305031 3850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SEC13P55735 UNC5D-203ENST00000416672 3532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SEC13P55735 PMP22-201ENST00000312280 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41 ms